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[发明专利]一种靶向IL-16基因的sgRNA、质粒组及基因敲除方法和应用-CN202110193505.4有效
发明人：王一;郭梅;蔡博;莫丹;胡锴勋;黄雅静;刘志青;刘铁强;黄珊;李冰霞 -专利权人：中国人民解放军总医院第五医学中心
申请日： 2021-02-20 - 公布日： 2022-03-29 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明涉及基因工程技术领域，具体涉及一种靶向IL‑16基因的sgRNA、质粒组及基因敲除方法和应用。本发明所述sgRNA包括sgRNA1或sgRNA2；所述sgRNA1包括sgRNA1‑S和sgRNA1‑A；所述sgRNA2包括sgRNA2‑S和sgRNA2‑A。本发明提供的靶向IL‑16基因的sgRNA不仅能够稳定敲除白血病肿瘤细胞内的IL‑16基因，而且可用于制备抑制肿瘤增殖的药物。
一种靶向 il 16 基因 sgrna 质粒方法应用

[发明专利]NNT基因去甲基化的sgRNA序列、编辑系统的构建方法及其应用-CN202210545516.9有效
发明人：李道传;徐驰;邢秀梅 -专利权人：中山大学
申请日： 2022-05-19 - 公布日： 2023-03-24 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明公开了一种NNT基因去甲基化的sgRNA序列，选自sgRNA1、sgRNA4、sgRNA5、sgRNA6、sgRNA9和sgRNA10中的一种，或选自sgRNA1、sgRNA6、sgRNA9和sgRNA10的组合，或选自sgRNA1至sgRNA10的组合。本发明属于基因工程技术领域，本发明从NNT基因启动子区筛选出特定的靶位点，并设计sgRNA序列，同时利用CRISPR/dCas9‑TET1技术构建得到NNT基因去甲基化编辑系统，从而实现对NNT基因的启动子区特异性的去甲基化
nnt 基因甲基化 sgrna 序列编辑系统构建方法及其应用

[发明专利]一种双碱基突变的高活性sgRNA骨架、sgRNA骨架载体及其应用-CN201910511966.4在审
发明人：陈皓;陈欢欢;胡维欣;王卓馨;杨铁林;郭燕 -专利权人：西安交通大学
申请日： 2019-06-13 - 公布日： 2019-09-17 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明公开了一种双碱基突变的高活性sgRNA骨架、sgRNA骨架载体及其应用，在张峰实验室的sgRNA scaffold载体的基础上通过对该骨架序列两个碱基的改变实现的。PCR获得的高活性骨架片段sgRNA(TTAT)scaffold，通过EcoRI与SpeI位点连入载体pUC19/hU6‑sgRNA backbone中，替换原载体的sgRNA scaffold获得高活性sgRNA骨架载体pU6‑sgRNA(TTAT)scaffold；使用BsaI酶切载体pU6‑sgRNA(TTAT)scaffold，并利用粘性末端连入针对目标基因的sgRNA序列，获得载体pU6‑sgRNA能显著提高介导Cas9蛋白的基因组编辑作用，效果明显优于野生sgRNA骨架载体。
骨架载体高活性双碱基突变骨架片段骨架序列酶切载体目标基因粘性末端基因组原载体碱基介导位点替换应用蛋白

[发明专利]一种sgRNA、重组质粒及其应用-CN202310978952.X在审
发明人：曹巍;刘嘉;吴伟;韩鹏黎;关红亚;崔渊博;孙晓燕;吕鹏举;娄雅楠 -专利权人：曹巍
申请日： 2023-08-04 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本申请涉及食管鳞状细胞癌治疗的技术领域，具体公开了一种sgRNA、重组质粒及其应用。sgRNA选自sgRNA1、sgRNA2、sgRNA3和sgRNA4中的任意一种；所述sgRNA能够和ESCCAL‑1基因启动子区域CpG岛富集区结合，以调控ESCCAL‑1基因的甲基化水平；所述sgRNA1~sgRNA4的序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8所示；重组质粒包括sgRNA和基础质粒，所述基础质粒上含有的组件包括CRISPR/cas9组件和DNMT3A组件；该sgRNA和重组质粒用于癌症治疗
一种 sgrna 重组质粒及其应用

