[发明专利]实时荧光定量PCR检测外源GhCAD6基因在棉花纤维中表达量的方法在审
申请号: | 201810706577.2 | 申请日: | 2018-06-20 |
公开(公告)号: | CN110616250A | 公开(公告)日: | 2019-12-27 |
发明(设计)人: | 胡文冉;苏秀娟;李晓荣;周小云;杨洋;李波;范玲;樊国全;刘建喜;邓晓娟 | 申请(专利权)人: | 新疆农业科学院核技术生物技术研究所(新疆维吾尔自治区生物技术研究中心);新疆农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 830091 新疆维吾尔自*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | 本发明公开了一种采用实时荧光定量PCR检测外源GhCAD6基因在棉花纤维中的表达量的方法,首先采用热硼酸‑蛋白酶K法提取出棉花纤维的RNA,反转录成cDNA,利用特异性引物和内参基因,在特定的反应条件和反应程序下进行荧光RT‑PCR,检测外源GhCAD6基因在不同发育阶段棉纤维中的表达量,该方法自动收集荧光信号,避免了肉眼判断的主观性,提高了实验的灵敏度,保证了结果的可靠性和重复性,免除了常规PCR中的电泳、定量扫描等后续繁琐步骤,大大缩短了实验时间;本发明中棉花GhCAD6基因实时荧光RT‑PCR检测方法的建立,为研究棉花GhCAD6基因表达调控机理及利用其改良棉花纤维品质的研究奠定了基础。 | ||
搜索关键词: | 棉花纤维 表达量 外源 基因 实时荧光定量PCR 硼酸 基因表达调控 棉花纤维品质 特异性引物 蛋白酶K法 电泳 发育阶段 繁琐步骤 反应程序 反应条件 内参基因 肉眼判断 实时荧光 荧光信号 自动收集 棉花 常规PCR 反转录 灵敏度 棉纤维 主观性 检测 荧光 扫描 改良 研究 保证 | ||
【主权项】:
1.一种实时荧光定量PCR检测外源GhCAD6基因在棉花纤维中表达量的方法,其特征是采用符合荧光PCR反应特点的目标基因及内参基因的特异性上、下游引物,利用实时荧光定量PCR检测目标基因在不同发育阶段棉花纤维中的表达量,其具体步骤为:/na、棉花纤维总RNA提取:采用热硼酸-蛋白酶K法提取不同发育阶段棉花纤维的RNA;/nb、cDNA第一链合成:以棉花RNA为模板合成cDNA第一链,反应体系为20μL;/nc、实时荧光PCR:以上述合成的cDNA第一链为模板,利用如下引物作为特异性引物,进行实时荧光PCR扩增反应,每个样品设3个平行管,扩增后所得3个平行管的Ct值取平均数;/n符合荧光PCR反应特点的该目的基因GhCAD6序列特异性上下游引物:/nGhCAD6-F:5’-GTTCCTGGGCATGAAGTGGT-3’/nGhCAD6-R:5’-TGCAACATCCAACAAGACAACC-3’/n以及作为内参基因的棉花GhUBQ7基因特异性上下游引物:/nGhUBQ7-F:5’-AGAGGTCGAGTCTTCGGACA-3’/nGhUBQ7-R:5’-GCTTGATCTTCTTGGGCTTG-3’/n其荧光定量定量PCR的反应体系为:总体积为20μL,内含
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- 2018-06-20 - 2019-12-27 - C12Q1/6851
- 本发明公开了一种采用实时荧光定量PCR检测外源GhCAD6基因在棉花纤维中的表达量的方法,首先采用热硼酸‑蛋白酶K法提取出棉花纤维的RNA,反转录成cDNA,利用特异性引物和内参基因,在特定的反应条件和反应程序下进行荧光RT‑PCR,检测外源GhCAD6基因在不同发育阶段棉纤维中的表达量,该方法自动收集荧光信号,避免了肉眼判断的主观性,提高了实验的灵敏度,保证了结果的可靠性和重复性,免除了常规PCR中的电泳、定量扫描等后续繁琐步骤,大大缩短了实验时间;本发明中棉花GhCAD6基因实时荧光RT‑PCR检测方法的建立,为研究棉花GhCAD6基因表达调控机理及利用其改良棉花纤维品质的研究奠定了基础。
- 检测DNA聚合酶活性的方法及检测试剂盒-201710324886.9
- 蔡统聪;邓艳华;杨浩;黄田田;孙康成;王益琼 - 菲鹏生物股份有限公司;广东菲鹏生物有限公司
- 2017-05-10 - 2019-12-27 - C12Q1/6851
- 本发明涉及一种检测DNA聚合酶活性的方法及检测试剂盒。该方法将待测DNA聚合酶与足量的待补平模板混合,在dNTP存在的条件下,通过待测DNA聚合酶诱导待补平模板中的第一DNA片段延伸形成与凸出片段的碱基互补的补平片段得到补平模板。补平模板中的U碱基被足量的UDG酶消化去除,得到适于PCR扩增的模板,正向引物针对凸出片段设计,反向引物针对第一DNA片段的5’端设计,诱导第一模板链扩增。而未经补平的模板经消化酶去除U碱基后则无法与正向引物配对,即不能进行PCR扩增反应。将待测DNA聚合酶的CT值带入由DNA聚合酶标准品建立的标准曲线中,运算即可获得待测DNA聚合酶的酶活性。
- 一种基于Cas9切口酶偶联DNA聚合酶的恒温核酸检测分析方法及试剂盒-201910119855.9
- 叶邦策;尹斌成;王婷 - 华东理工大学
- 2019-02-18 - 2019-12-24 - C12Q1/6851
- 本发明公开了一种基于Cas9切口酶偶联DNA聚合酶的恒温核酸检测分析方法,是在恒温条件下特异性检测靶标核酸;包括以下步骤:以两条分别与靶DNA序列互补的sgRNA序列,两组Cas9n‑sgRNA复合物分别与前间区序列邻近基序毗邻的匹配靶DNA序列结合后,通过Cas9n单口切割酶活性和恒温DNA聚合酶链置换活性,获得一条单链靶DNA序列,该序列在引物1和引物2,DNA聚合酶及Cas9n‑sgRNA复合物的共同作用下,在恒温条件下反复进行引物杂交,延伸,切割,链置换反应,扩增获得大量靶DNA序列,荧光染料与双链DNA产物结合产生荧光信号,实时测定反应体系中的荧光信号强度,与标准工作曲线对比,计算出靶标基因组或DNA序列的浓度。本发明尤其适用于核酸即时检测。
- 一种针对发酵乳中以醋化醋杆菌为主的系列杂菌污染的高精度特异性数字PCR检测方法-201910730701.3
- 周巍;史国华;张岩;李永波;杨岚;陈晨;王赞 - 河北省食品检验研究院(国家果类及农副加工产品质量监督检验中心、河北省食品安全实验室)
- 2019-08-08 - 2019-12-20 - C12Q1/6851
- 本发明公开了一种针对发酵乳中以醋化醋杆菌为主的系列杂菌污染的高精度特异性数字PCR检测方法。本发明的方法首先对待测杂菌进行死菌去干扰处理,然后对细菌DNA进行低杂质高纯度的提取,研发设计待测菌的特异性引物探针,设定ddPCR反应体系、反应程序及其退火温度,使得检测方法满足特异性、灵敏度和定量化的要求。本发明构建的方法特异性好,无非特异性扩增,具有良好的灵敏度及定量化优势。
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