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[发明专利]一种基于解链曲线的甲基化DNA检测方法-CN201010283091.6有效
发明人：王建 -专利权人：上海迦美生物科技有限公司
申请日： 2010-09-16 - 公布日： 2012-04-04 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种甲基化DNA检测方法，步骤包括：步骤1，亚硫酸盐处理DNA样品；步骤2，设计并合成PCR引物；步骤3，以标准非甲基化DNA和标准甲基化DNA作为模板分别进行PCR扩增，并测定解链温度；步骤4，对待测DNA样品进行PCR扩增；步骤5，加热PCR扩增产物至标准非甲基化DNA相应的PCR产物的解链温度、和标准甲基化DNA相应的PCR产物的解链温度之间；步骤6，进行消化；步骤7，进行二次PCR扩增并进行解链曲线测定，检测是否存在甲基化DNA。该方法在肿瘤早期检测、个性化治疗、病情判断和复发监控等方面有着重要的意义。
一种基于解链曲线甲基化 dna 检测方法

[发明专利]一种研究基因启动子区DNA甲基化和组蛋白甲基化调控模式的方法-CN202110651600.4在审
发明人：李碧春;张晨;左其生;张亚妮;孙红艳 -专利权人：扬州大学
申请日： 2021-06-11 - 公布日： 2021-08-17 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明涉及一种研究基因启动子区DNA甲基化和组蛋白甲基化调控模式的方法，包括以下步骤：确定DNA甲基化对目的基因的调控、确定组蛋白H3K4me2/3对目的基因的调控、确定DNA甲基化和组蛋白H3K4me2通过本发明，本方法简单可行，具有可行性，操作简便，研究思路清晰可靠，具有广泛应用性，因DNA甲基化和组蛋白甲基化具有高度保守性，因此在不同物种或不同生物学过程中均能使用该方法研究DNA甲基化和组蛋白甲基化对基因表达的调控模式
一种研究基因启动子区 dna 甲基化组蛋白调控模式方法

[发明专利]一种关于胃癌的DNA甲基化谱的降维分析方法-CN201910008143.X有效
发明人：王俊 -专利权人：浙江大学
申请日： 2019-01-04 - 公布日： 2023-04-25 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种关于胃癌的DNA甲基化谱的降维分析方法，通过分析选取具有统计学显著性的甲基化位点，过滤不显著的甲基化位点，保留单因素、多因素皆具有统计学显著性的DNA甲基化位点作为种子甲基化位点，进一步使用一致性聚类分析并获取具有稳定的聚类结果时的分子亚型数目，并最终再通过筛选降维得到数个簇特异性的甲基化位点，本发明能够有效的将高维冗杂的DNA甲基化谱数据降维，从几十万个DNA甲基化位点中筛选出关键的DNA甲基化位点作为生物标志物，对于基因研究以及胃癌的药物开发具有重要意义
一种关于胃癌 dna 甲基化分析方法

[发明专利]从血浆无创测定胎儿或肿瘤的甲基化组-CN201380058654.3在审
发明人：赵慧君;陈君赐;卢煜明;伦妙芬;江培勇;陈渭雯 -专利权人：香港中文大学
申请日： 2013-09-20 - 公布日： 2015-07-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本实施例提供了测定并使用各种组织和样品的甲基化型态的系统、方法和设备。因阐述发明的需要，我们提供了相关的实例说明。基于血浆DNA甲基化(或具有游离DNA的其它样品，例如尿液、唾液、生殖器洗涤液等)与母亲/患者的甲基化型态的比较来推断胎儿/肿瘤组织的甲基化型态。当样品具有DNA混合物时，可以使用组织特定的等位基因以鉴别来自胎儿/肿瘤的DNA，来确定胎儿/肿瘤组织的甲基化型态。甲基化型态可以用于确定胎儿/肿瘤的基因组中的拷贝数变异。通过各种技术鉴别出胎儿的甲基化标记物。可以通过确定DNA片段的尺寸分布的尺寸参数来确定甲基化型态，其中所述尺寸参数的参考值可以用于确定甲基化水平。另外，甲基化水平可以用于确定癌症等级。
血浆测定胎儿肿瘤甲基化

