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[发明专利]测序数据的处理方法及装置-CN201110391826.1无效
发明人：田仕林;周广宇;李瑞强 -专利权人：北京诺禾致源生物信息科技有限公司
申请日： 2011-11-30 - 公布日： 2012-12-19 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开了一种测序数据的处理方法及装置。其中，测序数据的处理方法包括：接收测序序列的第一测序数据；以及筛除第一测序数据中的第一测序片段的测序数据，得到第二测序数据，其中，第一测序片段为测序序列中含有街头序列的测序片段的处理测序数据的方法。通过本发明，解决了现有技术中难以从测序序列中获取高准确性的测序数据的问题，进而达到了从测序序列中获取高准确性的测序数据的效果。
序数处理方法装置

[发明专利]基于生物云平台的测序数据分析系统及方法-CN201910560395.3在审
发明人：郑洪坤;刘东源;罗江华;苗蓉;魏铮;白洁;刘威 -专利权人：北京百迈客云科技有限公司
申请日： 2019-06-26 - 公布日： 2019-10-18 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明实施例提供一种基于生物云平台的测序数据分析系统及方法，包括用户界面模块，用于获取待分析的测序数据，并将测序数据发送到特征提取模块；特征提取模块，用于对接收到的测序数据进行特征提取处理，得到测序数据特征值，根据测序数据特征值获取对应的样本测序数据，并将样本测序数据发送到图表呈现模块；图表呈现模块，用于接收特征提取模块发送的样本测序数据，并将样本测序数据转换成可视化样本图表进行显示；云端综合分析模块，用于根据可视化样本图表对测序数据进行分析，并将分析结果数据发送到图表呈现模块，以生成可视化测序报告图表。本发明实施例提高了测序数据的处理效率，使得测序数据分析方式更加多样化。
测序数据样本特征提取模块呈现模块可视化分析系统云平台用户界面模块综合分析模块特征值获取报告图表处理效率特征提取数据发分析测序云端发送转换

[发明专利]一种基因测序数据排序方法、集成电路及排序设备-CN202110632396.1在审
发明人：谭光明;刘万奇;李叶文;康宁;孙凝晖 -专利权人：中科计算技术西部研究院
申请日： 2021-06-07 - 公布日： 2021-08-13 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开一种基因测序数据排序方法、集成电路及排序设备，属于计算机系统结构设计和数据排序技术领域，提出以下方案：一种基因测序数据排序方法，包括：读取待测序数据所需的存储容量，以判断待测序数据的大小；若待测序数据的大小不超过预设阈值，则将待测序数据在内部存储器排序，若待测序数据的大小超过预设阈值，则将待测序数据在内部存储器和外部存储器分级排序；在对待测序数据排序后，将待测序数据的排序结果写回外部存储器进行存储；本发明提升了基因测序数据排序的性能
一种基因序数排序方法集成电路设备

[发明专利]确定胎儿目标区域单体型的方法和装置-CN201410639577.7有效
发明人：袁媛;王垚燊;朱红梅;易鑫 -专利权人：天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因科技有限公司
申请日： 2014-11-13 - 公布日： 2019-10-11 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：确定胎儿目标区域单体型的方法包括：对孕妇体液中游离核酸的目标区域进行序列测定，以便获得第一测序数据；对胎儿家系成员的相同目标区域进行序列测定，以便获得第二测序数据、第三测序数据和第四测序数据，其中，第二测序数据为胎儿母亲的测序数据，第三测序数据为胎儿父亲的测序数据，第四测序数据为先证者的测序数据；基于第一、第二以及任选的第三测序数据，确定述孕妇体液中的胎儿核酸含量；基于第二、第三和第四测序数据，分别构建胎儿母亲的目标区域单体型和胎儿父亲的目标区域单体型
确定胎儿目标区域体型方法装置

[发明专利]确定胎儿目标区域单体型的方法和装置-CN201410639464.7有效
发明人：袁媛;王垚燊;阿叁;朱红梅;易鑫 -专利权人：天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因科技有限公司
申请日： 2014-11-13 - 公布日： 2019-10-11 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：确定胎儿目标区域单体型的方法包括：对孕妇体液中游离核酸的目标区域进行序列测定，以便获得第一测序数据；对胎儿家系成员的相同目标区域进行序列测定，以便获得第二测序数据、第三测序数据和第四测序数据，其中，第二测序数据为胎儿母亲的测序数据，第三测序数据为胎儿父亲的测序数据，第四测序数据为先证者的测序数据；基于第一、第二以及任选的第三测序数据，确定述孕妇体液中的胎儿核酸含量；基于第二、第三和第四测序数据，分别构建胎儿母亲的目标区域单体型和胎儿父亲的目标区域单体型
确定胎儿目标区域体型方法装置

