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[发明专利]一种蛋白质结构的预测方法及相关装置-CN202310400042.3在审
发明人：刘思睿;楚浩田;倪宁曦;高毅勤;王紫东;韦佳辰;谢豫豪;牟方菁;李俊彬;王程浩 -专利权人：北京昌平实验室;华为技术有限公司
申请日： 2023-04-13 - 公布日： 2023-09-01 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：一种蛋白质结构的预测方法，应用于人工智能技术领域。在该方法中，通过基于对蛋白质结构进行检测得到的实验数据，提取得到蛋白质结构的约束信息，该约束信息能够指示蛋白质在结构上所满足的约束关系，并将约束信息和蛋白质的氨基酸序列共同作为神经网络模型的输入，执行蛋白质结构的预测，能够实现利用约束信息辅助模型预测蛋白质结构，提高模型预测得到的蛋白质结构的精度。并且，由于本方案是通过模型来实现蛋白质结构的预测，无需人工参与，能够有效地提高蛋白质结构预测的效率。
一种蛋白质结构预测方法相关装置

[发明专利]分步提取水牛精子蛋白质的方法-CN201510148412.4在审
发明人：付强;张明;官俊良;黄德伦;陈富美 -专利权人：广西大学
申请日： 2015-03-31 - 公布日： 2015-07-08 - 主分类号： C07K1/14 文献下载
摘要：本发明公开了一种分步提取水牛精子蛋白质的方法，采用三种裂解液分三步依次裂解精子细胞，达到对高、中、低亲水性蛋白质分步溶解的效果。将三次裂解后获得的上清混合，即得水牛精子的总蛋白质。本发明提取效率高、降解少、分离稳定度高、费用低，可以替代传统的蛋白质一步提取法，弥补了一步法中蛋白质提取不完全的缺陷，实现精子不同疏水性蛋白质和极端理化性质的蛋白质全部提取，达到呈现更多蛋白质信息的目的，解决了精子蛋白质制备问题。该法获得的总蛋白质适合双向电泳分析，经双向电泳技术对三步法获得的蛋白质进行图谱分析发现，该法提取的蛋白质呈现更多，拖尾少。
分步提取水牛精子蛋白质方法

[发明专利]一种去除淀粉浆料中蛋白质的方法-CN202010581671.7在审
发明人：范雪荣;张寻;高卫东;袁久刚;徐进;王强 -专利权人：江南大学
申请日： 2020-06-23 - 公布日： 2020-08-28 - 主分类号： D06M15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种去除淀粉浆料中蛋白质的方法，属于纺织浆料技术领域。所述方法是先采用还原剂处理淀粉浆料，以破坏淀粉颗粒表面及内部的蛋白质结构，增加蛋白质的溶解性；再采用有机溶剂处理淀粉浆料。本发明通过利用亚硫酸氢钠的还原作用，切割蛋白质亚基之间的二硫键，破坏蛋白质的三维网络结构，以破坏淀粉颗粒表面及内部的蛋白质结构，增加蛋白质的溶解性，并削弱蛋白质与蛋白质的相互作用，然后使用乙醇溶液溶解将变性后的蛋白质溶解，最后经过洗涤可去除淀粉中的蛋白质。经过此方法处理的淀粉，蛋白质含量由0.52％降低到0.16％及以下，较单独亚硫酸氢钠处理和单独乙醇处理的效果之和更优越。
一种去除淀粉浆料蛋白质方法

[发明专利]一种基于深度残差神经网络的蛋白质残基接触图预测方法-CN202010461169.2在审
发明人：胡俊;樊学强;郑琳琳;白岩松;张贵军 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2020-05-27 - 公布日： 2020-09-15 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：一种基于深度残差神经网络的蛋白质残基接触图预测方法，首先，输入待进行蛋白质残基接触图预测的蛋白质序列；然后，对蛋白质序列利用20种常见氨基酸的one‑hot表示形式将蛋白质序列转换成一个20×L的矩阵，把蛋白质序列信息数字化，利用20×L的矩阵计算得到20×L×L的协方差张量，即输入网络的特征；其次，搭建深度残差神经网络框架，从PDB库中收集已有蛋白质接触标签的蛋白质序列和标签，计算蛋白质序列的特征张量，与对应的标签组成数据集，使用深度残差神经网络框架在数据集上学习预测模型；最后，将待进行蛋白质残基接触图预测的蛋白质特征张量输入模型，则得到该蛋白质序列残基接触图。
一种基于深度神经网络蛋白质残基接触预测方法