[发明专利]未甲基化核酸的选择性积累-CN201080054931.X在审
发明人：克里斯蒂安·科哈格;安德烈亚斯·梅尔 -专利权人：凯杰有限公司
申请日： 2010-11-23 - 公布日： 2012-08-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及对DNA的未甲基化序列进行选择性扩增的方法，所述方法包含下列步骤：（i）提供包含在至少一个位点处被甲基化的DNA的样品，（ii）用甲基化依赖性核酸酶处理样品中的DNA，以及（iii）使用甲基化依赖性核酸酶扩增切开的DNA。本发明的方法可用于选择性制备（选择性积累）基因组DNA的未甲基化序列区段，并用于分析基因组DNA中的整体甲基化模式。
甲基化核酸选择性积累

[发明专利]使用磁阻生物传感器阵列表征DNA甲基化-CN201880029325.9在审
发明人：李政録;S·X·王;M·F·汉森;M·杜伏威;G·利兹 -专利权人：小利兰·斯坦福大学托管委员会;丹麦技术大学
申请日： 2018-05-01 - 公布日： 2020-01-07 - 主分类号： C12Q1/6825 文献下载
摘要：一种甲基化检测的方法提供了DNA链中甲基化密度的定量描述。亚硫酸氢盐转化[100]含有甲基化和未甲基化位点的DNA链产生具有错配碱基对的转化DNA链。转化DNA链经PCR扩增[102]，并用固定于磁阻(MR)传感器阵列上的互补DNA磁性标记[104]和杂交[106]单链靶DNA链。杂交期间，可以记录结合信号。增加诸如温度或盐浓度之类的严格条件[108]，以使磁性标记的单链靶DNA链从固定于磁阻(MR)传感器阵列上的互补DNA链变性。严格条件增加期间，实时记录产生自变性的磁性标记的单链靶DNA链的变性信号[110]并用于确定甲基化和未甲基化的DNA链的严格条件[112]。DNA链可能还包含野生型基因和突变的基因，因此突变位点可以与甲基化位点同时确定。
磁性标记严格条件甲基化靶DNA 变性单链传感器阵列未甲基化磁阻转化杂交甲基化检测甲基化位点亚硫酸氢盐野生型基因互补DNA链错配碱基结合信号实时记录突变位点互补DNA 位点突变并用基因记录

[发明专利]核酸蛋白双探针SPR生物传感DNA甲基化检测方法-CN200810023797.1无效
发明人：潘世扬;徐建;束永前;张石江;张寄南;王芳;陈丹;黄珮珺;杨笛 -专利权人：潘世扬
申请日： 2008-04-29 - 公布日： 2009-01-28 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种核酸蛋白双探针SPR生物传感DNA甲基化检测方法。本发明以SPR芯片表面包被的核酸探针特异性识别待测样本中靶基因启动子区核酸序列，继而以MBD识别其中含有甲基化的部分，芯片表面形成核酸探针－甲基化靶核酸－MBD蛋白复合物，通过SPR角的变化，实现DNA甲基化的定量检测。本发明开创性的将特异性核酸探针杂交和甲基化CpG结合蛋白的甲基化CpG结合功能域(MBD)特异结合甲基化DNA的特性，借助SPR检测技术平台，建立了核酸蛋白双探针SPR生物传感DNA甲基化检测方法。具有分析速度快、灵敏度高，能检测微量靶DNA甲基化，可同时进行多基因甲基化的联合检测。
核酸蛋白探针 spr 生物传感 dna 甲基化检测方法

