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[发明专利]靶向甲基化测序文库的构建方法及试剂盒-CN202210095196.1有效
发明人：余丽萍;冀长泉;汪彪;胡玉刚;吴强 -专利权人：纳昂达（南京）生物科技有限公司
申请日： 2022-01-26 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种靶向甲基化测序文库的构建方法及试剂盒。其中，该构建方法包括：甲基化文库的构建及靶向甲基化文库杂交捕获的步骤，其中，甲基化文库的构建包括：对片段DNA进行末端修复，甲基化接头连接，将接头连接产物中未甲基化的C碱基转化成U碱基，使用能够识别U碱基的扩增酶进行PCR扩增，得到甲基化文库；靶向甲基化文库杂交捕获包括取甲基化文库进行混样、浓缩，甲基化文库杂交，甲基化文库热洗脱，甲基化文库常温洗脱，靶向甲基化文库扩增和靶向甲基化文库纯化，纯化完成的靶向甲基化文库即为靶向甲基化测序文库应用本发明的技术方案，提供了一种靶向甲基化测序文库的构建方法，该方法更适用于甲基化文库的靶向捕获。
靶向甲基化序文构建方法试剂盒

[发明专利]酚化羟甲基化并羧甲基化木素及其制备方法-CN201610255792.6有效
发明人：耿增超;曹胜磊;王月玲;李鑫;王强;张彤彤;周凤 -专利权人：西北农林科技大学
申请日： 2016-04-21 - 公布日： 2019-04-09 - 主分类号： C08H7/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种酚化羟甲基化并羧甲基化木素及其制备方法，其中酚化羟甲基化并羧甲基化木素的制备方法包括如下步骤：(1)制备酚化木素：用酚和酸将木质素进行酚化得到酚化木素；(2)制备酚化并羟甲基化木素：用碱溶液和醛将所述的酚化木素进行羟甲基化得到所述的羟甲基化木素；(3)将所述的酚化并羟甲基化木素进行羧甲基化得到酚化羟甲基化并羧甲基化木素。本发明方法制备的酚化羟甲基化并羧甲基化木素水溶性和金属离子吸附能力都很强，适合作为螯合微肥使用。
酚化羟甲基化及其制备方法

[发明专利]一种DNA甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法、应用、终端设备及存储介质-CN202211343981.0有效
发明人：王小庆;洪媛媛;王睿;聂佩瑶;夏瑞燕;吕芳;张琦;陈维之;杜波 -专利权人：臻和（北京）生物科技有限公司;臻悦生物科技江苏有限公司
申请日： 2022-10-31 - 公布日： 2023-01-31 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明公开了一种DNA甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法、应用、终端设备及计算机可读存储介质，属于基因检测技术领域。上述甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法是选择位点甲基化转化率与甲基化文库甲基化转化率相关的位点作为参照位点，该评估方法克服了酶学转化法甲基化文库构建过程中甲基化文库C‑T甲基化转化率受碱基序列影响的问题，利用该参照位点甲基化转化率能够快速评估甲基化文库甲基化转化率，并用于DNA甲基化检测中甲基化转化率的质控，方便快捷，解决了传统方法周期长、耗时、耗力等问题。同时提供了终端设备及计算机可读存储介质，能够根据参照位点的甲基化转化率输出文库甲基化转化率或输出文库是否合格的结果。
一种 dna 甲基化序文转化评估方法应用终端设备存储介质

[发明专利]DNA甲基化位点测序文库的构建方法-CN202210881697.2在审
发明人：李凯;廖端芳;张佳;齐捧;肖莉;曾娅玲;传军;李玉婧;何庆;罗晶晶;常蕾 -专利权人：江门市灿明生物科技有限公司
申请日： 2022-07-26 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供一种DNA甲基化位点测序文库的构建方法，本发明采用非甲基化接头和甲基化接头进行甲基化位点的分析和构建甲基化测序文库，其中，甲基化接头利用甲基化依赖性限制性内切酶酶切产生粘性末端利用连接酶引入，识别含有甲基化的C碱基的特定位点并在识别位点侧翼进行酶切。非甲基化接头采用对碎片化核酸填平补A加接头或者利用非甲基化相关的可产生粘性末端的内切酶加接头，当使用甲基化敏感性限制性内切酶时，本发明对部分甲基化位点进行了两次识别过程。本发明提供的甲基化测序文库构建方法，样本需求量小，能够用于单一细胞水平的甲基化定性测序分析和低丰度标本的定量分析，甲基化分析所覆盖的范围广泛，甲基化富集效率高。
dna 甲基化位点测序文构建方法

