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[发明专利]用于检测基因融合突变的引物/探针组合、试剂盒及其使用方法-CN201810956110.3有效
发明人：张利清;张琴;黄霖霆;曹乾升;李杜衡;张林;任用 -专利权人：江苏先声医学诊断有限公司;南京先声医学检验有限公司;北京先声医学检验实验室有限公司
申请日： 2018-08-21 - 公布日： 2019-08-23 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明涉及用于检测基因融合突变的引物/探针组合、试剂盒及其使用方法。其中，所述引物/探针组合包括下组中的至少一种、两种或三种：用于检测ALK基因融合突变的引物/探针组1，所述引物/探针组1包括引物1～8和探针1～2；用于检测RET基因融合突变的引物/探针组2，所述引物/探针组2包括引物9～13和探针3；用于检测ROS1基因融合突变的引物/探针组3，所述引物/探针组3包括引物14～21和探针4～6。本发明所述引物/探针组合、试剂盒及其使用方法能够实现在单一检测孔中同时检测cfRNA样本中ALK基因9种融合突变，或RET基因4种融合突变，或ROS1基因的9种融合突变，具有特异性好、灵敏度高，检测准确等优点
引物突变探针组基因融合探针组合检测试剂盒探针融合单一检测灵敏度基因样本

[发明专利]一种用于检测靶基因是否发生融合突变的方法、引物组合、试剂盒及其应用-CN201811192208.2有效
发明人：张超;李杜衡;石亚辉;陈斌;任用 -专利权人：江苏先声医学诊断有限公司;南京先声医学检验有限公司
申请日： 2018-10-12 - 公布日： 2019-12-27 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明涉及一种设计用于检测靶基因是否发生融合突变的引物组合的方法、引物组合、试剂盒及其应用。本发明所述引物设计方法沿可能的基因融合发生方向依次设计多条引物，组成引物组合，所述引物组合的引物沿基因融合发生的方向延伸，能够对发生未知融合的靶基因进行定向富集，克服现有扩增子测序方法无法靶向富集未知融合基因的缺点，有利于基因未知融合类型的发现和检测；同时，相邻两个引物之间的间隔为约0～130bp，对高度片段化的样本(如cfDNA、FFPE样本)的富集效果好。本发明还针对肺癌基因融合突变(包括ALK基因、NTRK1基因、RET基因、ROS1基因、FGFR3基因和NTRK3基因的融合突变)的检测设计引物组合，并对引物序列进行多轮检测和优化，最终获得对测序数据覆盖的均一性达85％以上，捕获效率达92％以上的引物组合，成功实现对多种肺癌基因未知融合突变的有效检测。
引物组合融合突变基因靶基因检测富集引物肺癌基因基因融合试剂盒样本测序数据方向延伸融合基因设计引物引物设计有效检测对引物均一性扩增子片段化靶向测序多轮捕获应用覆盖优化成功发现

[发明专利]一种检测多个样品时测序文库的构建方法及其应用-CN201910056472.1在审
发明人：周骋 -专利权人：北京爱普益生物科技有限公司
申请日： 2019-01-18 - 公布日： 2019-05-24 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测多个样品时测序文库的构建方法及其应用，该构建方法包括：步骤一、根据基因组DNA序列分别设计上游引物和下游引物；步骤二、在每条上游引物上添加A接头和第一标签，得到上游融合引物，在每条下游引物上添加P接头和第二标签，得到下游融合引物，并将上游融合引物与下游融合引物混合得到混合融合引物；步骤三、将混合融合引物、基因组DNA、含有Mg²⁺，dNTPs，Taq酶的Tris‑HCl缓冲液和无核酸酶水配制成多重PCR反应体系；步骤四、将得到的多重PCR反应体系进行PCR反应、纯化得到多样品测序文库；本发明构建方法通过上下游引物上不同标签组合识别样品，能够大大降低引物合成量，此外，还能够减少扩增次数，有效降低样品间的数据不均衡
融合引物构建测序文库多重PCR反应上游引物下游引物种检测标签基因组DNA序列无核酸酶水基因组DNA 标签组合引物合成上游不均衡多样品缓冲液扩增引物应用