[发明专利]一种检测甲基化DNA的单分子分析方法-CN201510582986.2有效
发明人：亢晓峰;王莹 -专利权人：西北大学
申请日： 2015-09-15 - 公布日： 2018-10-26 - 主分类号： G01N27/26 文献下载
摘要：本发明涉及一种检测甲基化DNA的单分子分析方法，是在含四甲基铵盐、四乙基铵盐、四丙基铵盐或四丁基铵盐电解液的电解池中，纳米孔传感器通过电流电化学信号区分和检测不同甲基化水平的DNA，包括未甲基化、单甲基化和多甲基化DNA，DNA包括单链，双链和发卡结构形式。本发明检测甲基化DNA的方法是单分子分析方法，需要样品量少，灵敏度高，具有单碱基分辨率；本发明无需对纳米孔和DNA修饰，无需DNA扩增，无需标记，操作简单易行，具有良好的应用性。
一种检测甲基化 dna 分子分析方法

[发明专利]一种基因组DNA甲基化片段靶向富集和测序方法-CN202211280266.7在审
发明人：王子成;康冬茹;宋盼;李忠爱;艾鹏慧;赵文倩 -专利权人：河南大学
申请日： 2022-10-19 - 公布日： 2023-03-14 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明提供了一种基因组DNA甲基化片段靶向富集和测序方法，属于分子生物学技术领域。本发明中基因组DNA甲基化片段靶向富集方法，包括以下步骤：利用MBD7蛋白制备亲和层析柱，将制备得到的亲和层析柱与基因组DNA片段进行孵育，然后洗脱得到DNA甲基化片段。本发明利用拟南芥MBD7蛋白，可针对植物基因组范围内DNA高甲基化区域进行靶向富集，精确度高。本发明还提供了基因组DNA甲基化片段测序方法，对富集得到的DNA甲基化片段进行二代测序，可降低测序成本，且不依赖基因组信息，适用于基因组甲基化DNA目标区域的测序。
一种基因组 dna 甲基化片段靶向富集方法

[发明专利]一种快速、灵敏检测DNA甲基化的高效DNA步行器的构建方法与应用-CN202210620803.1在审
发明人：豆保婷;周慧;王颇 -专利权人：江苏师范大学
申请日： 2022-06-02 - 公布日： 2022-09-06 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种快速、灵敏检测DNA甲基化的高效DNA步行器的构建方法与应用，包括：制备双金属MOF材料；设计高效的DNA步行器；将双金属MOF材料进行核酸功能化；构建电化学传感界面，检测DNA的甲基化状态本发明中快速、灵敏检测DNA甲基化的高效DNA步行器，利用DNA链转移介导的链置换反应，结合双金属MOF材料的高催化性能，构建了快速、灵敏的DNA甲基化电化学传感平台，可以识别不同甲基化程度的DNA，对相关临床疾病的早期诊断及遗传信息机理研究具有重要意义
一种快速灵敏检测 dna 甲基化高效步行构建方法应用

[发明专利]用于无细胞MeDIP测序的合成加标对照及其使用方法-CN202080092232.8在审
发明人：萨曼莎·L·威尔逊;沈淑怡;丹尼尔·迪尼兹德卡尔瓦霍;迈克尔·M·霍夫曼;蒂莫西·J·特里谢 -专利权人：大学健康网络;范安德尔研究所
申请日： 2020-11-06 - 公布日： 2022-09-20 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本文描述了一种捕获并分析样品中无细胞甲基化DNA的方法。该方法包括对样品进行文库制备以允许随后对无细胞甲基化DNA进行测序。将预定量的对照合成DNA片段加入样品中。对照合成DNA片段各自具有不与目标基因组序列对齐的已知核酸序列，并且至少一些对照合成DNA片段被甲基化。使样品变性，并利用对甲基化多核苷酸具有选择性的结合剂捕获无细胞甲基化DNA和对照合成DNA片段。对捕获的DNA进行扩增和测序。
用于细胞 medip 合成对照及其使用方法

