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[发明专利]一种基于自监督式信号融合的DAS动态范围提升方法和设备-CN202311203512.3在审
发明人：刘泽超;马玲梅;李彩云;朱琛;郑洪坤;彭威;田帅飞 -专利权人：之江实验室
申请日： 2023-09-19 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G06F18/25 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于自监督式信号融合的DAS动态范围提升方法和设备，方法包括：并行获取双路光纤传感数据，即动态范围未受限制但信噪比较低的DAS信号和因动态范围受限而存在相位解卷绕错误的DAS相位信号，输入自设计的自监督式信号融合模型中，求取相位卷绕系数，并取整，根据取整后的相位卷绕系数和第二光纤传感信号，构建解卷绕后的相位估计值并输出。与现有技术相比，本发明可实时有效修正DAS相位信号因动态范围受限而导致的相位解卷绕错误，恢复真实相位，提升动态范围，且不以牺牲信噪比为代价。
一种基于监督信号融合 das 动态范围提升方法设备

[发明专利]基于光程差辅助的大动态范围分布式相位传感方法和装置-CN202311175527.3在审
发明人：田帅飞;马玲梅;朱琛;郑洪坤;刘泽超 -专利权人：之江实验室
申请日： 2023-09-13 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G01H9/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于光程差辅助的大动态范围分布式相位传感方法和装置，包括光程差测量模块、相位测量模块、复用模块、散射增强传感光纤以及数据采集解调系统，将具有高噪声、大动态范围特性的光程差（OPD）解调与具有低噪声、高精度的相位解调相结合，并在数据处理时，利用大动态范围的OPD数据辅助完成低噪声相位数据的解卷绕，校正由于π相位原则导致的相位解卷绕错误，实现大信号的相位解卷绕，在保持系统解调精度的同提升测量动态范围。
基于光程辅助动态范围分布式相位传感方法装置

[发明专利]扫描图像校正方法、装置及设备-CN202310758687.4在审
发明人： 郑洪坤;刘敏;欧阳锋;秦志远;张梦龙 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-06-26 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： G06T5/00 文献下载
摘要：本申请提供一种扫描图像校正方法、装置及设备，涉及空间转录组测序技术领域，该方法包括：在组织切片贴合在生物芯片上的状态下，采集生物芯片的多张视野扫描图像，生物芯片上包括基板图案，基板图案中包括多个关键点，任意相邻的视野扫描图像之间存在重叠区域；根据任意相邻的视野扫描图像之间的重叠区域，对多张视野扫描图像进行融合处理，得到生物芯片的全幅扫描图像；根据基板图案，确定多个关键点在全幅扫描图像中的第一位置信息；根据第一位置信息以及基板图案，对全幅扫描图像进行校正处理，得到目标全幅扫描图像。本申请的方案，实现了生物芯片捕获的基因表达信息和全幅扫描图像表示的区域的准确对齐。
扫描图像校正方法装置设备

[发明专利]单细胞空间转录组测序文库的构建方法-CN202310752018.6在审
发明人： 郑洪坤;刘敏;张梦龙 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-06-25 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供一种单细胞空间转录组测序文库的构建方法，利用一种特定矩阵的空间转录组生物芯片，结合扫描方案实现单细胞级别的转录本分析。利用该方法将组织样本贴到S1000空间转录组芯片上，之后进行背景矩阵扫描、荧光扫描和明场扫描，通过一系列生化反应实现空间转录组信息的捕获，最后结合测序结果及生信算法实现组织样本单细胞分辨率的空间转录本分析。与传统方法相比，本发明解决了市面上常规扫描仪常见的图像拼接问题，并且在空间转录组分析方面可以提供更加准确的单细胞级别分析。该方法主要应用于空间转录组的单细胞分辨率研究。
单细胞空间转录序文构建方法

[发明专利]扫描图像处理方法、装置及设备-CN202310752021.8在审
发明人： 郑洪坤;刘敏;欧阳锋;秦志远;张梦龙 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-06-25 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： G06T3/40 文献下载
摘要：本申请提供一种扫描图像处理方法、装置及设备，涉及空间转录组测序技术领域，该方法包括：在组织切片贴合在生物芯片上的状态下，采集生物芯片的多张二分镜通道子图像和对应的荧光通道子图像；根据多张二分镜通道子图像对应的扫描放大倍数，对生物芯片上包括的基板图案进行放大处理，得到全幅参考图像；根据多张二分镜通道子图像的采集顺序，以及基板图案中包括的多个关键点，确定各二分镜通道子图像在全幅参考图像中的校正位置；根据校正位置，对各二分镜通道子图像对应的荧光通道子图像进行融合处理，得到生物芯片的全幅荧光图像。本申请的方案，实现了生物芯片捕获的基因表达信息和全幅荧光图像表示的区域的准确对齐。
扫描图像处理方法装置设备