[发明专利]一种蛋白质性能预测方法、装置和计算设备-CN202010358971.9在审
发明人：王天元;翟珂;赖力鹏;温书豪;马健 -专利权人：北京晶派科技有限公司
申请日： 2020-04-29 - 公布日： 2020-07-10 - 主分类号： G06N3/04 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白质性能预测方法，适于在计算设备中执行，计算设备包括蛋白质性质预测模型，该模型包括相互耦接的蛋白质序列特征模型和预测模型，蛋白质序列特征模型基于输入的三肽词汇序列输出对应的语义特征向量，预测模型基于语义特征向量输出蛋白质序列的性能属性，该方法包括步骤：获取待处理的目标蛋白质序列；以三肽为最小单位对目标蛋白质序列进行切分，并删除其中的二肽和离散的单个氨基酸，得到三肽词汇序列；利用蛋白质性能预测模型对目标蛋白质序列的三肽词汇序列进行处理，以得到该目标蛋白质序列的特征向量后，进而得到该特征向量所对应的蛋白质性能属性。本发明还一并公开了对应的蛋白质性能预测装置和计算设备。
一种蛋白质性能预测方法装置计算设备

[发明专利]一种基于进化算法和模糊聚类的蛋白质功能模块识别方法-CN202111552679.1在审
发明人：田野;胡佳星;司朗春;张兴义 -专利权人：安徽大学
申请日： 2021-12-17 - 公布日： 2022-03-25 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于进化算法和模糊聚类的蛋白质功能模块识别方法，其步骤包括：步骤一、基于蛋白质网络的属性初始化种群，使用进化算法优化两目标问题，寻找非重叠的蛋白质模块的最优核心蛋白质节点，从而完成非重叠的蛋白质功能模块识别；步骤二、基于步骤一得到的核心蛋白质节点，初始化子种群，并用进化算法优化新的两目标问题，确定非核心蛋白质节点的最优模糊阈值，从而完成重叠的蛋白质功能模块识别。本发明能在不预定任何参数的情况下，自适应处理不同类型的蛋白质网络结构，从而提高蛋白质功能模块识别过程的稳定性，并且在蛋白质网络中找到较多有效的蛋白质功能模块的最优划分结果。
一种基于进化算法模糊蛋白质功能模块识别方法

[发明专利]蛋白质构象预测方法、装置、电子设备及存储介质-CN202011438019.6在审
发明人：裴建国;许振雷;刘雨一;叶菲;刘伟;王晟;郑良振;黎浩添;黄俊洲;沈涛 -专利权人：腾讯科技（深圳）有限公司
申请日： 2020-12-07 - 公布日： 2022-06-10 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本申请实施例公开了一种蛋白质构象预测方法、装置、电子设备及存储介质，涉及人工智能技术在生物医学领域的应用。该方法包括：获取目标蛋白质序列对应的M个候选蛋白质构象；基于N种蛋白质排序规则，对所述M个候选蛋白质构象进行预排序，获得所述M个候选蛋白质构象对应的N种预排序结果；基于融合排序规则，对所述N种预排序结果进行处理，得到所述M个候选蛋白质构象对应的目标排序结果；根据所述目标排序结果，确定所述目标蛋白质序列对应的预测蛋白质构象。该方法可以综合多种蛋白质排序规则的不同排序方法，避免传统工具排序稳定性差问题，使得在各种蛋白质结构上，都能够有较好的预测准确性，进而提高了预测的蛋白质构象整体准确性。
蛋白质构象预测方法装置电子设备存储介质

