本发明涉及生物工程技术领域,具体提供一种sgRNA库、敲低基因文库及敲低基因文库的构建方法和应用。所述sgRNA库包括SEQ ID NO.1~1740所示的序列。所述构建方法包括利用sgRNA库、酶切质粒、T4DNA连接酶、pir E.coli感受态细胞和MFD pirE.coli感受态细胞等构建MFD敲低质粒文库,以及利用Tn7转座系统,通过细菌接合将MFD敲低质粒文库转移至肺炎克雷伯菌中并插入基因组稳定遗传的步骤。本发明可以快速高效的构建大规模敲低基因文库,并且不受必需基因无法敲除、敲除缺失、插入突变等的限制,获得的敲低基因文库可以用于对肺炎克雷伯菌的潜在药物作用靶点进行筛选。