[发明专利]一种生物标志物组合及其在预测子宫内膜癌患者预后方面的应用在审
申请号: | 202111264793.4 | 申请日: | 2021-10-28 |
公开(公告)号: | CN113801938A | 公开(公告)日: | 2021-12-17 |
发明(设计)人: | 袁奕;范许云;方军;何胜祥 | 申请(专利权)人: | 安徽同科生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/113;C12N15/11;G16H50/50 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 黄益澍 |
地址: | 237372 安徽省六安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 生物 标志 组合 及其 预测 子宫 内膜 患者 预后 方面 应用 | ||
1.一种生物标志物组合,其特征在于,所述生物标志物组合包括以下3种lncRNAs标志物:lncRP1-63M2.7、lncCDKN2A-AS1和lncCTB-186G2.1;
较佳地,所述生物标志物组合由lncRP1-63M2.7、lncCDKN2A-AS1和lncCTB-186G2.1组成;和/或,
所述生物标志物组合来源于子宫内膜癌患者的癌组织样本。
2.一种用于检测如权利要求1所述的生物标志物组合的表达水平的试剂,其特征在于,所述试剂包括分别或同时与lncRP1-63M2.7、lncCDKN2A-AS1和lncCTB-186G2.1特异性杂交的生物分子,所述生物分子例如引物、探针和/或抗体。
3.一种试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的生物标志物组合和/或如权利要求2所述的试剂。
4.如权利要求2所述的试剂和/或如权利要求3所述的试剂盒在制备评估子宫内膜癌患者预后的诊断产品中的应用。
5.一种建立评估子宫内膜癌患者预后风险模型的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
S1数据分割步骤:在R软件survival包中输入子宫内膜癌患者的数据,所述数据包括如权利要求1所述的生物标志物组合的表达量数据,任选一部分子宫内膜癌患者的数据作为训练集;
S2构建模型步骤:对所述训练集采用所述R软件survival包运行多因素Cox风险回归分析,进行lncRNAs的预后风险评分,设定Risk score=(β1×表达量lncRP1-63M2.7)+(β2×表达量lncCDKN2A-AS1)+(β3×表达量lncCTB-186G2.1);其中,所述lncRP1-63M2.7、lncCDKN2A-AS1和lncCTB-186G2.1的表达量分别用表达量lncRP1-63M2.7、表达量lncCDKN2A-AS1和表达量lncCTB-186G2.1表示,β1、β2和β3分别是指lncRP1-63M2.7、lncCDKN2A-AS1和lncCTB-186G2.1在上述R软件survival包中的回归系数;
较佳地,所述子宫内膜癌患者的入选标准为:(1)患者临床信息完整;(2)患者总生存时间或随访时间大于30天;
更佳地,所述方法还包括S3优化模型步骤:重复步骤S1-S2,根据所述Risk score公式,计算所述训练集每个患者的Risk score值,以所有训练集患者Risk score值的中位值为分割点,将训练集患者分为高Risk score值组和低Risk score值组,绘制ROC曲线,并计算ROC曲线下面积(AUC值),例如3年和/或5年生存时间的AUC值;选择AUC0.7、优选AUC>0.8对应的Risk score公式作为评估子宫内膜癌患者预后风险模型;和/或
S4模型验证步骤:在得到S2或S3所述Risk score公式后,利用剩余不同于训练集的子宫内膜癌患者数据作为测试集来计算各患者的所述Risk score值,以所述测试集中患者Risk score的中位值为阈值将测试集内子宫内膜癌患者分为两组,Risk score值高于阈值的子宫内膜癌患者为高风险组,Risk score值小于等于阈值的子宫内膜癌患者为低风险组,采用所述R软件中Kaplan-Meier生存曲线分析对比两组间患者的生存时间和生存状态是否具有统计学显著性差异。
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