[发明专利]RNA-蛋白质相互作用预测方法、装置、介质及电子设备-CN202180002692.1在审
发明人：张春会;张振中 -专利权人：京东方科技集团股份有限公司
申请日： 2021-09-27 - 公布日： 2023-07-25 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：一种RNA‑蛋白质相互作用预测方法、装置、介质及电子设备；涉及人工智能技术领域。所述方法包括：获取待预测的RNA‑蛋白质对(S210)；对所述待预测的RNA‑蛋白质对进行特征提取，得到所述待预测的RNA‑蛋白质对的序列特征(S220)；向量化所述待预测的RNA‑蛋白质对，得到所述待预测的RNA‑蛋白质对中的RNA序列表示向量和蛋白质序列表示向量(S230)；基于所述待预测的RNA‑蛋白质对的序列特征、待预测的RNA‑蛋白质对中的RNA序列表示向量和蛋白质序列表示向量，使用多个相互作用预测模型分别得到所述待预测的RNA‑蛋白质对的多个相互作用预测值(S240)；根据所述多个相互作用预测值确定所述RNA和蛋白质之间的相互作用(S250)。
rna 蛋白质相互作用预测方法装置介质电子设备

[发明专利]蛋白质和疾病关联关系的确定方法、装置、设备及介质-CN202310781566.1在审
发明人：刘小双 -专利权人：平安科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-06-28 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本申请涉及医疗健康技术领域，揭示了一种蛋白质和疾病关联关系的确定方法、装置、设备及介质，其中方法包括：获取已知蛋白质与疾病关联关系矩阵、疾病相似性矩阵和蛋白质相互作用关系矩阵；根据所述已知蛋白质与疾病关联关系矩阵、所述疾病相似性矩阵和所述蛋白质相互作用关系矩阵进行蛋白质与疾病之间的关联关系的预测，得到目标蛋白质与疾病关联关系矩阵。从而实现在较少的数据下稳定有效地预测了潜在的与疾病有关的蛋白质；整个预测过程结合了蛋白质与蛋白质之间的相互作用关系、疾病与疾病之间的相似性、已知的蛋白质与疾病之间的关联关系，从而提高了预测得到的目标蛋白质与疾病关联关系矩阵的准确性
蛋白质疾病关联关系确定方法装置设备介质

[发明专利]基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法-CN202310925090.4在审
发明人：陈华钧;秦铭;张强;丁科炎;吴槟;王泽元 -专利权人：浙江大学
申请日： 2023-07-26 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法，包括：基于蛋白质预训练大模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测，得到候选突变氨基酸的概率分布；根据概率分布采用最优传输距离采样候选突变氨基酸以得到目标突变蛋白质；利用高通量实验设备合成目标突变蛋白质并进行生化测试，得到湿实验标注结果；将带有湿实验标注结果的目标突变蛋白质对模型进行有监督训练，利用训练后的模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测并降序排序；依据降序排序筛选多个突变蛋白质，并结合天然蛋白质对大模型做无监督微调；利用微调后的蛋白质预训练大模型，重复上述过程直至达到蛋白质改造预期目标。该方法蛋白质改造效率和准确度高。
基于优化训练模型采样定向蛋白质改造方法

[发明专利]一种基于节点向量的蛋白质复合物识别方法-CN201810693748.2有效
发明人：杨志豪;刘晓霞 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2018-06-29 - 公布日： 2020-01-14 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：一种基于节点向量的蛋白质复合物识别方法，该方法包括以下步骤：S1、采集包含蛋白质交互作用关系的蛋白质对数据集：S2、构建蛋白质交互作用关系网络；S3、网络节点向量化；S4、网络边加权；S5、选取种子节点；S6、种子节点扩张从而形成候选蛋白质复合物子图；S7、过滤候选蛋白质复合物子图并输出最终识别得到的蛋白质复合物子图。本发明适用于从已有的蛋白质交互作用关系中识别蛋白质复合物的工作，不限于蛋白质交互作用关系的来源，能够有效的识别蛋白质复合物，将有助于在蛋白质水平上揭示疾病等生命活动的基本机理。
蛋白质复合物蛋白质交互作用候选蛋白质节点向量种子节点复合物蛋白质水平关系网络生命活动网络节点数据集向量化构建加权过滤蛋白采集输出疾病网络