[发明专利]利用CRISPR技术编辑CCR5基因的sgRNA序列及其用途-CN201610133212.6在审
发明人：邓宏魁;杨欢;徐磊 -专利权人：北京大学
申请日： 2016-03-09 - 公布日： 2017-09-19 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明涉及利用CRISPR技术编辑CCR5基因的sgRNA序列及其用途。本发明提供针对CCR5基因的sgRNA序列，所述sgRNA序列选自CCR5‑sgRNA1AGGGCAACTAAATACATTCT，CCR5‑sgRNA2TGCCAAAAAATCAATGTGAA，CCR5‑sgRNA3AGTGGGACTTTGGAAATACA，和CCR5‑sgRNA4ATGCACAGGGTGGAACAAGA。本发明还涉及编码所述sgRNA序列的DNA序列、包含所述sgRNA序列或所述DNA序列的载体、包含所述载体的细胞及其用途。本发明提供了安全高效的sgRNA，其具有切割效率高，脱靶概率小等优点，在艾滋病基因治疗的临床研究和应用上具有广泛的前景。
利用 crispr 技术编辑 ccr5 基因 sgrna 序列及其用途

[发明专利]一种植物中sgRNA活性预测方法及装置-CN202111138368.0在审
发明人：邹权;牛梦婷;丁漪杰;杜军平 -专利权人：电子科技大学长三角研究院（衢州）
申请日： 2021-09-27 - 公布日： 2021-12-24 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供一种植物中sgRNA活性预测方法及装置，方法包括：下载sgRNA活性序列数据集，sgRNA活性序列数据集包括植物sgRNA活性数据；采用热编码方法对植物sgRNA活性数据进行编码，得到植物sgRNA序列数据；采用k‑mer编码方法对植物sgRNA序列数据进行二次编码；通过编码后的sgRNA活性序列数据集构建卷积神经网络模型；通过卷积神经网络模型按设定次数n分别对编码后的sgRNA活性序列数据集进行预测训练，得到n个训练模型，将n个训练模型集成，得到卷积神经网络预测模型sgRNACNN；将待预测的植物sgRNA活性序列输入卷积神经网络预测模型sgRNACNN中，得到预测结果。本发明的卷积神经网络预测模型sgRNACNN泛化性能较好，可应用于多物种植物sgRNA活性预测，能够实现对sgRNA活性的准确识别，具有较好的实用性能。
一种植物 sgrna 活性预测方法装置

[发明专利]一种靶向棉铃虫转录因子Kr-h1基因敲除的sgRNA筛选与应用-CN202211637655.0在审
发明人：程阳;朱宇;韦有恒 -专利权人：扬州大学
申请日： 2022-12-18 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明涉及一种靶向棉铃虫转录因子Kr‑h1基因敲除的sgRNA筛选与应用，所述sgRNA为sgRNA1、sgRNA2；其中：sgRNA1的序列为：AAAGAACGACCCTACCGATG，该序列位于棉铃虫Kr‑h1编码区307bp位置；sgRNA2的序列为：GACGGCATCTGTTGATTGCG，该序列位于棉铃虫Kr‑h1编码区767bp位置。sgRNA的筛选方法是根据Kr‑h1的核苷酸序列，使用在线工具Crispor设计两个sgRNA，在体外使用PCR和T7转录技术，获得两个sgRNA，即sgRNA1、sgRNA2，并进行纯化。本发明方法先进科学，两个sgRNA介导的Kr‑h1基因敲除能引起棉铃虫发育障碍或死亡，可以作为其生物防治的靶标。
一种靶向棉铃虫转录因子 kr h1 基因 sgrna 筛选应用

