本发明“用于检测黄瓜果实表皮细胞结构的SNP标记方法”,涉及生物技术辅助育种领域。用于检测黄瓜果实表皮细胞结构的SNP标记方法,其中所述标记引物的核苷酸序列为:dcaps—RsaI—F:GGGAACAATATTATTTTTGGAGTA/dcaps—RsaI—R:TGATTCCTATTACCTTCAACCTCA;以黄瓜基因组DNA为模板,以上述引物为前后引物进行PCR扩增,获得一个158bp的片段,该片段第26个碱基为SNP20114537A/C。片段如Seq ID No.1所示,则果实为栅栏状表皮细胞;片段如Seq ID No.2所示,则果实为扁平状表皮细胞;采用本发明获得的SNP标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断其果实表皮细胞结构为栅栏状还是扁平状,该标记具有高效、限制少的优点,提高了选育果实具有栅栏状表皮细胞的加工型黄瓜材料和具有扁平状表皮细胞的鲜食型黄瓜材料的效率,缩短了育种周期。
本发明提供了与黄瓜叶酸含量相关的INDEL分子标记及其应用,属于分子标记技术领域。与黄瓜叶酸含量相关的INDEL分子标记的上游扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,下游扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明基于所述INDEL标记引物提供一种用于辅助筛选具有特定高叶酸含量的黄瓜品种的方法,采用所述INDEL标记的特异性引物扩增待测材料的基因组DNA,对扩增产物进行电泳检测,扩增产物可能出现两种情况:与高叶酸含量的材料相比低叶酸材料在35bp处有四个碱基的插入。通过本发明提供的方法,在黄瓜候选材料任何阶段进行叶酸含量的鉴定和筛选,具有高效、限制少、准确的优点。
本发明“黄瓜抗番木瓜环斑病毒病基因prsv的Indel标记及其应用,”涉及生物技术辅助育种领域。黄瓜番木瓜环斑病毒病(PRSV)抗性基因prsv紧密连锁的Indel标记,其特征在于prsvInde2‑F/prsvInde2‑RCTTCCCCATCATCATACATC/AAGCAGGAGAATGAAACAAC;所述Indel标记扩增的与黄瓜PRSV感病基因PRSV连锁的特征条带为176bp,核苷酸序列见Seq ID No.1;所述Indel标记扩增的与黄瓜PRSV抗病基因prsv连锁的特征条带为170bp,核苷酸序列见Seq ID No.2所示;采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断其是否对PRSV具有抗性,该标记具有高效、限制少的优点,对选育抗PRSV的黄瓜育种材料提高了效率,缩短了育种周期。
本发明“黄瓜果实多刺基因ns的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。本发明公开了与黄瓜果实多刺基因ns连锁的Indel标记,其特征在于Indelns24‑F/Indelns24‑RTTTGAATGGCAGAAGAGAGT/TCCCTCTTTATTTGTGAACC。所述Indel标记扩增的与黄瓜果实多刺基因ns连锁的特征条带为216bp,核苷酸序列如Seq ID No.1;所述Indel标记扩增的与黄瓜果实少刺基因Ns连锁的特征条带为219bp,核苷酸序列如Seq ID No.2所示;采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段对其进行果实多刺材料的筛选,具有高效、限制少的优点,为选育多刺黄瓜提高了选择效率,缩短了育种周期。
本发明“黄瓜黄色果肉基因yf连锁的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。黄瓜黄色果肉基因yf紧密连锁的Indel标记引物,其特征在于yfIndel39‑F/yfIndel39‑RCATCTGCATTCTACGTGTTG/AATCGTGTTGCTACTTAGCTG;所述Indel标记扩增的与黄瓜白绿色果肉基因YF连锁的特征条带为132bp,核苷酸序列如Seq ID No.1;所述Indel标记扩增的与黄瓜黄色果肉基因yf连锁的特征条带为137bp,核苷酸序列如Seq ID No.2所示;采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段对其进行果肉是否为黄色的判断,具有高效、限制少的优点,为选育黄色果肉黄瓜提高了效率,缩短了育种周期。
本发明“黄瓜果实栅栏状表皮细胞基因Pe的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。黄瓜栅栏状表皮细胞基因Pe紧密连锁的Indel标记,其中所述标记引物的核苷酸序列为:Indelpe02-F/Indelpe02-R:TCTCCTCCTATACATTCTCA/GAAGATTATGAGGATGAGAG;所述Indel标记扩增的与黄瓜栅栏状表皮细胞基因Pe连锁的特征条带为125bp,核苷酸序列见Seq ID No.1;所述Indel标记扩增的与黄瓜扁平状表皮细胞基因pe连锁的特征条带为130bp,核苷酸序列见Seq ID No.2;采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断其表皮细胞结构为栅栏状还是扁平状,该标记具有高效、限制少的优点,对选育果实具有栅栏状表皮细胞的加工型黄瓜材料提高了效率,缩短了育种周期。
本发明“黄瓜抗白粉病基因pm-h的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。与黄瓜抗白粉病基因pm-h连锁的Indel标记,其中所述标记的引物的核苷酸序列为:pm-hIndel36-F/pm-hIndel36-R:GGTTTGTTGGTATGAAGAAGG/GGGATTGAAGAGAATATACTCC;所述Indel标记引物扩增的与黄瓜抗白粉病基因pm-h连锁的特征条带为170bp,核苷酸序列见Seq ID No.1;所述Indel标记引物扩增的与黄瓜感白粉病基因PM-H连锁的特征条带为164bp,核苷酸序列见Seq ID No.2。采用本发明获得的Indel标记,可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断其是否对白粉病具有抗性,该标记具有高效、限制少的优点,对选育抗白粉病的黄瓜材料提高了效率,缩短了育种周期。