[发明专利]基于细胞分割的信息处理方法、装置、设备及存储介质-CN202310752008.2在审
发明人： 郑洪坤;刘敏;秦志远;欧阳锋;张梦龙 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-06-25 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：本发明提供一种基于细胞分割的信息处理方法、装置、设备及存储介质，涉及生物信息技术领域，该方法包括：获取矫正后的扫描图像；扫描图像是基于贴附于生物芯片上的组织切片得到的；对扫描图像进行细胞分割，得到细胞分割结果；基于生物芯片中各条形码微球的固有位置，提取细胞分割结果中的每个细胞所对应的条形码微球的位置信息；基于细胞分割结果中的每个细胞所对应的条形码微球的位置信息，确定各细胞的第一位置信息和相应的条形码微球的统计信息。本发明可以提升细胞分析的效率和准确性。
基于细胞分割信息处理方法装置设备存储介质

[实用新型]玻片控温装置-CN202321316461.0有效
发明人： 郑洪坤;刘敏;齐观凡;郭焕鹏;常桂宽 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-05-26 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： G05D23/20 文献下载
摘要：本实用新型涉及生物医药技术领域，提供了一种玻片控温装置，包括：基座、温控模块、导热板和固定组件；导热板设于基座上；导热板具有背向设置的第一表面和第二表面；温控模块设于导热板的第一表面，以对导热板进行加热与制冷；导热板的第二表面用于放置玻片；固定组件设于基座，固定组件用于将玻片固定于导热板上。本实用新型的玻片控温装置不仅操作便捷，而且能够快速精确地对玻片进行温度控制。
玻片控温装置

[发明专利]一种去除rRNA的方法及其应用-CN202310556821.2在审
发明人： 郑洪坤;张雪川;邓卫友;毕经德;平丽莹 -专利权人：北京百迈客生物科技有限公司;青岛百迈客生物科技有限公司
申请日： 2023-05-17 - 公布日： 2023-08-29 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明涉及生物信息学技术领域，尤其涉及一种去除rRNA的方法及其应用。所述方法包括：针对初始cDNA进行杂交反应之后，进行DSN处理；所述杂化反应包括：在96～100℃条件下处理2～4分钟，后以0.1℃/s的降温速度到68℃，后在68～70℃的条件下处理1.5～2.5小时。本发明针对提取得到的cDNA，采用特定的杂交反应流程，后采用DSN酶处理去除其中的rRNA，在可以减少处理流程所花费的时间的同时，还能够有效提高测序数据质量，得到高质量的植物空间转录组数据。
一种去除 rrna 方法及其应用

[实用新型]生物反应器-CN202321114057.5有效
发明人： 郑洪坤;刘敏;齐观凡;郭焕鹏;张梦龙 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-05-10 - 公布日： 2023-08-29 - 主分类号： C12M1/38 文献下载
摘要：本实用新型涉及生物反应技术领域，提供一种生物反应器，所述生物反应器包括：箱体、温控组件和控制器；箱体包括盖体与载物台，所述盖体能够相对于所述载物台打开或闭合，在所述盖体相对于所述载物台闭合的情况下，所述盖体与所述载物台共同限定出储藏室，所述储藏室用于放置试验样品；温控组件设于所述储藏室；控制器与所述温控组件连接，用于控制所述温控组件工作。本实用新型可以为试验样品快速提供所需温度，并利用储藏室的密闭环境和温控组件的温控作用，为试验样品提供了稳定可控的热源和恒温空间，保证了反应时的温度稳定性，使用方便，便携性好。
生物反应器

[外观设计]单细胞微液滴生成仪（DG2000）-CN202330240716.9有效
发明人： 郑洪坤;刘敏;郭焕鹏;鲁守波;夏凯 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-04-26 - 公布日： 2023-08-22 - 主分类号： 24-01 文献下载
摘要：1.本外观设计产品的名称：单细胞微液滴生成仪（DG2000）。2.本外观设计产品的用途：用于生成微液滴。3.本外观设计产品的设计要点：在于形状。4.最能表明设计要点的图片或照片：立体图1。
单细胞微液滴生成 dg2000