[发明专利]游离DNA甲基化文库构建方法及其文库、应用和试剂盒-CN202310003907.2在审
发明人：叶邦全 -专利权人：京东方科技集团股份有限公司
申请日： 2023-01-03 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：一种游离DNA甲基化文库构建方法及其文库、应用和试剂盒，构建方法包括：提供游离DNA样本并将其变性为单链DNA；将单链DNA两端连接胞嘧啶均有甲基化修饰的接头序列；将连接有接头序列的单链DNA进行延伸反应，形成延伸片段，得到双链DNA；将双链DNA中带有甲基化修饰的胞嘧啶进行氧化反应形成受保护胞嘧啶；除去带有受保护胞嘧啶的双链DNA中的延伸片段，得到带有受保护胞嘧啶的单链DNA；将带有受保护胞嘧啶的单链DNA中未甲基化修饰的胞嘧啶进行脱氨基反应，得到带有尿嘧啶的DNA；将带有尿嘧啶的单链DNA进行扩增反应，得到游离DNA甲基化文库。本公开实施例的构建方法可以提高甲基化检测的准确性和文库产量。
游离 dna 甲基化文库构建方法及其应用试剂盒

[发明专利]DNA组装-CN201880035903.X在审
发明人： D·林;C·奥卡拉汉 -专利权人：牛津大学创新有限公司
申请日： 2018-05-02 - 公布日： 2020-05-01 - 主分类号： C12N15/64 文献下载
摘要：本发明涉及一种用于DNA组装的核酸，其中所述核酸包含至少一个可甲基化保护的限制元件，所述可甲基化保护的限制元件包含：限制酶识别序列，所述限制酶识别序列由切割所述识别序列外部的限制酶识别；和DNA甲基化酶识别序列，其中所述限制酶识别序列和所述DNA甲基化酶识别序列重叠，使得由所述DNA甲基化酶修饰的碱基位于所述限制酶识别序列内，其中所述DNA甲基化酶识别序列与所述限制酶识别序列不同或不被其包括，并且其中所述DNA甲基化酶识别序列不与将形成由所述限制酶产生的悬垂末端序列的序列重叠。
dna 组装

[发明专利]一种DNA甲基化程度的定量方法及应用-CN201810997175.2在审
发明人：罗敏;赵勇娟;韩玥斌;刘焕 -专利权人：天津智鱼生物科技有限公司
申请日： 2018-08-29 - 公布日： 2018-12-18 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明提供了一种DNA甲基化程度的定量方法及应用，所述方法包括以下步骤：(1)将亚硫酸盐修饰的DNA加入PCR体系，进行数字PCR；(2)根据DNA的甲基化拷贝数和非甲基化拷贝数，得到DNA的甲基化程度；其中，步骤(1)所述PCR体系包括Taqman探针，所述Taqman探针包括甲基化Taqman探针或非甲基化Taqman探针。本发明的方法将亚硫酸盐修饰的目的基因分别采用甲基化探针和非甲基化探针进行检测，基于数字PCR准确定量出待检测基因的甲基化拷贝数和非甲基化拷贝数，实现了对目的基因甲基化程度的绝对定量，适用于血液样本中微量
甲基化非甲基化拷贝数目的基因亚硫酸盐数字PCR 修饰检测甲基化探针特异性强血液样本准确定量灵敏度探针应用基因

[发明专利]一种DNA甲基化芯片数据的扩展方法-CN201611158809.2在审
发明人：凡时财;黄康;邹见效;徐红兵;何建 -专利权人：电子科技大学
申请日： 2016-12-15 - 公布日： 2017-05-10 - 主分类号： G06F19/12 文献下载
摘要：本发明公开了一种DNA甲基化芯片数据的扩展方法，通过预测DNA甲基化芯片未覆盖的CpG位点来实现DNA甲基化芯片数据的扩展。具体的讲，对于待预测的CpG位点，先基于DNA甲基化芯片测得的数据和DNA序列提取特征，然后进行特征变换并结合全基因组亚硫酸氢钠测序法测得的待预测点的甲基化值训练随机森林回归模型，最后使用训练好的随机森林回归模型对新数据进行预测
一种 dna 甲基化芯片数据扩展方法