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[发明专利]扩增DNA以维持甲基化状态的方法-CN201880029791.7在审
发明人：曹云龙;X·S·谢 -专利权人：哈佛学院董事及会员团体
申请日： 2018-03-08 - 公布日： 2020-01-31 - 主分类号： C12P19/34 文献下载
摘要：本发明提供了一种制备扩增的甲基化组的方法，所述方法通过延伸片段和用甲基转移酶和甲基源处理延伸的片段，将半甲基化的双链DNA转化成完全甲基化的双链DNA，来制备扩增的甲基化组。
甲基化组双链DNA 扩增制备甲基转移酶半甲基化甲基化延伸转化

[发明专利]调节核酸的甲基化/去甲基化状态的方法和试剂-CN201210256035.2有效
发明人：徐国良 -专利权人：中国科学院上海生命科学研究院
申请日： 2012-07-23 - 公布日： 2013-01-23 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及调节核酸的甲基化/去甲基化状态的方法和试剂。本发明人首次证实，基因组DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)都可以被Tet双加氧酶氧化为5-羧基胞嘧啶(5caC)。胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)可以特异性地识别该5caC，并将其从基因组中切除，引起DNA主动去甲基化。因此，可基于此来调节基因组中DNA的甲基化/去甲基化作用，以及制备调节基因组中DNA的甲基化/去甲基化作用的试剂。本发明确证了细胞中基因组DNA存在5caC修饰，5caC修饰谱式可用来监测细胞状态，并发现ATP及其类似物可以作为Tet酶的调节剂。并且，白血病中Tet突变使5caC活性降低或丧失。
调节核酸甲基化状态方法试剂

[发明专利]一种标准化的DNA甲基化检测标准品及其制备方法、定值方法及应用-CN202310386310.0在审
发明人：韦玉军;刘文干;朱丽君 -专利权人：安徽安龙基因科技有限公司
申请日： 2023-04-07 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： C12Q1/6876 文献下载
摘要：本说明书实施例公开了一种标准化的DNA甲基化检测标准品及其制备方法、定值方法及应用。所述DNA甲基化检测标准品由原始DNA样品和对所述原始DNA样品进行甲基化得到的甲基化DNA样品配制而成，所述原始DNA样品包括目的基因片段、第一核苷酸片段和第二核苷酸片段，所述第一核苷酸片段为如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述第二核苷酸片段为如SEQ ID No.2所示的核苷酸序列，所述甲基化DNA样品包括甲基化后的目的基因片段、对所述第一核苷酸片段甲基化后的第三核苷酸片段和对所述第二核苷酸片段甲基化后的第四核苷酸片段
一种标准化 dna 甲基化检测标准及其制备方法应用

[发明专利]一种基于双标记扩增的血浆循环甲基化DNA电化学检测方法及试剂盒-CN201710626465.1有效
发明人：赵永席;陈锋;曹晓文;王旭耀 -专利权人：西安交通大学
申请日： 2017-07-27 - 公布日： 2019-04-12 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于双标记扩增的血浆循环甲基化DNA电化学检测方法，属于甲基化DNA检测技术领域。本发明使用不同标记(地高辛，生物素)的甲基化特异性引物，通过聚合酶链式反应(PCR)鉴别亚硫酸氢盐修饰的基因组样品中的甲基化DNA而不是非甲基化等位基因；利用聚合酶的扩增能力，产生大量具有地高辛和生物素双标记的双链扩增子该方法具有良好的灵敏度，能检测5pg的甲基化DNA分子，同时具有良好的特异性，能够在有大量非甲基化DNA干扰下检测出1％的甲基化DNA。
一种基于标记扩增血浆循环甲基化 dna 电化学检测方法试剂盒

[发明专利]一种检测DNA甲基化转移酶的纳米金生物传感器、其检测方法及应用-CN202010831729.9有效
发明人：张春阳;王黎娟;韩笑 -专利权人：山东师范大学
申请日： 2020-08-18 - 公布日： 2023-05-05 - 主分类号： C12Q1/48 文献下载
摘要：本发明属于DNA甲基化转移酶检测技术领域，具体涉及一种检测DNA甲基化转移酶的纳米金生物传感器、其检测方法及应用。本发明的方法可以同时检测多种DNA甲基化转移酶，并且该方法特异性好，灵敏度高。本发明使用甲基介导的核酸内切酶GlaI来切割的5‑甲基胞嘧啶(5‑mC)的特异性位点，并且将单分子检测与信号探针的循环裂解相结合，可用于单分子水平上同时检测多种DNA甲基化转移酶；进一步还可以用于区分不同种类的DNA甲基化转移酶，筛选潜在的抑制剂，并可测量人血清样品中DNA甲基化转移酶的活性，在生物医学研究，临床诊断，药物发现和癌症治疗方面具有巨大的潜力。
一种检测 dna 甲基化转移酶纳米生物传感器方法应用