[发明专利]基于高通量测序法的甲状腺癌检测产品及用途-CN202010864045.9有效
发明人：董磊;刘蕊;谢嘉玲;李扬 -专利权人：上海交通大学医学院附属瑞金医院;上海鹍远生物技术有限公司;江苏鹍远生物技术有限公司
申请日： 2020-08-25 - 公布日： 2021-08-17 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明属于生物技术领域，具体涉及一种甲状腺癌检测用引物组合，包括DNA PCR引物和RNA PCR引物，所述DNA PCR引物包括ATM基因突变检测引物对、BRAF基因突变检测引物对、HRAS基因突变检测引物对、NRAS基因突变检测引物对、PTEN基因突变检测引物对、RET基因突变检测引物对、TERT基因突变检测引物对、TG基因突变检测引物对、TP53基因突变检测引物对、TSHR基因突变检测引物对、TTN基因突变检测引物对；所述RNA PCR引物包括RET基因融合检测引物对、NTRK3基因融合检测引物对、BRAF基因融合检测引物对。本发明能够同时检测DNA突变和RNA融合。单个样本检测测序数据量降低至0.2M reads以下，大幅降低测序成本。由于DNA突变和RNA融合在在同一体系完成试验，减少操作工作量。
基于通量测序法甲状腺癌检测产品用途

[发明专利]一步法快速构建扩增子文库的引物组合-CN201710218530.7有效
发明人：阎海;王思振;焦宇辰;徐大勇;郑乔松;师晓 -专利权人：北京泛生子基因科技有限公司
申请日： 2017-04-05 - 公布日： 2020-02-21 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一步法快速构建扩增子文库的引物组合，其包括：根据目标扩增子设计的上游融合引物，所述上游融合引物包括第一接头序列和根据目标扩增子设计的特异性上游引物序列；根据目标扩增子设计的下游融合引物，所述下游融合引物包括第二接头序列和根据目标扩增子设计的特异性下游引物序列；上游通用引物，所述上游通用引物包括第三接头序列、barcode序列和第一接头序列；和下游通用引物，所述下游通用引物包括通用序列和第二接头序列。运用该融合引物组合可以简便、快速的经1步构建扩增子文库，且由于在PCR起始前就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低。
一步法快速构建扩增文库引物组合

[发明专利]用于检测白血病BCR-ABL融合基因的引物组及其应用-CN202210874892.2在审
发明人：林勇平;程猛 -专利权人：广州医科大学附属第一医院（广州呼吸中心）
申请日： 2022-07-25 - 公布日： 2023-03-24 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及一种用于检测白血病BCR‑ABL融合基因的引物组及其应用，属于医学检测技术领域。该引物组包括扩增引物对，所述扩增引物对包括上游引物和下游引物，所述上游引物选自与BCR‑ABL融合基因的BCR基因e1至b3外显子区域互补的序列，所述下游引物选自与BCR‑ABL融合基因的ABL基因a2本发明的用于检测白血病BCR‑ABL融合基因的引物组，可用于CRISPR/Cas检测系统中，能够实现BCR‑ABL融合基因的检测，且具有检测过程简单、快速，检测灵敏度高，不依赖复杂仪器设备及专业操作人员等优势
用于检测白血病 bcr abl 融合基因引物及其应用

[发明专利]一种快速构建扩增子文库的融合引物组合-CN201710219007.6在审
发明人：阎海;王思振;焦宇辰;徐大勇;郑乔松;师晓 -专利权人：北京泛生子医学检验实验室有限公司
申请日： 2017-04-05 - 公布日： 2017-06-30 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种快速构建扩增子文库的融合引物组合，其包括根据目标扩增子设计的上游融合引物和根据目标扩增子设计的下游融合引物，其中所述根据目标扩增子设计的上游融合引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第一接头序列、barcode序列、第二接头序列和根据目标扩增子设计的特异性上游引物序列；所述根据目标扩增子设计的下游融合引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第三接头序列和根据目标扩增子设计的特异性下游引物序列。使用该融合引物组合可以简便、快速的经1步PCR构建扩增子文库，且由于在PCR起始时就引入barcode，使得样本及文库间交叉污染的可能性大大降低，并能简化实验场地分区的要求，该融合引物组合还能将单个样品建立文库的成本控制在
一种快速构建扩增文库融合引物组合

