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[发明专利]检测人尿液或血液样本中的线粒体基因组的方法及试剂盒-CN202010184971.1在审
发明人：李全;李妍珂;刘永初;李阳;刘阳;吕佩涛 -专利权人：安吉康尔（深圳）科技有限公司
申请日： 2020-03-17 - 公布日： 2020-05-19 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本申请公开了一种检测人尿液或血液样本中的线粒体基因组的方法及试剂盒。本申请检测人尿液或血液样本中的线粒体基因组的方法，包括对提取自尿液或血液的基因组DNA进行线粒体基因组长片段PCR扩增，并对扩增产物进行纯化，获得线粒体基因组全长片段，对获得的线粒体基因组进行测序文库构建，并采用高通量测序对线粒体基因组进行测序，实现人尿液或血液样本中的线粒体基因组的检测。本申请检测人尿液或血液样本中的线粒体基因组的方法，能够对人尿液和血液中的线粒体基因组进行准确有效的检测，为人线粒体疾病诊断或人线粒体研究提供分子生物学角度的辅助证据和参考依据。
检测尿液血液样本中的线粒体基因组方法试剂盒

[发明专利]精确测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法-CN201811081584.4有效
发明人：吴旭干;张成;成永旭 -专利权人：上海海洋大学
申请日： 2018-09-17 - 公布日： 2022-04-12 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明涉及精准测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法和由该方法得到的全基因组序列。该方法包括步骤：(1)提取中华绒螯蟹肌肉组织中的全基因组DNA，构建基因文库，利用第二代测序技术进行测序；(2)参考近缘物种线粒体全基因组序列对测序读段进行筛选，除去核DNA片段，然后进行线粒体基因组的拼接，再对拼接的线粒体基因组的编码蛋白基因、rRNA和tRNA进行预测注释；(3)将拼装好的线粒体基因组序列和近缘缘物种线粒体基因组序列比对，根据保守区，再参考所述近缘物种的线粒体全基因组序列设计引物，对对应的第二代测序样品进行PCR扩增，利用第一代测序技术测序PCR扩增产物，校正拼接的线粒体基因组序列。
精确测定中华绒螯蟹线粒体基因组序列方法

[发明专利]一种绵羊线粒体基因组遗传变异的分析方法-CN201310169621.8无效
发明人：赵兴波;陈晓勇 -专利权人：赵兴波
申请日： 2013-05-10 - 公布日： 2013-10-09 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种绵羊线粒体基因组遗传变异分析方法，属分子生物学领域。本发明采用线粒体基因组分段扩增和测序方法，参照已公开的绵羊线粒体基因组序列设计覆盖绵羊线粒体基因组的18对引物，每段序列长度1kb～1.2kb，相邻片段有100bp左右的重叠区域。分段扩增的线粒体基因片段进行测序，通过在线搜索引擎和生物信息学软件进行序列拼接比对，获得线粒体基因组遗传变异信息。该方法是一种运用分子遗传学、生物信息学和基因测序方法寻找线粒体基因组遗传变异的方法，由于哺乳动物线粒体基因组基因排序一致，该研究策略可涵盖山羊、猪、牛、马、驴等哺乳动物线粒体基因组遗传变异分析。
一种绵羊线粒体基因组遗传变异分析方法

[发明专利]一种用于土蜂线粒体基因组拼接及注释方法-CN202211720158.7在审
发明人：姚余江;李廷景 -专利权人：重庆师范大学
申请日： 2022-12-30 - 公布日： 2023-04-28 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开一种用于土蜂线粒体基因组拼接及注释方法，包括以下步骤：样本采集：1）样本采集：采集土蜂用于提取总DNA；2）总DNA的提取与文库构建；3）线粒体基因组的测序与组装；4）采用Illumina高通量测序平台进行文库DNA测序；5）线粒体基因组的组装与注释；6）将测定的土蜂线粒体基因组进行系统衍化关系的分析。本发明极大节省了时间与人力成本，可快速、大批量开展线粒体及其它细胞器基因组测定工作；可获得完整的土蜂线粒体全基因组数据，从而对土蜂线粒体基因组进行系统和全面的系统衍化关系的分析。
一种用于土蜂线粒体基因组拼接注释方法

[发明专利]一种基于全基因组测序技术的多种动物源性掺假鉴别方法-CN201911414912.2有效
发明人：刘昶;姜梅;张慧;孔凡德;唐泰山 -专利权人：中国医学科学院药用植物研究所
申请日： 2019-12-31 - 公布日： 2023-01-13 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于全基因组测序技术的多种动物源性掺假鉴别方法，包括如下步骤：1)构建线粒体基因组数据库，将测序数据与线粒体基因组数据库进行比对，提取比对得到的线粒体序列；2)将1)中提取的线粒体序列进行各物种线粒体基因组重组装；3)将1)中提取的线粒体序列比对到2)中重组装的线粒体基因组上，提取比对到2)中重组装线粒体基因组上的序列；4)将3)中比对到重组装线粒体基因组上的序列分为2类，提取只比对到单一物种重组装线粒体基因组的序列
一种基于基因组技术多种动物掺假鉴别方法