[外观设计]单细胞微液滴生成仪（DG1000）-CN202330240769.0有效
发明人： 郑洪坤;刘敏;郭焕鹏;夏凯;鲁守波 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-04-26 - 公布日： 2023-08-22 - 主分类号： 24-01 文献下载
摘要：1.本外观设计产品的名称：单细胞微液滴生成仪（DG1000）。2.本外观设计产品的用途：用于生成微液滴。3.本外观设计产品的设计要点：在于形状。4.最能表明设计要点的图片或照片：立体图1。
单细胞微液滴生成 dg1000

[发明专利]多参量光纤分布式传感系统及其方法-CN202310672772.9在审
发明人：饶云江;马玲梅;李彩云;郑洪坤 -专利权人：之江实验室
申请日： 2023-06-07 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： G01D5/353 文献下载
摘要：本申请提供一种多参量光纤分布式传感系统及其方法。该系统包括固定波长光源、可调谐光源、调制模块，第一、第二光纤耦合器、第一、第二光纤环形器、FBG阵列、窄线宽FBG、第一、第二光电探测器及数据采集和处理模块。固定波长光源输出的光经第一光纤耦合器分别输入到调制模块和第二光纤耦合器；可调谐光源输出的光进入到调制模块；调制模块的输出端连接第一光纤环形器的第一端口；第一光纤环形器的第二和第三端口连接FBG阵列和第二光纤环形器的第一端口；第二光纤环形器的第二和第三端口连接窄线宽FBG和第二光纤耦合器的另一输入端；第一光电探测器连接窄线宽FBG和处理模块；第二光电探测器连接第二光纤耦合器的输出端和处理模块。
参量光纤分布式传感系统及其方法

[发明专利]一种分布式光纤声波传感系统的偏振衰落抑制装置和方法-CN202211659833.X有效
发明人：王建国;马玲梅;胡威旺;李彩云;庄逸洋;郑洪坤 -专利权人：之江实验室
申请日： 2022-12-23 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： G01H9/00 文献下载
摘要：一种分布式光纤声波传感系统的偏振衰落抑制装置和方法，由窄线宽激光器、1x2光纤耦合器、声光调制器、电光调制器、光纤放大器、光环形器、偏振分束器、光电探测器、AD转换模块和数据处理模块构成。通过调节电光调制器的偏置电压和输入驱动信号的幅度，调制出包含多种不同频率的光脉冲信号，经放大器放大后输入被测光纤，沿光纤返回的瑞利散射信号经由偏振分束器分成偏振态不同的光，每一路光信号再和同样经过偏振分束器的本振光波干涉，对获得的每路干涉信号进行模数转换、频率分离、挑选、解相位、单频加权平均和多频平均算法处理后，得到衰落被有效抑制的相位信号，本发明能够有效地同时抑制分布式声波传感系统中的偏振衰落和相干衰落。
一种分布式光纤声波传感系统偏振衰落抑制装置方法

[发明专利]一种海洋生物单细胞转录组文库的构建方法-CN202310464127.8在审
发明人： 郑洪坤;刘敏;齐双慧;张坦 -专利权人：青岛百创智能制造技术有限公司
申请日： 2023-04-26 - 公布日： 2023-08-04 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种海洋生物单细胞转录组文库的构建方法。所述构建方法包括：获得cDNA、PCR扩增、建库；所述获得cDNA包括制备油包水和反转录；所述制备油包水包括：混合细胞相、beads相和油相；所述细胞相、beads相和油相的体积比为(3～4)：(5.5～6.5)：(21～23)。本发明优化反转录的油包水体系使得海洋生物单细胞在形成油包水进行反转录时不易破碎，在测序后可以得到质量较优的测序数据，显著提高海洋细胞检测效率和准确率。
一种海洋生物单细胞转录文库构建方法

[发明专利]代谢组与其他组学联合分析方法及装置-CN201911380147.7有效
发明人： 郑洪坤;秦刚;张蕾;梁若冰 -专利权人：北京百迈客生物科技有限公司
申请日： 2019-12-27 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： G06F16/28 文献下载
摘要：本发明实施例提供一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置，方法包括：对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系；将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选；对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。本发明实施例实现了代谢组与其他组学的联合分析，且分析结果更加精确。
代谢其他联合分析方法装置

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