[发明专利]新型果蝇突变体构建系统-CN202211493947.1在审
发明人：韩玉婷;邱雨浩;车沁耘;倪建泉;谢艺嘉;彭博;郑丽;朱丽霏 -专利权人：清华大学
申请日： 2022-11-25 - 公布日： 2023-03-28 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明提出了一种新型果蝇突变体构建系统，所述系统包括第一sgRNA以及第二sgRNA，所述第一sgRNA以及第二sgRNA可操作地连接，所述第一sgRNA靶向目标基因，所述第二sgRNA靶向标签基因。根据本发明实施例的sgRNA导入受体细胞，可同步实现目标基因和标签基因的基因编辑，提高突变体筛选效率，大大减少筛选的工作量。
新型果蝇突变体构建系统

[发明专利]一种猪全基因组sgRNA文库及其构建方法和应用-CN201711490244.2在审
发明人：许朋阳;徐凤丹;段广有;闵文波;夏步高;葛毅 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2017-12-29 - 公布日： 2018-06-29 - 主分类号： C40B40/06 文献下载
摘要：本发明提供了一种猪全基因组sgRNA文库及其构建方法和应用，所述文库包括猪(Sus scrofus)全基因组中20438个基因的sgRNA序列，其中17410个基因设计得到6条sgRNA，2828个基因设计得到sgRNA数量在1‑5条之间，所述sgRNA的获取过程为：首先在靶序列上获取候选sgRNA，然后对候选sgRNA进行脱靶分析并打分，最后根据打分结果对sgRNA过滤；本发明通过采用多种设计标准及筛选原则，优化模块内细节及流程，最终构建得到猪全基因组sgRNA文库，所述方法简洁高效，得到的文库质量高，活性好，便于应用在基因编辑研究中。
文库全基因组构建基因设计种猪应用设计标准优化模块靶序列基因过滤筛选分析研究

[发明专利]错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用-CN202310397466.9在审
发明人：郭燕;胡维欣;荣誉;董珊珊;杨铁林 -专利权人：西安交通大学
申请日： 2023-04-13 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用，涉及基因编辑领域，该方法包括：搭建sgRNA脱靶错配活性预测模型、给定DNA位点上错配sgRNA活性的预测与挑选、挑选出的错配sgRNA脱靶效应预测。本发明通过分析sgRNA‑DNA序列对在不同匹配情况下错配sgRNA活性的改变规律，建立基于深度学习模型的sgRNA错配活性预测模型，并对给定DNA位点上与之结合的错配sgRNA进行活性预测与脱靶效应分析本发明将与目标DNA位点有错配关系的sgRNA列入备选，扩大了sgRNA设计的可能性，能够有效降低该位点上CRISPR系统的脱靶效应，适用于所有需要CRISPR/Cas9系统降低脱靶效应的情形，例如基因敲除、基因治疗等，可以解决现有sgRNA技术方法的局限性。
错配 sgrna 选取方法及其 dna 定位 crispr 系统中的应用

[发明专利]CRISPR/Cas9系统及其在构建胰岛素受体底物基因缺陷的猪源重组细胞中的应用-CN202010084343.6有效
发明人：牛冬;汪滔;王德华;王磊;程锐;曾为俊;马翔 -专利权人：南京启真基因工程有限公司
申请日： 2020-02-10 - 公布日： 2021-07-20 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明提供了sgRNA组合，由sgRNAIRS1‑1、sgRNAIRS1‑3、sgRNAIRS2‑2和sgRNAIRS2‑3组成。本发明提供了质粒组合，由四个质粒组成；四个质粒分别转录得到sgRNAIRS1‑1、sgRNAIRS1‑3、sgRNA<sgRNA组合或质粒组合的用途如下：制备重组细胞；制备糖尿病细胞模型；制备糖尿病动物模型。sgRNAIRS1‑1如SEQ ID NO：8所示。sgRNAIRS1‑3如SEQ ID NO：10所示。sgRNAIRS2‑2如SEQ ID NO：14所示。
crispr cas9 系统及其构建胰岛素受体基因缺陷重组细胞中的应用

