本发明是提供一种具有更好热稳定性和高酶活力的褐藻胶裂解酶,其氨基酸序列为SEQ ID NO:3或SEQ ID NO5;本发明所提供的突变酶用于制备褐藻胶寡糖。本发明利用基因改造的重组褐藻胶裂解酶,定向制备褐藻胶寡糖,与现有酸法水解制备褐藻胶寡糖的方法相比,克服了破坏性大的缺点,与现有的酶法水解制备褐藻胶寡糖的方法相比,运用改造的重组褐藻胶裂解酶,可减少加酶量、缩短酶解时间、提高酶解效率。本发明的酶具有高酶活力和高热稳定性,更适合应用于工业上酶解褐藻胶制备褐藻胶寡糖。所制备的褐藻胶寡糖有抗肿瘤、抗炎、降血脂和提高免疫力等功效,可用于食品及保健品领域,具有广泛的应用前景。