[发明专利]甲基化标志物组合及甲状腺结节的良恶性预测系统-CN202310699859.5在审
发明人：沈宇玲;来益;徐栋;周佳青;宋琳 -专利权人：上海交通大学医学院附属仁济医院
申请日： 2023-06-13 - 公布日： 2023-08-29 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本申请提供一种甲基化标志物组合及甲状腺结节的良恶性预测系统；所述甲状腺结节的良恶性预测系统包括：CpG位点检测模块，用于采用简化基因组甲基化测序技术检测样本的甲基化标志物组合中，每一甲基化标志物的CpG位点；DNA甲基化水平计算模块，用于根据CpG位点计算甲基化标志物的平均甲基化比例；平均甲基化比例作为甲基化标志物的DNA甲基化水平；模型构建模块，用于基于甲基化标志物组合构建数学模型；概率计算模块，用于根据数学模型和DNA甲基化水平计算样本恶性预测概率；良恶性预测模块，用于根据恶性预测概率预测甲状腺结节良恶性；本申请基于甲基化标志物的DNA甲基化水平，利用数学模型分辨甲状腺结节良恶性，实现了甲状腺结节精准诊断的目的
甲基化标志组合甲状腺结节恶性预测系统

[发明专利]用于宫颈高级别病变和宫颈癌早期检测的组合物及试剂盒-CN202010986280.3有效
发明人：刘沛;王林海;王紫芸 -专利权人：北京起源聚禾生物科技有限公司
申请日： 2020-09-18 - 公布日： 2021-11-26 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了用于宫颈高级别病变和宫颈癌早期检测的组合物及试剂盒，用于宫颈高级别病变和宫颈癌早期检测的组合物，包括FAM19A4基因甲基化引物、甲基化位点对应的探针和甲基化封闭引物，JAM3基因甲基化引物、甲基化位点对应的探针和甲基化封闭引物，PAX1基因甲基化引物、甲基化位点对应的探针和甲基化封闭引物，内参基因GAPDH的1对引物和甲基化位点对应的探针。采用多重多通道荧光和封闭技术手段，通过特异性引物探针与甲基化序列准确识别，加上多条封闭引物的作用将甲基化模板充分释放出来，以及优化的特殊的甲基化DNA聚合酶，对FAM19A4、JAM3和PAX1基因甲基化位点精确检测
用于宫颈级别病变宫颈癌早期检测组合试剂盒

[发明专利]一种DNA甲基化定量系统-CN201810845927.3有效
发明人：禹汇川;骆衍新;白亮亮;唐冠楠;王小琳;李英杰;黄增鸿;黄美近;汪建平 -专利权人：中山大学附属第六医院;中山大学
申请日： 2018-07-27 - 公布日： 2019-12-24 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA甲基化定量系统。该系统包括获取待测DNA样品中，甲基化和非甲基化待测CpG的量的采集构件，以及通过甲基化/(甲基化+非甲基化)×100计算甲基化百分比参数PMR的处理构件。该系统不仅适用于CpG岛内的共甲基化CpG位点的甲基化定量，还尤其适用于针对侧翼序列没有CpG位点的DNA甲基化定量。该方法不需要对照反应和完全甲基化的DNA标准品作为参照，从而可以克服它们带来的缺陷，具有更高的重复性和准确性。
甲基化定量系统非甲基化采集构件侧翼序列处理构件