[发明专利]一种基于随机聚类森林的全基因组蛋白质功能预测方法-CN201610171048.8有效
发明人：吴庆耀;谭明奎;陈健;牟帅;韩超 -专利权人：华南理工大学
申请日： 2016-03-23 - 公布日： 2018-09-14 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于随机聚类森林的全基因组蛋白质功能预测方法。该方法将已注释功能的蛋白质按功能分别进行聚类，将具有同一种功能的蛋白质划分为若干个簇，并计算每个簇的中心；所有的簇中心组成蛋白质新的特征向量，使用蛋白质原有的多组特征向量将每个蛋白质转换为只具有一组特征向量的对象；将完成特征转换的蛋白质作为数据集，使用已注释功能的蛋白质训练多棵随机聚类树，构建随机聚类森林作为全基因组蛋白质的功能预测模型，并使用该模型预测未注释的全基因组蛋白质的功能。本发明提高了蛋白质预测的效率，也提高了蛋白质功能的注释准确率。
一种基于随机森林基因组蛋白质功能预测方法

[发明专利]为受试者提供合理蛋白质膳食的方法-CN201811023405.1有效
发明人：瓦尔特·D·隆哥;塞巴斯蒂安·布兰德霍斯特;摩根·埃利塞·莱文 -专利权人：南加利福尼亚大学
申请日： 2014-02-12 - 公布日： 2021-12-24 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明提供一种为受试者提供合理蛋白质膳食的、用于非治疗目的的方法，包括：鉴定所述受试者的平均日蛋白质摄取水平是否大于预定的临界蛋白质摄取水平；测定所述受试者消耗的植物基蛋白质和动物基蛋白质的量；如果所述受试者的平均日蛋白质水平大于所述临界蛋白质摄取水平，如果所述受试者比预定的年龄更小，则为所述受试者提供低蛋白质膳食，所述低蛋白质膳食提供的来自蛋白质的卡路里百分数小于预定的临界蛋白质摄取水平，其中所述低蛋白质膳食在所述受试者为65岁以下时提供；和监测所述受试者的
受试者提供合理蛋白质膳食方法

[发明专利]一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法-CN201910719819.6有效
发明人：杨洋;朱冠臣;丁雪松;吕强;严文颖;朱斐 -专利权人：苏州大学
申请日： 2019-08-06 - 公布日： 2023-03-31 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法，该系统由蛋白质信息输入模块、蛋白质序列特征计算模块、蛋白质稳定性预测模块、预测结果输出模块和数据库组成。该预测方法主要为首先获取单一或批量蛋白质序列，并计算蛋白质的物理特征、电荷特征、结构特征、生化特征和属性特征，然后提取重要特征并计算蛋白质的变性温度，作为蛋白质稳定性的预测结果，最后保存预测结果并自动发送给用户本发明的这种预测方式实用性强，且具有较高的预测准确率，特别是在蛋白质结构未知的情况下也能预测蛋白质变性温度的具体数值，而不是仅仅进行分类预测，泛化性强，对于蛋白质功能分析、辅助蛋白质工程和设计、药物设计等方面具有重大的意义
一种基于序列预测蛋白质变性温度系统及其方法

[发明专利]一种系列共轭芳香分子掺杂蛋白质的制备及调节蛋白质电子传输带隙的方法-CN202010532345.7有效
发明人：蔡称心;梁文慧;胡耀娟;吴传丽;樊晶晶;吴萍 -专利权人：南京师范大学
申请日： 2020-06-11 - 公布日： 2023-02-28 - 主分类号： G01N27/48 文献下载
摘要：本发明公开了一种系列共轭芳香分子掺杂蛋白质的制备及调节蛋白质电子传输带隙的方法，该方法包括配制蛋白质溶液，共轭芳香分子溶液，芳香共轭分子–蛋白质分子复合物的制备，蛋白质分子，芳香共轭共轭分子–蛋白质分子的固定，建立掺杂固定后共轭芳香分子–蛋白质复合物的构象，掺杂芳香共轭分子调节蛋白质电子传输的电流电压电化学曲线的建立，掺杂芳香共轭分子调节蛋白质电子传输带隙的微分电导曲线的建立。本发明方法实现了维持蛋白质构象稳定，保持蛋白质本身构象不发生变化，调节电子传输带隙，是一种简单、普适的方法用于调控蛋白质分子的电子传输性能及其带隙大小，为开发新型生物电子器件及探索它们新的应用领域提供重要理论基础
一种系列共轭芳香分子掺杂蛋白质制备调节电子传输方法

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