本发明公开了一组用于鉴定山桃杂交群体抗/感桃蚜性状的InDel标记及其应用，该InDel标记包括InDel‑1标记和InDel‑2标记，其中，InDel‑1标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，InDel‑2标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明针对InDel‑1和InDel‑2标记设计两组InDel引物对，并对InDel‑1对应引物对所扩增的PCR扩增产物进行电泳检测，对InDel‑2对应引物对所扩增的PCR扩增产物进行测序，根据结果预测山桃抗这说明利用本发明的核苷酸插入缺失(InDel)标记进行桃蚜抗性的鉴定，具有迅速、便捷、低成本等优点，能够在生产中实现大规模应用。
本发明公开一种广叶绣球菌SP‑A菌株鉴定的indel分子标记，所述分子标记分别为indel2或indel6；所述indel2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述indel6的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；同时设计扩增indel2或indel6的引物，以DNA为模板，进行PCR扩增产物，对扩增产物测序后实现快速鉴定绣球菌SP‑A菌株。
本发明属于萝卜育种技术领域，特别是涉及一种鉴别萝卜叶形的InDel引物及其应用。本发明提供一种鉴别萝卜叶形的InDel引物，所述InDel引物包括InDel593引物和InDel594引物；所述InDel593引物的上游引物如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列，所述InDel593引物的下游引物如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列；所述InDel594引物的上游引物如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列，所述InDel594引物的下游引物如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列
本发明提供了一种用于鉴定棉花品种的InDel分子标记组合，包括53个InDel分子标记，53个InDel分子标记分别特异性检测53个棉花InDel位点InDeljs0001～InDeljs0053。较佳地，每个InDel分子标记分别包括一条正向引物和一条反向引物，53个InDel分子标记的序列依次如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:106所示。还提供了用于鉴定棉花品种的InDel分子标记组合的开发方法和应用。本发明的用于鉴定棉花品种的InDel分子标记组合能够用于鉴定棉花品种，具有高度稳定性、准确性和低成本的特点，设计巧妙，鉴定简便快捷，成本低，不受环境影响，适于大规模推广应用。
本发明公开了一种玉米基因ZmPOP10的Indel分子标记及其应用，属于分子遗传学领域。所述Indel分子标记包括Indel‑1和Indel‑2，所述Indel‑1的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示，所述Indel‑2的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示。本发明还提供了一种扩增上述Indel分子标记的引物组合，包括如SEQ ID NO.1‑2所示的引物对和如SEQ ID NO.3‑4所示的引物对。本发明提供的Indel分子标记在干旱条件与正常浇水下均与玉米材料的根尖数显著相关，可用于玉米分子辅助育种和优质种质资源鉴定，加速玉米耐旱材料的创制和新品种选育进程。
本发明属于梨分子育种技术领域，公开了梨果肉褐变性状相关的InDel‑85标记，所述InDel‑85标记位于‘满天红’ב红香酥’遗传连锁图谱中第2号染色体的第17936028~17936232bp位置，InDel‑85标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.85所示，序列全长205bp，InDel‑85标记的正向引物为5'‑TTAGCCGTTTTCTTCATGTT‑3'、反向引物为5'‑AGGCTCAAGAAAGGAGAGTT‑3'；梨果肉易褐单株表现为InDel‑85标记序列的插入，梨果肉不易褐单株表现为InDel‑85标记序列的缺失。本发明设计的InDel‑85标记能够用于鉴定梨果肉是否容易发生褐变，具有良好的应用价值，可用于梨分子育种。
本发明属于梨分子育种技术领域，公开了梨果肉褐变性状相关的InDel‑90标记，所述InDel‑90标记位于‘满天红’ב红香酥’遗传连锁图谱中第2号染色体的第17958988~17959190bp位置，InDel‑90标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.90所示，序列全长203bp，InDel‑90标记的正向引物为5'‑GAAACATCACGTATCGGATT‑3'、反向引物为5'‑TCAACAATTACAAAAACCCC‑3'；梨果肉易褐单株表现为InDel‑90标记序列的插入，梨果肉不易褐单株表现为InDel‑90标记序列的缺失。本发明设计的InDel‑90标记能够用于鉴定梨果肉是否容易发生褐变，具有良好的应用价值，可用于梨分子育种。
本发明公开了一种节瓜种子大小相关的Indel标记及其应用，属于分子生物学技术领域。本发明提供了节瓜大种性状相关的Indel标记、特异性引物对及检测方法，所述Indel标记位于节瓜第10号染色体第15906420处碱基，在该处发生如SEQ ID NO：1所示核苷酸序列的插入，同时在该处开发一对用于筛选种子大小的Indel标记(Indel 9)，在本发明中，精细定位了于节瓜种子大小型紧密连锁的Indel标记，并通过该标记设计用于筛选种子大小的引物对，利用该引物(Indel 9)可以对节瓜种子的大小进行精确筛选，
本发明提供一种与月季红色花瓣相关的Indel标记及鉴定月季红色花瓣的分子方法。该Indel标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。该鉴定月季红色花瓣的分子方法包括分离提取要鉴定月季材料的基因组DNA；使用Indel标记的特异性引物进行PCR并进行电泳，观察是否具有Indel条带。当有Indel条带，该品种为红色月季；没有Indel条带，则该品种不是红色月季，可能为白色、绿色或黄色月季。本发明通过月季红色花瓣特有的Indel标记可以快速区分花期前红色和非红色月季品种，为月季花色分子辅助育种服务，尤其为苗期月季花色的快速选择提供技术支持。