[发明专利]基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法及系统-CN201911040573.6在审
发明人：刘贇;刘佩茹;邱文青;杜多;张丹丹 -专利权人：复旦大学
申请日： 2019-10-29 - 公布日： 2020-01-14 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明属于生物医学技术领域，具体为基于游离DNA甲基化或羟甲基化差异的主动脉夹层检测方法及系统。本发明方法包括：（一）游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测，包括：整体甲基化或羟甲基化水平有统计学差异；特定位点或区域甲基化或羟甲基化水平有统计学差异；在基因组中的分布规律差异；（二）根据DNA甲基化或羟甲基化差异判别主动脉夹层是否发生本发明系统包括游离DNA甲基化或羟甲基化差异检测模块和主动脉夹层发生判别模块。本发明取材方便，处理简单，避免繁复的手术取材；以DNA甲基化或DNA羟甲基化作为检测标准，这种化学修饰具有稳定的组织特异性，能明确反映组织来源和状态，检测结果稳定可靠。
羟甲基化甲基化主动脉夹层游离DNA 统计学差异取材差异检测模块生物医学技术组织特异性差异检测分布规律化学修饰检测结果判别模块基因组检测位点

[发明专利]一种用于胃癌患者的预后风险评估系统-CN202110121235.6在审
发明人：刘东辉;王旭瑶;孔鹏羽;王超;姜庆鑫;刘威 -专利权人：黑龙江省医院
申请日： 2021-01-28 - 公布日： 2021-06-04 - 主分类号： G16H50/30 文献下载
摘要：一种用于胃癌患者的预后风险评估系统，其特征在于，包括胃癌甲基化数据获取模块、差异甲基化位点获取模块以及预后模型构建模块，胃癌甲基化数据获取模块，用于获取TCGA胃癌甲基化谱以及胃癌甲基化谱数据集GSE30601，差异甲基化位点获取模块用于得到多个高甲基化位点和多个低甲基化位点,预后模型构建模块用于构建每个患者的11‑DNA甲基化位点风险评分公式。
一种用于胃癌患者预后风险评估系统

[发明专利]一种多样本间甲基化差异检测方法及装置-CN201110258798.6有效
发明人：吴红龙;黄树嘉;王俊 -专利权人：深圳华大基因科技有限公司
申请日： 2011-09-02 - 公布日： 2013-03-20 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明提供了一种多样本间甲基化差异的检测方法，该方法包括步骤：获得多组样本的基因组测序片段对应于参考基因组序列上的位置信息以及各个样本的甲基化数据；对在参考基因组序列上滑动的同一判断区间内的各组的甲基化数据进行分析，获取上述组基因组上存在甲基化差异的甲基化差异区域；对同一甲基化差异区域内的各组的甲基化数据进行分析，获取在甲基化差异区域内存在甲基化差异的具体组。本发明还提供了一种多样本间甲基化差异的检测装置。本发明的多样本间甲基化差异的检测方法及装置能查找并检测出多个样本基因组之间存在的甲基化差异性区域以及在该甲基化差异性区域存在甲基化差异的样本组。
一种多样甲基化差异检测方法装置

[发明专利]一种检测DNA主动去甲基化的方法-CN201110077002.7有效
发明人：马端;张进;王慧君;杨璐 -专利权人：复旦大学
申请日： 2011-03-29 - 公布日： 2012-10-10 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明属生物技术领域，涉及一种基因诱导DNA去甲基化的检测方法。本发明利用筛选的已确定甲基化状态的细胞株为基础，收集基因与细胞株的混合克隆并测定其DNA甲基化的状态，对比未转基因的细胞株甲基化状态，得到检测结果。本发明还通过构建人工CpG岛报告基因载体PCBS-luc，体外使用甲基转移酶M.SssI对载体进行甲基化处理，并与anti-hygromycin基因表达载体共转HEK293细胞，使用潮酶素B筛选出完全甲基化、部分甲基化和非甲基化的PCBS稳定整合细胞株。本发明可用于观察目标蛋白去甲基化的功能、检测DNA甲基化或去甲基化的功能、观察组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系，还可用于研究环境因子对于细胞DNA甲基化的影响。
一种检测 dna 主动甲基化方法