[发明专利]高通量DNA测序数据匹配增强方法-CN201310714093.X在审
发明人：冯伟兴;贺波;董彦生;陈若雷;王科俊 -专利权人：哈尔滨工程大学
申请日： 2013-12-23 - 公布日： 2014-06-11 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明属于分子生物信息检测领域，具体涉及只用在已有高通量DNA测序数据匹配基础上，基于贝叶斯技术进一步增加测序数据的匹配数量，以提高测序数据的利用效率和实验检测效果的高通量DNA测序数据匹配增强方法。本发明包括：初步匹配高通量DNA测序数据；求取高通量DNA测序数据错配先验概率；计算高通量DNA测序数据错配后验概率；求取高通量DNA测序数据不成功匹配集中数据发生成功匹配的评估值；提取高通量DNA测序数据不成功匹配集中成功匹配数据本发明在原有高通量DNA测序数据匹配映射基础上，通过评估不成功匹配测序数据集中数据发生成功匹配的可能，进一步增加成功匹配映射的数据数量，以提高测序数据的利用效率。
通量 dna 序数匹配增强方法

[发明专利]测序结果分析方法、系统及计算机可读存储介质和电子设备-CN202010865293.5在审
发明人：金欢;樊济才;陈方;孙雷 -专利权人：深圳市真迈生物科技有限公司
申请日： 2020-08-25 - 公布日： 2021-11-02 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供了一种测序结果分析方法。该方法包括：所述测序结果包括第一测序数据和第二测序数据，其中，所述第一测序数据和所述第二测序数据均由多个读段构成，所述第一测序数据中的至少一部分所述读段在所述第二测序数据中存在对应读段，所述测序结果分析方法包括：(a)基于所述第一测序数据和所述第二测序数据各自的至少一部分进行相互校正，以便获得最终序列信息。
结果分析方法系统计算机可读存储介质电子设备

[发明专利]一种宏转录组测序数据处理方法及系统-CN202110578344.0在审
发明人：刘健;田妹;陈娇 -专利权人：南开大学
申请日： 2021-05-26 - 公布日： 2021-08-13 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本公开提供了一种宏转录组测序数据处理方法及系统，获取宏转录组测序数据；对获取的测序数据进行过滤；对过滤后的测序数据进行组装；根据组装后的测序数据和预设基于原核生物的基因结构特征的概率预测模型，得到测序数据中原核生物的基因预测结果；对得到的测序数据基因结构预测结果添加功能注释；根据基因预测结果的基因定量结果，对添加功能注释后的注释结果进行定量处理。本公开通过对测序数据的过滤、组装、基因预测和注释，实现了宏转录组测序数据更准确和快速的处理，实现了宏转录组基因的更精准和高效注释，提高了宏转录组测序数据的后续处理效率。
一种转录序数处理方法系统

[发明专利]基于贝叶斯的高通量DNA测序数据匹配增强方法-CN201410013068.3无效
发明人：冯伟兴;贺波;董彦生;陈若雷;王科俊 -专利权人：哈尔滨工程大学
申请日： 2014-01-13 - 公布日： 2014-05-21 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明属于分子生物信息检测领域，具体涉及一种在已有高通量DNA测序数据匹配基础上，基于贝叶斯技术进一步增加测序数据的匹配数量的基于贝叶斯的高通量DNA测序数据匹配增强方法。本发明包括进行高通量DNA测序数据的初步匹配；求取高通量DNA测序数据错配先验概率；计算高通量DNA测序数据错配后验概率；评估高通量DNA测序数据不成功匹配集中数据发生成功匹配的评估值；提取高通量DNA测序数据不成功匹配集中成功匹配数据。本发明利用贝叶斯技术，在原有高通量DNA测序数据匹配映射基础上，通过评估不成功匹配测序数据集中数据发生成功匹配的可能，进一步增加成功匹配映射的数据数量，以提高测序数据的利用效率。
基于贝叶斯通量 dna 序数匹配增强方法

[发明专利]一种开放共享测序数据批量获取方法及系统、存储介质-CN202310328143.4在审
发明人：赖仞;容明强;谷陟欣;李宗煦 -专利权人：成都佩德生物医药有限公司
申请日： 2023-03-30 - 公布日： 2023-07-04 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：本发明公开一种开放共享测序数据批量获取方法及系统、存储介质，首先获取测序数据JSON；然后根据测序数据JSON得到测序数据链接地址和分类编号；其次根据测序数据链接地址获得测序数据下载地址；最后根据测序数据下载地址批量下载测序原始数据集本方法基于Web页面数据自动获取和批量整合分类信息的Python脚本流程，实现对分类信息标注和原始实验数据一步获取的目的。打破了现有技术中数据壁垒的限制。
一种开放共享序数批量获取方法系统存储介质

