本发明涉及一种番木瓜环斑病毒基因及其RNAi表达载体的构建方法,所述番木瓜环斑病毒基因为CP、Hc-Pro、NIb基因,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列;以感染番木瓜环斑病毒番木瓜叶片为材料,提取总RNA,反转录为cDNA,以CP、Hc-Pro、NIb为靶标干扰基因的保守区域,通过遗传转化,分别将其构建成高效、稳定抗病毒植物表达载体,从而得到具有抗病毒植株。本发明利用CP、NIb、Hc-Pro基因片断保守序列构建RNAi表达载体,并且将RNAi的高效抗病设计理念引入到番木瓜的抗病基因工程育种中,可用于创造高效、广谱抗PRSV病毒病的新种质。
本发明属于生物信息学和基因工程领域,番木瓜环斑病毒海南分离物PRSV-HN-y1基因组序列具有SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示序列。本发明还公开了一种高通量Small RNA测序获得番木瓜环斑病毒海南分离物PRSV-HN-y1全基因组序列的克隆方法。本发明的研究结果首次证实高通量Small RNA测序可以用来进行感染番木瓜疑似病毒样品的病原鉴定、检测及病毒全基因组测序。