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[发明专利]检测基因组编辑-CN201680016496.9有效
发明人： Y·乔夫诺;N·埃雷迪亚;V·帕特尔;S·库珀;J·伯曼;E·赫夫纳 -专利权人：生物辐射实验室股份有限公司
申请日： 2016-03-17 - 公布日： 2021-10-22 - 主分类号： G16B25/20 文献下载
摘要：提供方法、组合物和试剂盒，用于定量细胞基因组或细胞群的基因组中双链断裂的数量或频率。
检测基因组编辑

[发明专利]检测基因组编辑-CN202111186653.X有效
发明人： Y·乔夫诺;N·埃雷迪亚;V·帕特尔;S·库珀;J·伯曼;E·赫夫纳 -专利权人：生物辐射实验室股份有限公司
申请日： 2016-03-17 - 公布日： 2023-09-26 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：提供方法、组合物和试剂盒，用于定量细胞基因组或细胞群的基因组中双链断裂的数量或频率。
检测基因组编辑

[发明专利]植物基因组编辑-CN201980029517.4在审
发明人：陈余荣;A·塞塔里克斯;徐建平;叶旭东 -专利权人：孟山都技术公司
申请日： 2019-05-24 - 公布日： 2021-01-08 - 主分类号： A01H1/00 文献下载
摘要：提供了用于在植物中进行基因组编辑和定点整合的组合物，其包含用重组DNA构建体包覆、处理或施加以用于递送至来自干种子的成熟胚胎外植体的微弹粒子，所述DNA构建体包含编码一个或多个基因组编辑重复序列的序列。还提供了使用所公开的组合物在植物的至少一个细胞中进行基因组编辑和定点整合的方法，以及通过所公开的方法产生的包含编辑的基因组或定点整合的植物、植物部分和种子。
植物基因组编辑

[发明专利]基于生物网络与机器学习的合成致死基因组合预测系统-CN202210246301.7在审
发明人：刘闯;舒胜利;詹秀秀;张子柯 -专利权人：杭州师范大学
申请日： 2022-03-14 - 公布日： 2022-05-31 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了基于生物网络与机器学习的合成致死基因组合预测系统。本发明包括数据采集和预处理模块、特征工程模块、模型算法设计模块、结果评估模块。数据采集和预处理模块包括数据采集、构建基因网络和数据预处理三个子任务，为后续预测任务提供数据基础。特征工程模块提取的特征包基因对网络特征和生物特征；特征提取后，对特征进行相应的统计学分析。本发明从数据挖掘的角度研究合成致死基因组合，通过特征整合与处理等方法实现合成致死基因组合的预测。本发明对潜在合成致死基因组合进行预测，加深了对癌症靶向药物的认识。
基于生物网络机器学习合成致死基因组合预测系统

[发明专利]一种利用特定基因组合的表达特征鉴定肿瘤组织及亚型，以及用以预测患者预后与转移相关的方法-CN200780018571.6有效
发明人：周业自;滕涵菁;陈璇宇;俞松良;杰里米·J·W·陈;杨泮池 -专利权人：怡发科技股份有限公司;达生药物开发公司
申请日： 2007-02-09 - 公布日： 2011-06-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供用于基因表达谱分析的方法，(1)使用含SEQ ID NOS：1-7、8-17或1-17核酸序列的基因组合(gene set)确定人类样本是否为肿瘤；(2)鉴定肿瘤组织是否为腺癌(adenocarcinoma)(使用含SEQ ID NOS：15，18-21核酸序列的基因组合)或鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma)(使用含SEQID NOS：22-27核酸序列的基因组合)；及(3)预测存活的预后及在人体内肿瘤的转移(使用含SEQ ID NOS：19、28-42或SEQ ID NOS：19、29、31、40及42核酸序列的基因组合)，特别是在早期肺癌的人类。基因表达谱优选以cDNA微阵列(microarray)为基础的技术和/或实时反转录聚合酶链式反应(Real-Time RT-PCR)进行，并通过统计方法分析。
一种利用特定基因组合表达特征鉴定肿瘤组织以及用以预测患者预后转移

