[发明专利]一种表征hHRD同源重组缺陷的基因组重组指纹及其鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201910462967.4 申请日: 2019-05-30
公开(公告)号: CN110241198A 公开(公告)日: 2019-09-17
发明(设计)人: 刘聪;唐子执;姜长安;张臣良;曾鸣;王小军;李友伟 申请(专利权)人: 成都吉诺迈尔生物科技有限公司;德阳市人民医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6886;G16B20/50;G16B20/20
代理公司: 重庆乐泰知识产权代理事务所(普通合伙) 50221 代理人: 樊斌
地址: 611730 四川省成都市郫都区*** 国省代码: 四川;51
权利要求书: 暂无信息 说明书: 暂无信息
摘要: 发明涉及一种新型的同源重组缺陷的鉴定方法及其用途。更具体地,本发明涉及利用高通量基因组重测序、生物信息学分析和统计学相关性分析,解析出的hHRD类型同源重组修复缺陷相关的特征性基因组重组指纹。该特征性hHRD重组指纹由于特定同源重组修复机制(即CRL4WDR70‑H2B单泛素化通路)的功能缺陷所导致,包含单样本中基因组重组的总频率,染色体结构变异类型的组成和位点特异性拷贝数变异,用其鉴定带有该特征性突变指纹的传染病或肿瘤,并用于指导PARP抑制剂类的靶向药物治疗,包括但不限于带有此类特征的乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜(样)癌、卵巢透明细胞癌、前列腺癌、胰腺癌、皮肤癌和胃癌,以及乙型肝炎病毒感染或者相关的肝纤维化肝硬化、肝癌和胆管细胞癌的方法和用途。
搜索关键词: 同源重组 指纹 基因组重组 特征性 乙型肝炎病毒感染 胰腺癌 染色体结构变异 生物信息学分析 前列腺癌 卵巢 修复 胆管细胞癌 透明细胞癌 位点特异性 皮肤癌 靶向药物 肝纤维化 功能缺陷 子宫内膜 统计学 肝硬化 高通量 基因组 拷贝数 卵巢癌 总频率 乳腺癌 测序 泛素 胃癌 肝癌 解析 突变 传染病 样本 肿瘤 治疗 分析
【主权项】:
1.一种用于鉴定特定机制同源重组修复缺陷(hHRD)的基因组重组指纹,具有如选自图1‑2中至少一图所示的指纹特征。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于成都吉诺迈尔生物科技有限公司;德阳市人民医院,未经成都吉诺迈尔生物科技有限公司;德阳市人民医院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201910462967.4/,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
  • 检测NAT1基因分型的引物和方法-201910572193.0
  • 牛林梅;裘振亚;王淑一 - 杭州艾迪康医学检验中心有限公司
  • 2019-06-28 - 2019-11-12 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了一种检测与5‑氨基水杨酸(5‑aminosalicylic acid,5‑ASA)等药物代谢有关的NAT1(N‑acetyltransferase 1,NAT1)基因突变分型的引物和方法,其包括扩增检测核苷酸序列的3对引物;采用PCR扩增技术和Sanger测序技术。本发明可快速地将NAT1基因突变分型检测出来,并可判断其代谢表型。利用本发明完成的检测结果准确,在抗结核治疗时,可结合患者NAT1基因型的不同或代谢表型实施个体化治疗方案。
  • 纤毛不动综合症基因面板试剂盒及其应用-201910760042.8
  • 乐雍建;傅应云;黄启俊;刘盛国 - 深圳市人民医院
  • 2019-08-16 - 2019-11-12 - C12Q1/6883
  • 本发明涉及生物医药技术、疾病诊断领域,具体提供一种检测纤毛不动综合症致病基因遗传突变的基因面板(Panel)捕获试剂盒及其应用。该基因面板的液相捕获试剂盒包括49个纤毛不动综合症相关致病基因对应的探针。本发明的基因面板捕获试剂盒的设计综合了纤毛不动综合症多层次、多方面的纤毛遗传缺陷的致病因素,覆盖全面,其目标捕获具有明显针对性,可同时对较大通量的致病基因进行准确捕获、遗传检测。通过对人的目标基因外显子区域DNA进行高效富集,然后在二代测序平台上进行高通量、高深度测序,能有效提高基因的测序深度及覆盖度,为获得更为精确的基因致病性遗传突变信息,为疾病的预防以及诊断提供便利。
