本发明公开了一种耐盐性相关的RUB1蛋白质及其相关生物材料与应用。所述RUB1蛋白质具体可为如下A1)、A2)或A3)的蛋白质:A1)氨基酸序列是序列表中SEQ ID No.2的蛋白质;A2)将A1)的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与A1)所示的蛋白质具有90%以上的同一性且具有相同活性的蛋白质;A3)在A1)或A2)的N末端或/和C末端连接蛋白质标签得到的融合蛋白质。RUB1蛋白质及其相关生物材料可用于调控耐盐性。
本发明涉及一种基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法,包括:预测蛋白质结合位点;输入关于演化、物理化学性质、结构以及动态性这四个方面衡量蛋白质中每个残基的性质;基于蛋白质的三维结构对每个蛋白质构建其点加权的蛋白质结构网络(Node‑weighted Protein Structure Network,NPSN);定义并计算点加权的蛋白质结构网络的参数;基于以上网络参数,利用随机森林模型预测蛋白质中的别构残基的概率。整合残基物理化学性质、序列信息、蛋白质结构特征、动态特征,节省时间,适用于大规模的、批量蛋白质功能位点预测,并提高预测的准确性。
本发明公开了一种植物耐盐性相关的LIP1蛋白质及其相关生物材料与应用。所述LIP1蛋白质具体可为如下A1)、A2)或A3)的蛋白质:A1)氨基酸序列是序列表中SEQ ID NO:2的蛋白质;A2)将A1)的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与A1)所示的蛋白质具有90%以上的同一性且具有相同活性的蛋白质;A3)在A1)或A2)的N末端或/和C末端连接蛋白质标签得到的融合蛋白质。LIP1蛋白质及其相关生物材料可用于调控植物耐盐性。