[发明专利]一种环状RNA生物标志物的应用

说明书

本发明涉及一种环状RNA生物标志物的应用，尤其是hsa_circ_0001666在食管癌中的应用。本发明通过构建食管癌患者相关的环状RNA表达谱，发现环状RNA生物标志物hsa_circ_0001666及其表达水平与食管癌的相关性；与癌旁正常组织相比，hsa_circ_0001666在食管癌癌灶中表达水平下调。本发明通过细胞功能学研究，发现过表达hsa_circ_0001666可以抑制食管癌细胞增殖、迁移和侵袭表型，表明其在食管癌的发生发展过程中具有重要的调节作用。本发明揭示了hsa_circ_0001666在食管癌辅助诊断和治疗中的作用，为临床上食管癌患者的发现和治疗提供支持。

技术领域

本发明涉及一种环状RNA生物标志物的应用，尤其是hsa_circ_0001666在食管癌中的应用，属于分子生物技术、预防医学和临床医学技术领域。

背景技术

据申请人了解，食管癌是消化系统常见的恶性肿瘤，具有较高的发病率和死亡率。据统计，2018年全球新发食管癌病例达57万，死亡约50万。中国是食管癌发病率和死亡率最高的国家之一，2015年我国食管癌新发病例约48万，其中男性32万，女性16万，死亡约37万，其中男性25万，女性12万。食管癌的病理类型主要包括鳞癌和腺癌，我国食管癌患者以鳞癌为主要亚型，占90％以上。食管癌的发生与吸烟、饮酒等不健康行为，长期食用腌制食品、高盐饮食、喜烫食、进食速度快等不良饮食习惯，EBV和HPV等病原体感染等有关。然而家庭聚集现象以及在相同暴露下只有少数人患病的事实表明，个体遗传因素同样重要。虽然近年来手术、放疗、化疗和分子靶向治疗等取得了显著进展，但食管癌患者的预后仍然不佳，发展中国家食管鳞癌患者的5年生存率仅为20％，主要原因是食管癌早期多无明显症状，不易发现，多数患者被诊断时已发展为晚期。因此，寻找一种灵敏、特异、易操作的生物标志物和药物作用靶点，对食管癌早发现、早诊断、早治疗并有效改善预后具有重要意义。

非编码RNA(ncRNA)是一种常见的表观遗传改变，主要在真核生物中表达。丰富且功能重要的ncRNA主要包括转运RNA(tRNA)，核糖体RNA(rRNA)，microRNA(miRNA)，小干扰RNA(siRNA)，长非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)等。随着高通量测序技术和生物信息学的不断进步和应用，诸多研究发现ncRNA与阿尔茨海默病、心血管疾病和各种肿瘤等疾病的发生、发展有关。早期的ncRNA研究主要集中在miRNA和lncRNA，但近年来circRNA的作用日益受到重视。circRNA是通过反向剪切将5’端和3’末端以共价结合方式形成的环形闭合RNA分子，曾经被认为是基因副产物或错误剪切而形成的副产物，但越来越多的证据表明，circRNA在生物体内普遍存在，对生命活动具有重要的表观遗传调控作用。根据剪切来源，circRNA可分为外显子环状RNA(exonic circular RNA，ecircRNA)、内含子环状RNA(circular intron RNA，ciRNA)和外显子-内含子环状RNA(exon-intron circular RNA，EIciRNA)。

circRNA最早于上世纪70年代在RNA病毒中被发现，但一直被误认为是无用的副产品低丰度RNA分子。随着高通量测序和生物信息学的发展，研究发现circRNA其实在人体多种肿瘤组织、细胞中是广泛表达的，有时甚至超过线性RNA表达量的10倍之多，且具有组织、细胞、发育阶段和疾病特异性。与线性RNA的产生模式不同，circRNA的独特的闭合环状结构能保护其免受外切酶的影响，因而是一种潜在的表达稳定的生物标志物。