[发明专利]用于DNA高甲基化区域富集的试剂、富集方法及应用-CN201710538910.9有效
发明人：易吉;罗慧娟;朱师达 -专利权人：深圳华大生命科学研究院;广州华大基因医学检验所有限公司
申请日： 2017-07-04 - 公布日： 2021-09-14 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本申请公开了一种用于DNA高甲基化区域富集的试剂、富集方法及应用。本申请用于DNA高甲基化区域富集的试剂，包括单链环形结构的探针，探针的序列包括内切酶酶切区、引物结合区、DNA 3’端高C片段结合区、DNA中间高C片段结合区、DNA 5’端高C片段结合区。本申请的试剂，通过将高甲基化的DNA片段环化后，进行滚环扩增，有效的富集高甲基化的DNA片段，满足测序需求，最大程度的保证了DNA的甲基化信息，避免了常规PCR扩增富集造成的非特异扩增和扩增错误。
用于 dna 甲基化区域富集试剂方法应用

[发明专利]基于免疫毛细管电泳-激光诱导荧光的基因组DNA整体甲基化水平分析-CN200910092317.1无效
发明人：汪海林;王晓利 -专利权人：中国科学院生态环境研究中心
申请日： 2009-09-10 - 公布日： 2010-02-03 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA整体甲基化水平的高效快速检测方法。本发明利用免疫毛细管电泳-激光诱导荧光技术实现对DNA-抗体免疫复合物的分离与检测，以此定量分析待测DNA中整体甲基化水平。本发明与传统DNA整体甲基化水平检测方法相比，无需重亚硫酸盐处理、DNA酶解及PCR扩增等步骤，具有操作简便快速、DNA用量少、检测灵敏度高等优势，可以实现对DNA整体甲基化水平的高效、快速检测，适用于各种生物样品的检测，环境污染物对DNA甲基化影响的快速筛选及对癌症等疾病的表观遗传学评估。
基于免疫毛细管电泳激光诱导荧光基因组 dna 整体甲基化水平分析

[发明专利]一种无创高通量甲基化结肠癌诊断、研究和治疗方法-CN201710550895.X在审
发明人：宫明 -专利权人：沈阳宁沪科技有限公司
申请日： 2017-07-07 - 公布日： 2017-09-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种无创高通量甲基化结肠癌诊断、研究和治疗方法，样品基因组DNA，其特征在于基于大通量平行甲基化检测组合测序加cfRNA信息检测受试者DNA甲基化以产生受试者的甲基化谱，建立SEPT9，MLH1，DKK2，APC基因含有的特异性CpG岛位点，把鉴定基因在启动子区域的CGI岛和CpG岛中的甲基化水平作为结肠癌的诊断标志物和临床靶标；使用特异性的抗甲基胞嘧啶抗体识别并结合到发生甲基化的DNA片段，利用免疫沉淀建立甲基化二代测序文库和富集靶标位点，并将甲基化谱与标准甲基化谱比较,对甲基化位点测序生物信息利用“瀑布”机理分析样品是否有癌、结合cfRNA、和甲基化位点的综合分析，确定癌症以及定位。
一种无创高通量甲基化结肠癌诊断研究治疗方法

[发明专利]甲基化胞嘧啶的检测方法-CN200880103915.8有效
发明人：梶田昌裕;岡智子;山本宪明;酒井绫子;石原英干 -专利权人：希森美康株式会社
申请日： 2008-08-20 - 公布日： 2011-01-26 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明的甲基化胞嘧啶检测方法包括以下步骤：使寡核苷酸与标本DNA杂交的步骤，该寡核苷酸与标本DNA中含预期甲基化的胞嘧啶的区域杂交且在与上述胞嘧啶互补位置有脱碱基部位；氧化步骤，使氧化剂与上述步骤中生成的杂交标本DNA进行反应，当存在甲基化胞嘧啶时，氧化该甲基化胞嘧啶；以及检出被氧化的甲基化胞嘧啶的步骤。
甲基化胞嘧啶检测方法

[发明专利]DNA甲基化修饰的检测方法-CN202111675154.7在审
发明人：肖莉;袁梦兮;罗晶晶;廖端芳;殷宇芳;张佳;李凯 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2021-12-31 - 公布日： 2022-04-22 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明涉及一种DNA甲基化修饰的检测方法，包括如下步骤：对待测样本的DNA进行酶切；酶切后的待测样本在可视化标签反应液中发生可视化标签反应，在酶切末端添加荧光标记；对可视化的所述荧光标记的信号进行检测。本发明巧妙地将甲基化限制性内切酶和DNA聚合酶/DNA连接酶结合应用于DNA甲基化修饰的检测中，先通过甲基化限制性内切酶在样本DNA中引入切口，再利用DNA聚合酶/DNA连接酶在该切口处加入荧光标记的核苷酸，从而实现样本DNA的C位点的可视化，这样以来，通过检测待测样本的荧光强度并将其与对应的已知甲基化修饰水平的荧光强度作比较，就能够可视化地判断甲基化修饰C位点的水平。
dna 甲基化修饰检测方法