[发明专利]一种双sgRNA无痕基因编辑质粒及其制备方法和应用-CN202010525391.4在审
发明人：朱佑民;程倩;王梓旭;陶小倩;杨平;柳伟强;邢妍婧;赵一凡 -专利权人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
申请日： 2020-06-10 - 公布日： 2020-09-04 - 主分类号： C12N15/81 文献下载
摘要：本发明提供了一种双sgRNA无痕基因编辑质粒及其制备方法和应用，所述质粒包括Cas9蛋白表达框和双sgRNA表达框；所述双sgRNA包括宿主基因编辑sgRNA和质粒基因编辑sgRNA。本发明设计含有双sgRNA的质粒对宿主进行基因编辑，所述双sgRNA的其中一条sgRNA用于对宿主进行基因编辑，另一条sgRNA用于消除质粒，实现了在对宿主进行基因编辑的同时消除基因编辑质粒的目的，不会因
一种 sgrna 基因编辑质粒及其制备方法应用

[发明专利]紫花苜蓿CRISPR/Cas9基因组编辑系统及其应用-CN202110884895.X有效
发明人：王涛;董江丽;叶沁怡 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2021-08-03 - 公布日： 2022-04-19 - 主分类号： C12N15/82 文献下载
摘要：本发明公开了CRISPR/Cas9基因组编辑系统在紫花苜蓿基因编辑中的应用，所述CRISPR/Cas9基因组编辑系统包括表达载体，所述表达载体可包括Cas9表达盒、sgRNA1表达盒和sgRNA2表达盒所述sgRNA1表达盒表达名称为sgRNA1的sgRNA，所述sgRNA2表达盒表达名称为sgRNA2的sgRNA；所述sgRNA1表达盒含有名称为MtU6‑6promoter的启动子和由所述MtU6‑6promoter驱动的sgRNA1基因，所述sgRNA2表达盒含有名称为MtU6‑5promoter的启动子和由所述MtU6‑5promoter驱动的sgRNA2基因；所述sgRNA1和所述sgRNA2
紫花苜蓿 crispr cas9 基因组编辑系统及其应用

[发明专利]一种基于深度学习的CRISPR/Cas9 sgRNA活性预测方法-CN202010433775.3在审
发明人：曾甜;许曼玲;戴宪华 -专利权人：中山大学
申请日： 2020-05-21 - 公布日： 2020-09-01 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于深度学习的CRISPR/Cas9 sgRNA活性预测方法，涉及基因编辑领域，该方法包括：构建sgRNA数据集、sgRNA序列编码、搭建sgRNA活性预测模型、训练模型权重及利用训练好的模型预测sgRNA序列活性。本发明通过分析sgRNA序列组成与其活性的关系，提出了一种新的基于深度学习的CRISPR/Cas9 sgRNA活性预测模型，该模型以两层卷积神经网络作为基框架，引入注意力机制用以提取sgRNA序列内与局部位置信息相关的特征此模型能够提取到丰富的与sgRNA活性相关的特征，相比现有的预测算法能够更加准确的预测sgRNA的活性，且具有更好的泛化性能以及较低的时间复杂度。
一种基于深度学习 crispr cas9 sgrna 活性预测方法

[发明专利]一种用于敲除SPARC基因的CRISPR-Cas9系统-CN202211349884.2在审
发明人：马云龙;宋春雨;窦新雨 -专利权人：北京大学第三医院（北京大学第三临床医学院）
申请日： 2022-10-31 - 公布日： 2023-03-07 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明涉及一种用于敲除SPARC基因的CRISPR/Cas9系统、sgRNA的筛选方法及应用。该用于敲除SPARC基因的sgRNA的筛选方法包括如下步骤：提供一个或多个含有T7启动子的T7‑sgRNA骨架，所述T7‑sgRNA骨架包括酶切位点序列、T7启动子序列和sgRNA序列；以所述T7‑sgRNA骨架为模板，对其进行PCR扩增及体外转录，得到包含PCR产物和sgRNA的复合体；以及通过Cas9蛋白对所述包含PCR产物和sgRNA的复合体进行体外酶切，以酶切效率对sgRNA进行筛选。本发明一实施方式的筛选方法，可同时高效的对多个sgRNA进行筛选，能够显著降低筛选成本，可缩短基因敲除小鼠的制备时间，并高效的获得SPARC基因敲除小鼠。
一种用于 sparc 基因 crispr cas9 系统

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