[发明专利]RNA测序数据处理的方法和装置-CN201410724856.3在审
发明人：陈利群;姜晓雪;郭阳;周婷婷 -专利权人：北京诺禾致源生物信息科技有限公司
申请日： 2015-08-04 - 公布日： 2015-07-29 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种RNA测序数据的处理方法和装置。该方法包括获取RNA测序数据的文件路径；根据RNA测序数据的文件路径获取包含RNA测序数据的测序数据文件；获取用于对测序数据文件进行筛选处理的查询条件，查询条件至少包括如下任意一种或多种条件：包含至少一个基因名称的基因名称列表以及至少一个样本的基因信息标签；根据查询条件从测序数据文件中查询得到RNA测序数据中满足查询条件的筛选结果；输出RNA测序数据中满足查询条件的筛选结果。通过根据用户输入的感兴趣查询条件对RNA测序数据进行查询，为RNA测序数据的多样化筛选及分析提供了便利，从而使得处理结果更多样化，信息更全面，更具有指导价值。
rna 序数处理方法装置

[发明专利]一种高通量测序数据匹配方法-CN201410376285.9在审
发明人：张艺;何飞;马丰收;邹晓文 -专利权人：晶能生物技术（上海）有限公司
申请日： 2014-08-03 - 公布日： 2016-02-10 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明属于在分子生物学技术领域，本发明属于分子生物信息检测领域，具体涉及在已有高通量DNA测序数据匹配基础上，基于环境平台修正因子增加测序数据的匹配数量，以提高测序数据的利用率的一种高通量DNA测序数据匹配方法本发明包括：获取测序数据；初步匹配高通量DNA测序数据得到匹配成功数据集和匹配失败数据集；设置基于实验平台和环境的匹配修正因子k；用基于修正因子k的模型对匹配失败集中数据重新匹配；提取测序数据匹配失败集中成功匹配数据本发明在原有高通量DNA测序数据匹配映射基础上，通过评估匹配失败测序数据集中数据发生成功匹配的可能，进一步增加成功匹配映射的数据数量，以提高测序数据的利用率。
一种通量序数匹配方法

[发明专利]一种运行于分布式系统的海量测序数据错误修正方法-CN201611186654.3有效
发明人：林劼;江育娥 -专利权人：福建师范大学
申请日： 2016-12-20 - 公布日： 2019-02-15 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开一种运行于分布式系统的海量测序数据错误修正方法，所述分布式系统包括主节点、交换机和若干计算节点，若干计算节点通过交换机连接主节点，所述海量测序数据错误修正方法包括以下步骤：1）对测序数据进行预处理，确定测序数据的分组标准；2）对测序数据进行分区处理，平衡分布式系统各个计算节点的负载并传送测序数据到计算节点；3）对测序数据进行分布式错误修正。本发明所述方法与集中式系统相比，在处理海量测序数据方面具有速度快，精度高，以及成本低等优势。
一种运行分布式系统海量序数错误修正方法

[发明专利]一种基于DNA变异检测的三代数据校正方法-CN201810336881.2有效
发明人：高敬阳;高峰;陈禹保 -专利权人：北京化工大学;北京市计算中心
申请日： 2018-04-16 - 公布日： 2021-06-22 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明提供了属于生物信息技术领域的一种基于DNA变异检测的三代数据校正方法，首先将三代测序数据处理后作为参考序列数据，然后将二代测序数据处理后与其进行比对，得到比对文件。对比对文件进行变异分析检测，可以得到二代测序数据相对于三代测序数据的变异信息，利用变异信息完成对三代测序数据的校正。将DNA变异检测方法应用到三代测序数据纠错中，联合使用二代测序数据与三代测序数据，降低三代数据校正的成本，程序采用多线程的思想，加快三代数据的校正速度。本发明通过联合校正技术解决三代测序技术中存在的高错误率和高成本问题，为后续的三代测序数据变异检测方面奠定基础。
一种基于 dna 变异检测数据校正方法

[发明专利]对宿主样本进行微生物分析的方法和装置-CN201811169458.4有效
发明人：袁剑颖;王子榕;陈晴;孙瑞雪;周加利;吴红龙 -专利权人：深圳华大因源医药科技有限公司;华大生物科技（武汉）有限公司
申请日： 2018-10-08 - 公布日： 2023-04-28 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：该方法包括：(1)采用宿主基因组数据库，对来自于所述宿主样本的测序数据集合进行第一过滤处理，以便从所述测序数据集合中去除能够与所述宿主基因组数据库比对上的测序数据；(2)采用同源数据库，对所述测序数据集合进行第二过滤处理，以便从所述测序数据集合中去除能够与所述同源数据库比对上的所述测序数据；(3)将经过所述第一过滤处理和所述第二过滤处理的所述测序数据集合与微生物基因组数据库进行比对，以便确定所述测序数据集合中来自于所述微生物的微生物测序数据
宿主样本进行微生物分析方法装置

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