  • ApoE基因引物组、检测试剂盒和检测方法-201510981846.2
  • 盛司潼;邓波 - 武汉康昕瑞基因健康科技有限公司
  • 2015-12-22 - 2019-11-12 - C12Q1/6883
  • 本发明涉及DNA检测技术领域,提供了一种ApoE基因引物组、检测试剂盒和检测方法,其中包括分别检测rs429358位点的引物组和rs7412位点的引物组;检测rs429358位点的引物组中的上游引物具有SEQ ID NO:1‑4中的任一种序列,检测rs429358位点的引物组中的下游引物具有SEQ ID NO:5‑8中的任一种序列;检测rs7412位点的引物组中的上游引物具有SEQ ID NO:9‑12中的任一种序列,检测rs7412位点的引物组中的下游引物具有SEQ ID NO:13‑16中的任一种序列。本发明的引物组、试剂盒及方法能够提高ApoE基因检测过程中正确信号的比例。
  • 用于新生儿黏多糖贮积症基因分型的多重PCR引物系统及其用途-201910744465.0
  • 刘卫星;刘佳;李光;丁国徽 - 上海千贝医疗科技有限公司
  • 2019-08-13 - 2019-11-08 - C12Q1/6883
  • 本发明揭示了一种用于检测新生儿黏多糖贮积症基因分型的引物池,其特征在于,所述引物池包括特异性扩增新生儿黏多糖贮积症相关基因靶向序列的若干个引物对,所述新生儿黏多糖贮积症相关基因靶向序列选自GLB1基因、HYAL1基因、IDUA基因、ARSB基因、GUSB基因、HGSNAT基因、IDS基因、GNS基因、GALNS基因、NAGLU基因、SGSH基因外显子区域序列中的至少一种待测片段。该试剂盒可以对新生儿黏多糖贮积症作出精确的基因分型,用于研究和诊断由上述基因缺陷导致的新生儿黏多糖贮积症。
  • 一种与AS斑块炎症相关的miRNA标志物及其筛选方法和应用-201910752932.4
  • 姜怡邓;张慧萍;郭伟;马鹏俊;孙磊;杨安宁 - 宁夏医科大学
  • 2019-08-15 - 2019-11-08 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了一种与AS斑块炎症相关的miRNA标志物及其筛选方法和应用,属于生物工程技术领域,以ApoE基因敲除小鼠和THP‑1源性泡沫细胞为研究对象,提取组织或细胞的RNA,筛选出与AS相关的基因,在细胞水平验证miR‑195‑3p和相关炎症因子IL‑1β,IL‑6和TNF‑α的表达变化,建立了由miR‑195‑3p、IL‑1β,IL‑6和TNF‑α四个因子组成的AS斑块炎症特异性疾病联合诊断方法。该方法简单可靠,取材方便,灵敏度和特异性均与影像学诊断的结果高度吻合,在AS性疾病的早期诊断与预后评估中具有极大的应用价值。
  • 一种影响人马凡综合征诊治的FBN1 G2125A突变及其应用-201910824991.8
  • 姜正明;陈魁;王楚楚;赵晓燕;董建增 - 郑州大学第一附属医院
  • 2019-09-03 - 2019-11-08 - C12Q1/6883
  • 本发明属于分子生物技术和分子遗传领域,特别涉及一种影响人类马凡综合征辅助诊断及临床干预的错义突变及其应用。所述影响人类马凡综合征辅助诊断及预后的错义突变的突变位点对应于人类FBN1基因编码区第2125位核苷酸位点G>A,命名为c.G2125A。本发明还提供了一种用于鉴定上述错义突变的引物,公开了鉴定前述错义突变在人类马凡综合征辅助诊断及临床干预中的用途,以及鉴定该错义突变用于人类马凡综合征产前诊断的方法。本发明的优点在于为防治马凡综合征提供了新的治疗靶点,为马凡综合征的早期诊断及预后判断提供了强有力的分子生物学工具,具有深远的临床意义和重要的推广前景。
  • 一种影响人肥厚型心肌病诊治的MYBPC3 1624+1G>C位点变异及其应用-201910834215.6
  • 王楚楚;赵晓燕;董建增 - 郑州大学第一附属医院
  • 2019-09-04 - 2019-11-08 - C12Q1/6883
  • 本发明属于分子生物技术和分子遗传领域,特别涉及一种影响人类肥厚型心肌病辅助诊断及临床干预的剪接位点变异及其应用。所述影响人类肥厚型心肌病辅助诊断及预后的剪接位点变异的突变位点对应于人类MYBPC3基因编码区第1624+1位核苷酸位点G>C,命名为c.1624+1G>C。本发明还提供了一种用于鉴定上述剪接位点变异的引物,公开了鉴定前述剪接位点变异在人类肥厚型心肌病辅助诊断及临床干预中的用途,以及鉴定该剪接位点变异用于人类肥厚型心肌病产前诊断的方法。本发明的优点在于为防治肥厚型心肌病提供了新的治疗靶点,为肥厚型心肌病的早期诊断及预后判断提供了强有力的分子生物学工具,具有深远的临床意义和重要的推广前景。