[发明专利]高效构建基因组大片段删除突变体的方法和应用-CN202210758278.X在审
发明人：祖尧;王宏杰 -专利权人：上海海洋大学
申请日： 2022-06-30 - 公布日： 2022-09-20 - 主分类号： C12N15/89 文献下载
摘要：本发明公开了高效构建基因组大片段删除突变体的方法和应用，在基因簇中确定基因删除的靶点序列，设计特异性CRISPR gRNA靶点序列和扩增引物，以gRNA骨架质粒为模板进行PCR扩增，纯化，体外转录，gRNA与Cas9蛋白显微注射并提取基因组进行PCR扩增，依次经过T7E1酶切和琼脂糖凝胶电泳得到的胶图检测条带灰度值，得到每个条带的亮度体积计算敲除效率，组成最优靶点组合进行显微注射并提取基因组，经过双外侧引物本发明首次采用CRISPR单位点敲除效率评估，筛选CRISPR靶点组合产生高效的基因组大片段删除，可用于脊椎动物的基因组中基因大片段的高效删除。
高效构建基因组片段删除突变体方法应用

[发明专利]使用均聚物折叠测序读段改进对齐-CN202080030040.4在审
发明人： R·格罗思 -专利权人：加利福尼亚太平洋生物科学股份有限公司
申请日： 2020-02-19 - 公布日： 2021-12-07 - 主分类号： G16B30/20 文献下载
摘要：本公开提供了用于解析长且高度相似但不相同的基因组区域以提高组装质量，尤其是多倍体基因组的组装质量的方法、组合物和计算机实施的过程等等。本公开的方面涉及使用均聚物折叠序列读段的精确字符串匹配来确定两个序列是否重叠并因此代表相同的基因组区域(例如，多倍体基因组中的相同单倍型)或序列是否代表不同的基因组区域。
使用均聚物折叠测序读段改进对齐

[发明专利]噬血细胞综合征的高通量测序检测-CN201811286380.4在审
发明人：周剑峰;何旭华;肖敏;张炜 -专利权人：珠海铂华生物工程有限公司
申请日： 2018-10-31 - 公布日： 2020-05-08 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供包括26个基因在内的基因组合、针对此基因组合设计的引物组合，以及它们在高通量测序检测噬血细胞综合征中的应用，通过对构建的高通量测序文库进行测序以及数据分析，可为噬血细胞综合征等疾病的诊断及治疗提供依据
血细胞综合征通量检测

[发明专利]基因组合制备人肿瘤同源重组缺陷、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性分级检测产品的用途-CN202210555507.8在审
发明人：熊耕砚;周利群 -专利权人：北京大学第一医院
申请日： 2022-05-20 - 公布日： 2022-08-05 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及肿瘤分级检测领域，具体涉及基因组合制备人肿瘤同源重组缺陷、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性分级检测产品的用途，所述的基因组合由基因集A和基因片段集B组成，所述的基因组合是从北京大学第一医院的实际的高通量测序数据中
基因组合制备肿瘤同源重组缺陷突变负荷卫星不稳定性分级检测产品用途

[发明专利]一种小麦条锈菌基因组SNP位点组合在小麦条锈菌基因分型中的应用-CN202310187152.6在审
发明人：曾庆东;严浩浩;赵晶;王洁荣;马哲;康振生;韩德俊 -专利权人：西北农林科技大学
申请日： 2023-03-01 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明涉及一种小麦条锈菌基因组SNP位点组合在小麦条锈菌基因分型中的应用，所述小麦条锈菌基因组SNP位点组合包括9365个SNP位点，所述9365个SNP位点的物理位置是基于小麦条锈菌参考基因组Pst_本发明能够高效、便捷、精准、高覆盖率，且经济、快速的进行小麦条锈菌基因分型检测。
一种小麦锈菌基因组 snp 组合基因中的应用