[发明专利]用于三代测序建库的融合引物、建库方法、测序方法和建库试剂盒-CN201980082604.6有效
发明人：黄标;黄金;丁芬;朱欢文;田志坚 -专利权人：武汉华大医学检验所有限公司
申请日： 2019-02-13 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：一种用于三代测序建库的融合引物、建库方法、测序方法和建库试剂盒。融合引物从5’端至3’端依次包括同源重组序列、标签序列和特异性扩增引物序列，其中同源重组序列用于将融合引物的扩增产物进行同源重组拼接，标签序列用于区分不同的扩增产物，特异性扩增引物序列用于与靶标序列结合以进行引物延伸使用融合引物扩增靶标序列，对扩增产物进行同源重组拼接，增加测序芯片上样本数量，降低测序成本。
用于三代测序建库融合引物方法试剂盒

[发明专利]针对融合基因进行扩增子测序的引物设计方法-CN201510262143.4在审
发明人：王焱;张蕾 -专利权人：南京科维思生物科技有限公司
申请日： 2015-05-21 - 公布日： 2015-09-09 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种利用Ion Ampliseq^TM Designer工具来设计可用于融合基因的扩增子测序的引物的方法，所述方法包括1）确定融合基因序列信息；2）扩增子引物设计；3）正反向引物选择；4）引物及扩增子序列确认等步骤。本发明使得可以采用Ion Ampliseq^TM Designer工具来设计可用于融合基因的扩增子测序的引物，从而使得采用扩增子测序方法来检测融合基因成为可能，而突破现有融合基因检测的缺陷
针对融合基因进行扩增子测序引物设计方法

[发明专利]一种用于边合成边测序的测序仪的通用型PCR扩增融合引物-CN201610405876.3在审
发明人：钟宏彬;骆备;陈俊清;刘娜 -专利权人：深圳华大基因股份有限公司
申请日： 2016-06-08 - 公布日： 2017-12-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于边合成边测序的测序仪的通用型PCR扩增融合引物，该融合引物是一套由多条引物组成的引物组合，其中每条引物由5’端至3’端依次包括用于固定所述融合引物于固体介质的连接序列片段（101），用于区分不同样本的标签序列片段（102），用于与测序引物配对的测序序列片段（103），用于在不同样本之间的扩增片段中形成碱基差异以平衡碱基的差异序列片段（104），以及用于捕获目标区域的扩增引物序列片段（105），其中所述多条引物之间的所述差异序列片段（104）互不相同。使用本发明的融合引物能够减少扩增步骤，实现碱基平衡，使扩增的PCR产物测序质量更高。
一种用于合成边测序测序仪通用型 pcr 扩增融合引物

[发明专利]基于毛细管电泳片段分析和一代测序结合的融合基因核酸检测方法-CN202011585310.6在审
发明人：刘金超;刘孔尚;刘明坤;叶锋 -专利权人：北京思尔成生物技术有限公司
申请日： 2020-12-28 - 公布日： 2021-03-26 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：本发明公开了基于毛细管电泳片段分析和一代测序结合的融合基因核酸检测方法。本发明提供了一种检测多个融合基因的试剂盒，包括多对扩增引物对；每对所述扩增引物由引物A和引物B组成；所述引物A从5'端起依次由用于结合测序引物的接头序列A和与所述融合基因的靶序列特异结合的特异序列A；所述引物B从5'端起依次由用于调整扩增产物长度的接头序列B和与所述融合基因的靶序列特异结合的特异序列B；所述引物A的5’端修饰荧光基团。本发明通过将毛细管电泳片段分析和一代测序相结合，实现了基于融合基因核酸的多重检测和序列的同步获取，使得在进行基于片段分析的多重检测的同时，对于阳性融合基因进行一代测序获取其具体序列。
基于毛细管电泳片段分析一代结合融合基因核酸检测方法

