本发明提供一种甲基化DNA的浓缩方法和检测方法以及试剂盒,浓缩方法包括将生物样品直接与固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白接触。检测方法包括以下步骤:浓缩:将生物样品直接与固相化甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白接触;转化:使用重硫酸盐处理浓缩到的甲基化DNA;脱硫:使用碱性脱硫剂处理经转化的甲基化DNA;以及测定得到的DNA上述方法中编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。上述方法采用固相化甲基化DNA结合蛋白或其结构域直接高效结合甲基化DNA,对于体积大或DNA浓度低的生物样品尤为有利。