  • 脓毒症诊断标志物-201910867180.6
  • 董东;任静 - 北京泱深生物信息技术有限公司
  • 2019-09-12 - 2019-11-08 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了脓毒症诊断相关分子。本发明通过测序筛选在脓毒症患者和健康对照人群中存在差异表达的分子,后经大样本QPCR验证证明LINC01871在脓毒症患者血液中的含量比健康人低。据此可将LINC01871作为诊断脓毒症的生物标志物。本发明的研究成果为临床上进行脓毒症的早期诊断提供了一种无创的方法,适于临床推广。
  • 一种快速检测人13号、18号、21号、X和Y染色体数目的试剂盒-201610320884.8
  • 吴迪;李协健 - 吴迪
  • 2016-05-16 - 2019-11-08 - C12Q1/6883
  • 本发明公开一种快速检测人13号、18号、21号、X和Y染色体数目的试剂盒,包括扩增检测试剂,该扩增检测试剂包括:1条荧光标记的通用扩增引物和13对重复序列扩增引物中的至少一对,各有3对重复序列引物分别用于检测21号、18号和13号染色体的数目,有4对重复序列引物用于检测X或Y染色体的数目。每对重复序列引物均能同时扩增位于不同两条染色体上的目标序列和参考序列,目标序列和参考序列是位于目标染色体和参考染色体两条染色体上的两个相似序列,通过目标序列和参考序列扩增量的比值能有效检测出目标序列所在染色体的数量。采用该试剂盒检测可在单个反应管中同时检测13号、18号、21号、X和Y染色体数目,结果准确。
  • DACT2基因在制备心力衰竭治疗药物中的应用-201910430328.X
  • 吴钟凯;侯健;黄少杰;龙雁;黄加星 - 中山大学附属第一医院
  • 2019-05-22 - 2019-11-05 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了DACT2基因在制备心力衰竭治疗药物中的应用。本发明使用体外培养的SD大鼠心肌细胞株H9C2来研究DACT2基因对心力衰竭的治疗作用。本领域技术人员可知,α‑MHC、β‑MHC、ANP、BNP和ANF为心力衰竭的标志物,因此本发明利用H9C2心肌细胞过表达DACT2来研究DACT2基因与心力衰竭治疗的关系。本发明的优点和有益效果:本发明首次发现了DACT2基因表达与心力衰竭相关,可以将其开发为治疗心力衰竭疾病的潜在治疗药物。
  • miRNA-155作为足细胞损伤肾脏诊断标志物的应用-201910679961.2
  • 林栩 - 林栩
  • 2019-07-26 - 2019-11-05 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了miRNA‑155作为肾小球病足细胞损伤的早期诊断标志物中的应用,具体包括在制备肾小球病足细胞损伤诊断试剂或试剂盒或基因探针中的应用,以及在在测试、制备治疗肾小球病足细胞损伤的药物中的应用。本发明在临床上试验证明个体血液及尿液中的miRNA‑155的变化对于肾小球病足细胞损伤的诊断具有较高的灵敏度和特异性。miRNA‑155的表达变化还可用于判断足细胞的损伤程度,本发明将为肾小球病足细胞损伤提供新的诊断方法,为肾小球病足细胞损伤提供新的靶向物,为足细胞损伤肾病药物的开发和制备提供了新的靶向物。
  • LOC105373033的新用途-201910866232.8
  • 董东;任静 - 北京泱深生物信息技术有限公司
  • 2019-09-12 - 2019-11-05 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了LOC105373033基因在诊断脓毒症中的用途。脓毒症患者的血液中LOC105373033含量与健康人之间存在显著差异,根据差异可以区分脓毒症患者和非脓毒症患者。本发明还公开了脓毒症的诊断产品,该诊断产品可以通过检测血液中LOC105373033来实现脓毒症的诊断目的。
  • 鉴定和使用小RNA预测因子的方法-201880018238.3
  • D.萨尔兹曼 - 小分子RNA分析股份有限公司
  • 2018-01-23 - 2019-11-05 - C12Q1/6883
