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[实用新型]一种基因测序用DNA提取预处理装置-CN202123253130.0有效
发明人：高海东;朱芳芳 -专利权人： 南京鑫普华生物科技有限公司
申请日： 2021-12-22 - 公布日： 2022-08-30 - 主分类号： C12M1/38 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种基因测序用DNA提取预处理装置，包括箱体，所述箱体内腔的底部固定连接有固定座，所述固定座的顶部开设有滑槽，且滑槽的内腔滑动连接有收集盒，所述收集盒的顶部开设有收集槽，所述箱体内腔的上端分别固定连接有过滤板和收集板，且收集板位于过滤板的正下方。本实用新型通过设置固定座，用于支撑收集盒，通过设置收集盒和收集槽，用于接收分离作业并进行过滤后的提取液，通过设置过滤板，用于对分离后的提取液进行过滤作业，通过设置收集板和排液孔，用于配合排液管对过滤后的提取液进行导流，通过设置转杆，用于对分离桶进行支撑，通过设置分离桶，用于配合分离孔对提取液进行分离作业。
一种基因测序用 dna 提取预处理装置

[发明专利]基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法-CN202110043700.9有效
发明人：高海东;周向阳;徐雷 -专利权人：南京集思慧远生物科技有限公司;南京鑫普华生物科技有限公司
申请日： 2021-01-13 - 公布日： 2022-02-15 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于二代和三代测序技术的植物线粒体基因组组装方法，对样品DNA进行二代测序和三代测序，利用二代测序数据进行三代数据的校正；利用构建好的植物线粒体编码基因数据库，使用此植物线粒体编码基因数据库中所有参考序列比对第（3）步校正得到的三代序列数据集，获取seed序列进行下一步分析；对seed序列进行延伸，获取全长的线性线粒体基因组DNA序列，对线性线粒体基因组DNA序列进行环化，获取环状线粒体基因组DNA序列。本发明组装方法能够快速地从三代测序数据中得到完整的植物线粒体基因组序列，适用于大部分植物线粒体基因组。
基于二代三代测序技术植物线粒体基因组组装方法

[发明专利]一种基于NGS测序技术精准组装叶绿体基因组的方法-CN202011317707.7在审
发明人：高海东;姜传北 -专利权人：南京集思慧远生物科技有限公司;南京鑫普华生物科技有限公司
申请日： 2020-11-23 - 公布日： 2021-03-12 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于NGS测序技术精准组装叶绿体基因组的方法，步骤如下：S1、利用illumina测序技术对样品进行测序；S2、下载NCBI数据库中所有叶绿体基因组序列构建本地参考数据库；S3、将测序数据比对步骤2构建的数据库，筛出叶绿体数据；S4、使用spades软件对步骤S3得到的数据进行初步组装，得到contigs序列；S5、将步骤S4得到的contigs序列进行自身比对，将有相似性的contigs去冗余；S6、对剩余的contigs序列挑选最长的1条进行reads比对迭代延伸，在延伸过程中将检测到有overlap的contigs进行融合，形成新的contig；本发明克服了叶绿体基因组获得周期长、难度大、不经济等问题，解决了在组装技术上不完整、不精确等问题，对叶绿体基因组的研究就有经济、高效、普适性等特点。
一种基于 ngs 技术精准组装叶绿体基因组方法