[发明专利]一种植物线粒体基因组编码环状RNA的识别算法-CN202210276265.9在审
发明人：张亚锋;廖珣;常冯瑞 -专利权人：华南农业大学
申请日： 2022-03-21 - 公布日： 2022-07-05 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种植物线粒体基因组编码环状RNA的识别算法。本发明所建立的MeCi识别方法根据植物线粒体基因组的特点设计，使用blast工具将RNA‑seq数据比对到参考基因组，得到比对结果文件；将比对结果文件中的数据进行序列特征筛选获得候选circRNA；对候选circRNA进行条件筛选获得植物线粒体基因组编码环状RNA。通过使用MeCi对玉米和拟南芥的转录组数据分析可以获得现有技术检测不到的新预测线粒体基因组编码circRNA。实验证据表明，新预测的线粒体基因组编码circRNA具有较高的可信度，MeCi优于现有方法，可以有效识别植物线粒体基因组编码circRNA。
一种植物线粒体基因组编码环状 rna 识别算法

[发明专利]一种基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育分析方法-CN201910974636.9在审
发明人：叶莹莹;许中天;冯鉴童 -专利权人：浙江海洋大学
申请日： 2019-10-14 - 公布日： 2020-01-21 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育分析方法，涉及台湾东风螺系统发育分析领域，包括以下步骤：1）样本采集：采集台湾东风螺提取线粒体基因组DNA；2）将线粒体基因组DNA打断、纯化后构建DNA测序文库；3）获得DNA簇；4）对螺线粒体基因组DNA测序；5）与其他已知序列的东风螺进行比较，随后对编码蛋白基因基因注释；6）将台湾东风螺线粒体基因组DNA的每个基因的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列与其他新腹足目物种的进行比对，并将其串联起来进行系统发育分析，本发明基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育进行分析，得到了完整的台湾东风螺线粒体全基因组数据，进行系统发育进行分析方便有效。
线粒体基因组线粒体全基因组系统发育分析编码蛋白基因发育氨基酸序列核苷酸序列测序文库基因注释样本采集已知序列比对对螺腹足构建推导串联打断分析采集物种基因

[发明专利]线粒体基因组DNA快速分离、测序新方法及试剂盒-CN201711256028.1在审
发明人：黄方亮 -专利权人：浙江大学
申请日： 2017-12-03 - 公布日： 2018-04-06 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开线粒体基因组DNA快速分离、测序新方法及试剂盒。本发明采用核酸外切酶III或Plasmid‐Safe ATP‐Dependent DNase酶降解线性染色体序列，进而富集线粒体基因组DNA用于高通量测序。本发明线粒体DNA测序方法为线粒体基因组的检测,特别是可以针对没有参照序列的线粒体基因组检测。
线粒体基因组 dna 快速分离新方法试剂盒

[发明专利]一种快速检测不同品种猪线粒体基因组多态位点的方法-CN201510077296.1有效
发明人：赵兴波 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2015-02-13 - 公布日： 2017-11-21 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种快速检测不同品种猪线粒体基因组多态位点的方法，包括如下步骤步骤1，线粒体基因组覆盖引物设计；步骤2，NUMT排查；步骤3，基因组混池构建；步骤4，PCR扩增、DNA测序、序列拼接和SNP分析本发明所述的方法，运用全基因组测序策略，采用DNA混池测序技术，建立了一整套线粒体基因组多态的分析方法，既排除了NUMT对线粒体基因多态分析的潜在干扰，获得真实的线粒体基因组多态信息，又能高效、便捷地获得品种内
一种快速检测不同品种线粒体基因组多态位点方法

[发明专利]泥东风螺线粒体全基因组序列及其扩增引物-CN201410089717.8在审
发明人：王晓清;熊钢;曾志南;秦溱;巫旗生;朱丹丽 -专利权人：湖南农业大学
申请日： 2014-03-12 - 公布日： 2014-07-02 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：泥东风螺线粒体全基因组序列及其扩增引物，它涉及一种线粒体全基因组序列及其扩增引物。本发明确定泥东风螺线粒体全基因组序列和其扩增引物，为泥东风螺的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。泥东风螺线粒体全基因组序列和基因结构如图1和表1所示。泥东风螺线粒体全基因组序列的扩增引物为14对。
东风螺线粒体全基因组序列及其扩增引物