  • 本发明提供了一种鉴定或检测疾病或病状的小RNA(sRNA)预测因子的方法。所述方法包括鉴定存在于实验组群的一个或多个样品中而不存在于比较组群中的一个或多个sRNA序列;并且任选地鉴定存在于比较组群的一个或多个样品中而不存在于实验组群中的一个或多个sRNA序列。与鉴定失调的非编码RNA(诸如上调或下调的miR)截然不同,本发明鉴定作为双重预测因子,即存在于一个组群(例如,实验组群)而不存在于另一个组群(例如,比较组群)中的sRNA。进一步地,通过量化单个序列(例如,iso‑miR)的读段,无需将读段合并为带注释的参考序列,本发明揭示了miR和其它sRNA的诊断效用。
  • 用于检测高血压用药相关基因多态性的试剂盒和方法-201910360574.2
  • 夏昊强;周煌凯;刘倩;王芳;程祖福;陆嫚云;姚啟聪 - 广州海思医疗科技有限公司
  • 2019-04-29 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了一种用于检测高血压用药相关基因多态性的引物组、试剂盒以及检测方法,引物组选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.360核苷酸序列。本发明提供的引物组在多重PCR捕获后,可直接进行一轮PCR加接头;采用本发明的引物组和试剂盒不但操作简单,减少了实验步骤和检验;而且更进一步的降低DNA文库构建的耗材与人力成本;本发明的180对引物所对应的基因位点可指导的用药种类包含高血压治疗六大类高血压常用药,及高血压高并发症药物:抗凝、抗血小板、降糖、醛固酮、他汀类等常用药物,可以为初诊高血压、H型高血压、难治性高血压、高血压并动脉粥样硬化等并发症的人群治疗方案的选择提供指导,使患者尽早得到有效的治疗。
  • 精神分裂症小鼠模型海马lncRNA测序分析及试剂盒-201910375408.X
  • 张理义 - 中国人民解放军联勤保障部队第九0四医院
  • 2019-05-07 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明属于生物技术领域,涉及精神分裂症神经发育小鼠模型海马生物标记物、检测方法及试剂盒。本发明提供:①一种精神分裂症神经发育小鼠模型海马生物标记物,为lncRNA2、lncRNA4、lncRNA5、lncRNA6,上述标记物的检测方法以及检测上述标记物含量的试剂盒;②还提供了一种精神分裂症神经发育小鼠模型海马干预的生物标记物,为lncRNA6,上述标记物的检测方法以及检测上述标记物含量的试剂盒;③提供海马中差异表达lncRNA6的GO/KEGG富集分析结果及lncRNA‑TF关系网络图。本发明的有益效果在于佐证了小鼠孕期神经损害、出生后应激刺激可致精神分裂样模型,并首次发现其海马lncRNA具有表达水平差异性,该变化可被奥氮平干预所逆转,这对精神分裂症发病与表观遗传学的关系及寻找其新药具有重要意义。
  • 一种LncRNA标记物及其在糖尿病中的应用-201910419178.2
  • 娄培安;张盼;杜阳光 - 徐州市疾病预防控制中心(徐州市健康教育所)
  • 2019-05-20 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明属于生物检测领域,具体涉及一种LncRNA标记物及其在糖尿病中的应用。本发明成功检测出LncRNA分子标记物NONHSAT024449在糖尿病患者血液中具有比较明显的表达差异,与正常人群对照组相比,糖尿病人群实验组患者具有低表达的LncRNA分子标记物NONHSAT024449,基于这一发现,LncRNA分子标记物NONHSAT024449可作为糖尿病分子标志物或靶点应用于糖尿病临床诊断或靶向治疗,通过检测本发明所提供的LncRNA分子标记物NONHSAT024449的特异性引物对可以实现糖尿病的早期筛查、预防/评估糖尿病的发生风险,将LncRNA分子标记物NONHSAT024449应用于制备糖尿病诊断产品或制备糖尿病预防/评估产品中,有利于进一步阐明糖尿病发生发展机理、信号通路等,极具应用前景和理论价值。
  • 单核苷酸多态性rs2178077在筛查落叶型天疱疮患者中的应用-201611109289.6
  • 刘红 - 山东省皮肤病性病防治研究所
  • 2016-12-06 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了单核苷酸多态性rs2178077在筛查落叶型天疱疮患者中的应用。本发明所保护的技术方案是检测人基因组中rs2178077的多态性或基因型的物质在制备筛查落叶型天疱疮患者产品中的应用及检测人基因组中rs2178077的多态性或基因型的物质在制备检测与落叶型天疱疮相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs2178077的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与落叶型天疱疮相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查落叶型天疱疮患者的产品。