[发明专利]用于鉴定黑果越橘的方法和试剂盒-CN202080029311.4在审
发明人： V·隆戈;D·伯兰达 -专利权人：因德纳有限公司
申请日： 2020-04-06 - 公布日： 2021-11-23 - 主分类号： C12N15/82 文献下载
摘要：本发明提供鉴定植物组合物中的黑果越橘的方法和专门设计用于该方法实施的试剂盒。本发明的方法基于使用PCR扩增对黑果越橘基因组区域中的核酸片段的检测，其中所述基因组区域为内部转录间隔子1、5.8S核糖体RNA基因组区和内部转录间隔子2中的基因组区域。
用于鉴定黑果越橘方法试剂盒

[发明专利]通过DNA甲基化的靶向编辑下调SNCA的表达-CN201980035381.8在审
发明人：奥尼·基巴-法莱克;鲍里斯·坎特 -专利权人：杜克大学
申请日： 2019-04-23 - 公布日： 2021-01-01 - 主分类号： C12N15/63 文献下载
摘要：本发明公开了用于SNCA基因的表观基因组修饰的基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关蛋白(Cas)9的表观基因组修饰剂组合物及其使用方法。
通过 dna 甲基化靶向编辑下调 snca 表达

[发明专利]一种金粟兰属内不同物种的鉴别方法-CN202211626846.7有效
发明人：卢永彬;张强;覃信梅;李鹏伟;姚淑婷 -专利权人：广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
申请日： 2022-12-16 - 公布日： 2023-07-07 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供一种鉴别金粟兰属内不同物种的SNP位点组合，包括12个SNP位点，所述SNP位点组合分别位于金粟兰psaI基因组序列第7和39位，petL基因组序列第59和72位，rpl2基因组序列第93、500、807和811位，psbZ基因组序列第41、58和89位，rps8基因组序列第214位。
一种金粟兰属内不同物种鉴别方法

[发明专利]利用重组核酸内切酶系统的最佳化基因编辑-CN201680027857.X在审
发明人： J·君格;T·亨特;S·费拉瑟 -专利权人：南加利福尼亚大学
申请日： 2016-05-13 - 公布日： 2018-01-19 - 主分类号： C12N9/22 文献下载
摘要：本文描述了用于基因组编辑的方法和组合物。用于基因组编辑的核酸内切酶涉及诱发双链DNA中的断裂，对于此来说，敲入是非常低效的，因为其依赖于通过修复蛋白将同源DNA序列随机整合至断裂位点。为了解决这些问题，本文描述了新颖的重组融合蛋白，所述重组融合蛋白主动在较接近基因组裂解位点处募集线性DNA插入物，提高了大DNA片段整合至基因组的效率。此类对基因组编辑技术的改良允许在不牺牲效率下使用较低的线性DNA浓度，并且可以进一步与例如荧光蛋白报告系统等其它特征组合。
利用重组核酸内切酶系统最佳基因编辑

[发明专利]一种使用多内参基因组合研究牦牛胚胎基因的方法-CN201710054519.1在审
发明人：吴晓云;褚敏;丁学智;梁春年;郭宪;王宏博;裴杰;包鹏甲;阎萍 -专利权人：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
申请日： 2017-01-24 - 公布日： 2017-04-26 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供一种使用多内参基因组合研究牦牛胚胎基因的方法，包括以下步骤（1）提取牦牛胚胎组织的总RNA，反转录为cDNA；（2）使用多个内参基因，分别设计特异性引物进行实时荧光定量PCR反应，得到Ct值；（3）根据步骤（2）获得的Ct值，用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件筛选出最稳定的内参基因组合；（4）将步骤（3）获得的内参基因组合和目的基因一起进行qRT‑PCR反应，计算目的基因在各组织中的相对表达量应用本发明的方法从多个内参基因中筛选出牦牛胚胎各组织中表达最稳定的内参基因，弥补了单一内参基因的不足，对推动牦牛生物技术研究方法的改进具有重要意义。
一种使用内参基因组合研究牦牛胚胎方法