[发明专利]一种低甲基化水平的差异甲基化位点识别方法-CN201910145275.7有效
发明人：李敏;胡昕昱;王林丛花;王建新 -专利权人：中南大学
申请日： 2019-02-27 - 公布日： 2022-12-09 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明提供了一种低甲基化水平的差异甲基化位点识别方法，包括以下步骤：S1、获取一种低甲基化水平疾病的多组甲基化芯片数据样本。S2、对多组甲基化芯片数据样本进行预处理，得到甲基化芯片数据集。S3、根据位点维度，将甲基化芯片数据集划分为多个甲基化芯片数据子集；将每一个甲基化芯片数据子集输入构建随机森林模型，迭代进行特征选择，输出甲基化芯片数据的疾病相关特征集。S4、对甲基化芯片数据的疾病相关特征集进行线性拟合处理，之后通过假设检验筛选出具有统计显著性的特征。能识别出传统方法不能筛选出的差异甲基化位点，并且找到的差异甲基化位点具有更好的类别判定性能和显著性意义。
一种甲基化水平差异识别方法

[发明专利]甲基化DNA富集试剂及其制备方法和应用-CN201410361087.5在审
发明人：李伟东 -专利权人：沈阳百创特生物科技有限公司
申请日： 2014-07-25 - 公布日： 2014-11-05 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及甲基化DNA富集试剂及其制备方法和应用。甲基化DNA富集试剂是一种由甲基化结合蛋白和凝胶或磁珠合成的甲基化DNA亲和介质。利用本发明的甲基化DNA亲和介质可建立简单、高效的尿液甲基化DNA富集试剂和DNA转化的一步法。大体积尿液中的甲基化DNA可以通过甲基化结合蛋白的亲和介质富集，提高了检测的灵敏度和速度。富集的甲基化DNA无需进一步的DNA分离纯化，可以直接用于甲基化分析。
甲基化 dna 富集试剂及其制备方法应用

[发明专利]一种DNA 5mC或RNA m6A甲基化酶/去甲基化酶的酶活性检测方法-CN202110556963.X在审
发明人：罗成;肖森豪;陈示洁;郭思岐;陈彦韬;王明晨;蒋华良;陈凯先 -专利权人：中国科学院上海药物研究所
申请日： 2021-05-21 - 公布日： 2022-11-22 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA 5mC或RNA m6A甲基化酶/去甲基化酶的酶活性检测方法。所述方法包括：在所述DNA 5mC甲基化酶/去甲基化酶或者RNA m6A甲基化酶/去甲基化酶的存在下，通过利用荧光偏振、时间分辨荧光能量共振转移(TR‑FRET)或均相光激发化学发光的信号来监测DNA甲基化结合蛋白或者RNA甲基化结合蛋白与带有荧光标记的底物结合状态随时间的变化，进而检测DNA 5mC甲基化酶/去甲基化酶或者RNA m6A甲基化酶/去甲基化酶的酶活性。
一种 dna mc rna m6a 甲基化酶活性检测方法

[发明专利]一种癌症甲基化数据中异常高甲基化区域的识别方法-CN202310235109.2在审
发明人：苏建忠;王心宇;代丽君;李成浩 -专利权人：国科温州研究院（温州生物材料与工程研究所）
申请日： 2023-03-13 - 公布日： 2023-06-06 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种癌症甲基化数据中异常高甲基化区域的识别方法，包括：获取正常组织和癌症组织的甲基化测序数据；基于正常组织甲基化数据识别参考UMRs；基于隐马尔可夫模型和假设检验针对基于参考UMRs从所述正常组织和癌症组织的甲基化测序数据中筛选出异常高甲基化区域；计算所述异常高甲基化区域中高甲基化CpG位点相对于所述参考UMRs中CpG位点的比例和/或长度；基于所述比例和/或长度将所述异常高甲基化区域分为phUMRs或fhUMRs；所述phUMRs表示CpG高甲基化仅发生在UMRs的一部分，所述fhUMRs表示高甲基化发生在整个UMRs。
一种癌症甲基化数据异常区域识别方法

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