  • 单核苷酸多态性rs3888722在筛查落叶型天疱疮患者中的应用-201611113539.3
  • 张福仁 - 山东省皮肤病性病防治研究所
  • 2016-12-06 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了单核苷酸多态性rs3888722在筛查落叶型天疱疮患者中的应用。本发明所保护的技术方案是检测人基因组中rs3888722的多态性或基因型的物质在制备筛查落叶型天疱疮患者产品中的应用及检测人基因组中rs3888722的多态性或基因型的物质在制备检测与落叶型天疱疮相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs3888722的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与落叶型天疱疮相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查落叶型天疱疮患者的产品。
  • 单核苷酸多态性rs181206在筛查麻风患者中的应用-201611117028.9
  • 刘红 - 山东省皮肤病性病防治研究所
  • 2016-12-07 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了单核苷酸多态性rs181206在筛查麻风患者中的应用。本发明所保护的技术方案是检测人基因组中rs181206的多态性或基因型的物质在制备筛查麻风患者产品中的应用及检测人基因组中rs181206的多态性或基因型的物质在制备检测与麻风相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs181206的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与麻风相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查麻风患者的产品。
  • 单核苷酸多态性rs55882956在筛查麻风患者中的应用-201611117680.0
  • 刘红 - 山东省皮肤病性病防治研究所
  • 2016-12-07 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了单核苷酸多态性rs55882956在筛查麻风患者中的应用。本发明所保护的技术方案是检测人基因组中rs55882956的多态性或基因型的物质在制备筛查麻风患者产品中的应用及检测人基因组中rs55882956的多态性或基因型的物质在制备检测与麻风相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs55882956的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与麻风相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查麻风患者的产品。
  • 单核苷酸多态性rs780668在筛查麻风患者中的应用-201611116080.2
  • 刘红 - 山东省皮肤病性病防治研究所
  • 2016-12-07 - 2019-11-01 - C12Q1/6883
  • 本发明公开了单核苷酸多态性rs780668在筛查麻风患者中的应用。本发明所保护的技术方案是检测人基因组中rs780668的多态性或基因型的物质在制备筛查麻风患者产品中的应用及检测人基因组中rs780668的多态性或基因型的物质在制备检测与麻风相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs780668的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与麻风相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查麻风患者的产品。
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

400-8765-105周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top