[发明专利]快速检测ROS1基因融合突变的引物对、探针、试剂盒及其使用方法-CN202011587669.7在审
发明人：段小红;杨春燕;张腾龙;赵梓君;承康平;周启明 -专利权人：杭州求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-12-29 - 公布日： 2021-03-26 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及数字PCR技术领域，尤其是指快速检测ROS1基因融合突变的引物对、探针、试剂盒及其使用方法，包括用于检测ROS1基因融合突变的引物对和探针，所述引物对和探针根据待测靶标区域设计；根据上述引物对和探针提供一种快速检测ROS1基因融合突变的试剂盒，试剂盒包括上述的引物对和探针；所述引物对、探针或试剂盒地使用方法，该方法包括以下步骤：S1，提取获得肿瘤组织RNA样本；S2，使用上述引物对、探针或试剂盒对RNA样本进行数字PCR反应；S3，判读样本是否发生ROS1基因融合突变。本发明的方法不受融合伴侣和融合位点影响，能够准确发现导致ROS1基因转录异常的基因融合，同时检测已知和未知融合变异，避免假阴性，实验操作简单，检测周期短，性价比高。
快速检测 ros1 基因融合突变引物探针试剂盒及其使用方法

[发明专利]检测融合基因变异的引物组、试剂盒及方法-CN202211552299.2在审
发明人：黄晓强;贺亮;沈建如;刘灿;凌宝;马骥 -专利权人：深圳金域医学检验实验室
申请日： 2022-12-05 - 公布日： 2023-03-07 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测融合基因变异的引物组、试剂盒及方法，根据15个实体瘤常见的140对融合基因容易发生断裂的热点外显子，设计了特异性扩增引物组，所述特异性扩增引物组可以覆盖尽可能多的融合基因伴侣；使用该特异性扩增引物，采用单管多重巢氏PCR扩增的方法对融合基因进行检测，可以减少引物冗余，提高引物扩增效率并降低非特异性扩增，使检测的准确性更高。
检测融合基因变异引物试剂盒方法

[发明专利]一种用于定量检测BCR-ABL融合基因的引物和探针组合、试剂盒及其使用方法-CN202011444676.1有效
发明人：黄絮;彭进 -专利权人：凯杰生物工程（深圳）有限公司
申请日： 2020-12-08 - 公布日： 2023-07-18 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本申请公开了一种用于定量检测BCR‑ABL融合基因的引物和探针组合，包括用于特异性扩增BCR‑ABL融合基因的特异性引物对和特异性探针以及用于特异性扩增ABL基因的内标引物对和内标探针；所述特异性引物对包括Seq ID No.1所示序列的上游引物和Seq ID No.2所示序列的下游引物，所述特异性探针为Seq ID No.3所示序列；所述内标引物对包括Seq ID No.4所示序列的上游引物和Seq ID No.5所示序列的下游引物，所述内标探针为Seq ID No.6所示序列；所述特异性引物对和特异性探针以及所述内标引物对和内标探针用于扩增相同的BCR‑ABL融合基因模板。本申请提供的引物和探针组合，能够对BCR‑ABL融合基因模板分别进行扩增，并实现分别建立BCR‑ABL融合基因和ABL基因两套标准曲线，从而实现对样本中BCR‑ABL和ABL的比值进行定量检测。
一种用于定量检测 bcr abl 融合基因引物探针组合试剂盒及其使用方法

[发明专利]检测TCF3-HLF融合基因的引物和方法-CN202010691011.4在审
发明人：李允章;陈雪青;王淑一 -专利权人：杭州艾迪康医学检验中心有限公司
申请日： 2020-07-17 - 公布日： 2020-10-23 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了筛查急性淋巴细胞白血病(ALL)相关融合基因TCF3‑HLF的引物和方法，包括一对筛查TCF3‑HLF融合是否发生的引物和一对进一步确认TCF3和HLF两个基因融合方式的引物。本发明所述引物和方法简单，价格便宜，是临床融合基因筛查的可靠方法。实现了精确分层治疗，在临床上具有重要意义。
检测 tcf3 hlf 融合基因引物方法

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