本发明涉及多肽药物研发技术领域。具体公开了多肽PDBPE‑001、其药物组合物和用途。本发明首次发现指形龙隙蛛来源的多肽PDBPE‑001,本发明提供的多肽PDBPE‑001包括如下A1或A2的多肽:A1氨基酸序列为SEQ ID NO.1的多肽;A2氨基酸序列为SEQ ID NO.1的氨基酸序列经过取代和/或缺失和/或添加若干氨基酸残基后得到的与SEQ ID NO.1同一性在90%或以上,且与A1具有相同功能的多肽;本发明通过对该多肽进行抗不同凝血酶研究及动物尾血栓模型研究,研究表明其对凝血因子Factor Xa具有显著的抑制作用,可作为现有抗凝血药的替代药物或辅助药物的候选分子。