[发明专利]一种同时检测DNA甲基化和基因组变异的方法、装置和存储介质-CN202011598472.3有效
发明人：刘涛;崔添毓;方欢;李敏;管彦芳;杨玲;易鑫 -专利权人：北京吉因加医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-12-29 - 公布日： 2021-09-28 - 主分类号： G16B20/10 文献下载
摘要：本申请公开了一种同时检测DNA甲基化和基因组变异的方法、装置和存储介质，所述方法包括：甲基化位点修复步骤：根据待测样本的DNA甲基化信息，修复甲基化位点为原来的C碱基或者G碱基，获得修复后的待测样本测序数据本申请同时检测DNA甲基化和基因组变异的方法，通过对待测样本的DNA文库进行一次测序，可以同时得到待测样本的DNA甲基化信息和基因组变异信息，不仅缩短了基因组变异检测的周期，同时也避免了DNA甲基化导致的假阳性突变的检出
一种同时检测 dna 甲基化基因组变异方法装置存储介质

[发明专利]靶向DNA去甲基化的方法、融合蛋白及其应用-CN202210050631.9有效
发明人：余细勇;朱昱光;申翱;张灵敏 -专利权人：广州医科大学
申请日： 2022-01-17 - 公布日： 2022-12-09 - 主分类号： C12N9/22 文献下载
摘要：本发明涉及一种靶向的DNA去甲基化方法(Mini‑CRISD)和该方法中所用到的融合蛋白。本发明所述Mini‑CRISD方法通过工程化的缩小dCjCas9递送工程化的缩小ROS1去甲基化效应子至特定DNA序列和/或特定基因组位置(如CpG岛)来靶向递送去甲基化活性，可以对特定DNA实现靶向去甲基化
靶向 dna 甲基化方法融合蛋白及其应用

[发明专利]DNA甲基化测序文库及其构建方法和检测方法-CN202111398633.9在审
发明人：陈澍宜 -专利权人：竹石生物科技（苏州）有限公司
申请日： 2021-11-24 - 公布日： 2022-02-11 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本申请公开了一种DNA甲基化测序文库及其构建方法和检测方法。本申请在建立测序文库时并未对双链DNA进行末端修复，而是先将双链DNA变性为单链DNA，然后利用该单链DNA作为建库模板并结合酶学转化法来建立DNA甲基化测序文库，因此，本申请能够避免由于进行末端修复而带来的修复碱基被测序仪读取的现象另外，本申请并未采用未甲基化的dNTPs进行末端修复，不会在末端引入新的甲基化水平，从而不会引起测得的甲基化水平失真现象。
dna 甲基化序文及其构建方法检测

[发明专利]一种基于Nanopore测序技术特征化细菌DNA甲基化的方法和应用-CN202111482943.9有效
发明人：夏涵;官远林;温颜华;黎松;胡龙;梁晓雪;穆西玉;史奇奇;宋雅丽 -专利权人：予果生物科技（北京）有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司;予果智造科技（北京）有限公司
申请日： 2021-12-07 - 公布日： 2022-12-30 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于Nanopore测序技术特征化细菌DNA甲基化的方法和应用，属于生物信息技术领域，包括如下步骤：获取目标菌株的Nanopore测序fast5和fastq数据，对测序数据进行质控；获取目标菌株参考基因组，利用nanopolish或tombo软件获得不同修饰类型位点的全基因组范围的DNA甲基化水平；特征化细菌的DNA甲基化模式，深入阐述基于DNA甲基化的表观遗传的调控机制。本发明提供的方法可以帮助全面特征化细菌的DNA甲基化图谱，探索之前隐藏的细菌领域的表观遗传调控机制，具有重要的应用价值。
一种基于 nanopore 技术特征细菌 dna 甲基化方法应用

[发明专利]使用核酸阵列分析甲基化状态-CN200510009558.7无效
发明人：罗伯特·J·利普舒茨;史蒂芬·P.A.·福多尔;希瓦尼·诺蒂亚尔 -专利权人：阿菲梅特里克斯公司
申请日： 2005-02-16 - 公布日： 2005-10-12 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本方面公开了扩增核酸样品同时保留胞嘧啶的甲基化状态的方法。在某些方面，扩增的甲基化样品被甲基化敏感的修饰方法所修饰，并且通过与阵列杂交来分析，从而鉴定在起始材料中被甲基化的胞嘧啶和在起始材料中没有被甲基化的胞嘧啶。本发明还公开了检测甲基化状态的方法。在一个实施方案中，在扩增反应中引入DNA甲基转移酶活性，这种活性使用甲基化的基因组模板链作为指导，对新合成的DNA进行甲基化。
使用核酸阵列分析甲基化状态