本发明提供了一种与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记、引物组、试剂盒及应用，属于分子生物学辅助育种技术领域。与黄瓜成株期耐热相关的SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述SEQ ID NO:1的第190位存在T/C多态性；当所述SNP标记的190位碱基为T时，黄瓜材料的成株期耐热性好；当所述SNP标记的190位碱基为C时，黄瓜材料的成株期耐热性差。本发明不仅为黄瓜成株期耐热性的精细定位和分子克隆奠定了基础，同时也为利用分子标记辅助选育耐热的黄瓜新品种提供了高效的途径。
本发明公开了一种黄瓜根重调控基因连锁的Indel标记及其应用：所述InDel标记在黄瓜第3号染色体上，对于重根系显性纯合材料，其具有SEQ ID NO.1所示的特征序列，即在88‑99位处具有AAAATATGTCTT序列；对于轻根系隐性纯合材料，其具有SEQ ID NO.2所示的特征序列；对于重根系显性杂合材料，其同时具有SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的特征序列。采用本发明获得的Indel标记，可以在黄瓜候选材料的任何阶段对其进行根系强弱的判断，具有高效、限制少的优点，为选育强根系黄瓜品种提高了效率，缩短了育种周期。
本发明提供了一种黄瓜耐寒基因LTT紧密连锁的SNP分子标记及其应用，属于分子标记技术领域。一种黄瓜耐寒基因LTT紧密连锁的SNP分子标记，核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述SEQ ID NO:1的第45位碱基存在C/G多态性。以幼苗耐寒自交系CG104和幼苗低温敏感自交系CG37为材料开发SNP标记，所述SNP在123份F2群体材料中有102份材料的带型与田间调查结果一致，正确率为83.0％，同时对68份自然群体材料的基因型数据与表型数据进行验证，获得较高的鉴定正确率。通过本发明提供的SNP分子标记可以在黄瓜候选材料对其进行耐寒的筛选，具有高效、限制少、准确的优点。
本发明涉及生物技术辅助育种技术领域，特别涉及一种用于检测黄瓜果肉颜色的SNP标记及其应用。用于检测黄瓜果肉颜色的SNP标记的引物，核苷酸序列为：5’‑TTGGGACGTTTATGGACTT‑3’/5’‑GTCACAAGAATAGTGTCAGT‑3’；所述引物扩增的与黄瓜绿色果肉基因连锁的特征条带的核苷酸序列如Seq ID No.1所示，序列的第73位碱基为A；所述引物扩增的与黄瓜白色果肉基因连锁的特征条带的核苷酸序列如Seq ID No.2所示，序列的第73位碱基为G。该SNP标记位于黄瓜Chr.5上735949bp处，可在黄瓜候选材料的任何阶段用于判断果肉颜色，提高了育种效率。
本发明“与黄瓜长下胚轴基因lh1连锁的Indel标记及其引物、试剂盒与应用”，属于生物技术辅助育种领域。所述与黄瓜长下胚轴基因lh1连锁的Indel标记相比野生型黄瓜正常长度下胚轴基因Lh1对应连锁片段的第31‑34位点存在碱基缺失突变。所述与黄瓜长下胚轴基因lh1连锁的Indel标记的核苷酸序列如Seq ID No.2所示。采用本发明获得的Indel标记，可以在黄瓜候选材料的任何阶段判断植株是否具有长下胚轴这一性状，该标记具有高效、限制少、准确率高的优点。
本发明“与黄瓜抗黄瓜花叶病毒基因cmv连锁的SNP标记及其试剂盒与方法”，涉及生物技术辅助育种领域。所述与黄瓜抗黄瓜花叶病毒基因cmv连锁的SNP标记的第190个碱基位点具有A/T单核苷酸多态性；所述SNP标记为SNP9153657 A/T；可扩增所述SNP标记的引物为核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的dCAPS‑NlaIII‑F和dCAPS‑NlaIII‑R。本发明提供的SNP标记具有高效、限制少的优点，提高了选育抗黄瓜花叶病毒的黄瓜材料的效率，缩短了育种周期。
