[发明专利]番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测荧光探针、试剂盒及应用在审
申请号: | 202211707230.2 | 申请日: | 2022-12-29 |
公开(公告)号: | CN116240313A | 公开(公告)日: | 2023-06-09 |
发明(设计)人: | 王振华;张建坤;张华;徐文兴;孙俊;李乔;王琴 | 申请(专利权)人: | 武汉海关技术中心;武汉理工大学;华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 武汉华旭知识产权事务所 42214 | 代理人: | 高剑锋 |
地址: | 430051 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 番茄 褪绿矮缩 类病毒 taqman 实时 荧光 定量 rt pcr 检测 探针 试剂盒 应用 | ||
1.一种番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测荧光探针,其特征在于序列为:5'-FAM-CGCCTTCCACAAGCTCCCTGCCGCCTTT-BHQ1-3'。
2.根据权利要求1所述的一种番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测荧光探针,其特征在于,与所述荧光探针配合使用的引物的核苷酸序列为:
正向引物:5'-GGGTTTTCACCCTTCCTTTC-3';
反向引物:5'-TGTTTCWRCDGGGATTACTCCTG-3'。
3.一种番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:至少包括权利要求1所述的荧光探针和权利要求2所述的引物。
4.根据权利要求1~3中任一项所述番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测荧光探针、引物或试剂盒在检测番茄褪绿矮缩类病毒中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用为从马铃薯纺锤块茎类病毒、金鱼草潜隐类病毒、辣椒小果类病毒、番茄顶缩类病毒、番茄褪绿矮缩类病毒和番茄雄性株类病毒这6种马铃薯纺锤形块茎类病毒属中鉴别出番茄褪绿矮缩类病毒。
6.根据权利要求3所述的一种番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:还包括TaqMan实时荧光PCR扩增预混液和阳性质粒。
7.根据权利要求6所述的一种番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:阳性质粒是将SEQ ID NO.1所示序列插入pGEM-T载体中获得。
8.根据权利要求7所述的一种番茄褪绿矮缩类病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于用该试剂盒检测番茄褪绿矮缩类病毒的方法为:
步骤1.提取待测样品的RNA并逆转录为cDNA;
步骤2.实时荧光PCR体系为:TaqMan实时荧光PCR扩增预混液12.5μL,上下游引物(10μmol/mL)各1.0μL,TaqMan探针(10μmol/mL)0.5μL,cDNA模板3.0μL,用ddH2O补充至总体积为25μL;实时荧光PCR反应条件为:50℃2min、95℃10min、95℃15s、60℃1min,40个循环;
步骤3.检测结果判定:Ct值≤35,且出现典型的扩增曲线,则结果为阳性;无Ct值或无扩增曲线,结果为阴性;Ct值35时,重做该样本,若重做结果无Ct值为阴性,否则为阳性。
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