[发明专利]荧光定量检测核基因组拷贝数及人线粒体基因组拷贝数的方法-CN201711313931.7在审
发明人：马克;赵雪莹;李辉;曹禹;刘文斌 -专利权人：上海市刑事科学技术研究院
申请日： 2017-12-12 - 公布日： 2019-06-21 - 主分类号： C12Q1/6851 文献下载
摘要：一种荧光定量检测核基因组拷贝数及人线粒体基因组拷贝数的方法，通过分别选取人核基因组DNA和线粒体基因组中的一个单拷贝基因，设计引物和探针，然后将序列片段转入PMD‑18T载体中，经转化后提取质粒得到其拷贝数并作为参考标准品；在实际检测时，以参考标准品的Cq值制作标准曲线比较得到待测样品中的核基因组DNA的拷贝数和线粒体基因组DNA的拷贝数。本发明为定量分析人不同组织细胞中线粒体基因组拷贝数提供了方法，特异性高，操作简单，只需荧光定量PCR仪就能完成线粒体基因组拷贝数的快速检测。
拷贝数线粒体基因组荧光定量检测核基因组DNA 参考标准品基因组拷贝核基因组人线粒体荧光定量PCR仪单拷贝基因定量分析标准曲线待测样品快速检测设计引物序列片段组织细胞后提取探针质粒转入检测制作转化

[发明专利]利用CRISPR/Cas9对线粒体基因组进行靶向编辑的方法-CN201611005202.0有效
发明人：陈骐;沈阳坤 -专利权人：福建师范大学
申请日： 2016-11-16 - 公布日： 2019-12-10 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明提供一种利用CRISPR/Cas9技术对线粒体基因组进行靶向编辑的方法，包括如下步骤：构建靶向线粒体基因组的MitoCRISPR载体；将线粒体特异的sgRNA插入到MitoCRISPR载体中，构建线粒体基因敲除或修饰载体；将线粒体基因敲除或修饰载体导入人或动物细胞，从而达到实现编辑人或动物细胞线粒体基因组的目的。本发明用所述的方法对Cas9蛋白和sgRNA元件进行改造,使之进入线粒体并对其基因组相应的基因打靶，进行基因敲除、修饰，以期望清除线粒体内的突变DNA，从而有望治疗多种线粒体病。
利用 crispr cas9 线粒体基因组进行靶向编辑方法

[发明专利]一种用于鱼类线粒体全基因组扩增的引物、试剂盒及扩增方法-CN201510999386.6在审
发明人：沙珍霞;陈亚东;陈学杰;于孟君;孙璐明;单秀娟 -专利权人：中国水产科学研究院黄海水产研究所
申请日： 2015-12-28 - 公布日： 2016-04-06 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于鱼类线粒体全基因组扩增的引物、试剂盒，还公开了鱼类线粒体全基因组DNA的扩增方法、测序方法。本发明利用给定的引物直接扩增结合直接测序的方法，能够得到鱼类线粒体全基因组序列,可以一次性检测鱼类不同物种、同一个物种不同个体线粒体基因的全部碱基突变,能够应用于全部鱼类线粒体基因组研究。
一种用于鱼类线粒体基因组扩增引物试剂盒方法

[发明专利]基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法-CN202110043700.9有效
发明人：高海东;周向阳;徐雷 -专利权人：南京集思慧远生物科技有限公司;南京鑫普华生物科技有限公司
申请日： 2021-01-13 - 公布日： 2022-02-15 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法，对样品DNA进行二代测序和三代测序，利用二代测序数据进行三代数据的校正；利用构建好的植物线粒体编码基因数据库，使用此植物线粒体编码基因数据库中所有参考序列比对第（3）步校正得到的三代序列数据集，获取seed序列进行下一步分析；对seed序列进行延伸，获取全长的线性线粒体基因组DNA序列，对线性线粒体基因组DNA序列进行环化，获取环状线粒体基因组DNA序列。本发明组装方法能够快速地从三代测序数据中得到完整的植物线粒体基因组序列，适用于大部分植物线粒体基因组。
基于二代三代测序技术植物线粒体基因组组装方法

[发明专利]一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒及其应用-CN201611270166.0有效
发明人：赵书红;谢胜松;倪攀;陈俭海;李世军;韩晓松;刘向东;杜小勇;马云龙;赵长志 -专利权人：华中农业大学
申请日： 2016-12-30 - 公布日： 2021-07-09 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒及其应用，该试剂盒包括靶向猪线粒体基因组序列的捕获探针，所述的捕获探针由生物素标记的核苷酸序列组成，核苷酸序列如SEQ ID NO：1‑106所示，获取猪线粒体基因组序列的方法包括以下步骤：1）提取猪的基因组DNA；2）构建猪的全基因组文库；3）与捕获探针液相杂交、测序、序列拼接，即可获取猪线粒体基因组序列，该方法尤其适用于靶向捕获猪古DNA中线粒体基因组序列，其灵敏度高，特异性强，且稳定性好
种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒及其应用

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