[发明专利]一种与胎龄相关的靶标基因组合及其应用

说明书

本发明公开一种与胎龄相关的靶标基因组合及其应用。本发明基于所述靶标基因组合包括TSPOAP1、CRYAA、CXCL11、FNDC10、HMGA2、FDCSP、OLFM2、KRT36、C13orf46、SCD5、OR12D2、OMP、CEBPE、MOBP、CCNF、FUT2、LIPH、ERICH4和GPR171等。本发明发现外周血游离DNA在某些基因转录起始位点区域的分布情况能够反映不同孕周，对游离DNA转录起始位点区域特征进行均一化校正后，使用机器学习算法，构建的预测模型能够有效地预测胎儿的胎龄。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种与胎龄相关的靶标基因组合及其应用。

背景技术

胎龄指从卵细胞和精子结合成受精卵到胎儿自母体中分娩出来的这段时间，以周为基本单位。准确确定胎龄在临床中具有重要意义：一、决定是否对早产进行管理延迟其分娩时间以及是否对超过预产期的孕妇进行引产依赖于准确的孕周；二、唐氏综合症筛查的改进依赖于准确的孕周；三、准确的胎龄有利于使用超声或MRI技术监测正常胎儿发育(器官发育图)状态；四、准确的胎龄对区分照顾生长受限的婴儿(按时出生)和早产儿也很重要。

目前，有两种主要的方法在产前确定胎龄：末次月经和超声测量，根据末次月经方法，人类受孕发生在末次月经后14天左右，从末次月经第一天算起，妊娠期为40周；超声测量在妊娠早期(妊娠14周内)测量胎儿头尾长度，其测量准确性在5天的误差内；在妊娠中期或晚期，通过使用多种计量参数：头的双顶骨直径、头围、腹围和股骨长度来确定胎儿的胎龄。末次月经的局限性是：1)孕妇并不总是准确的记得末次月经的日期，2)某些女性月经周期不规律的，3)受孕并不总是在末次月经后的14天发生，4)它不能用于在末次月经前3个月内服用避孕药或母乳喂养的孕妇，当末次月经的日期不能准确确定的情况下，使用末次月经的方法会造成胎儿发育阶段和末次月经基础胎龄之间的不匹配。如果使用超声测量在孕中晚期确定怀孕日期，则需要通过多种生物计量参数，并且孕中期计算胎龄的误差在7-10天，孕晚期在21-30天，因此在孕中晚期使用则不太准确，孕中期之后可以使用超声测量小脑长度来额外确定怀孕日期，但它需要由专门的超声医生对小脑进行良好的可视化，此外头部和小脑测量的局限性是，它们可能会受到大脑异常的影响，因此可能不适合在大脑发育异常的胎儿中确定胎龄，如CN104376191A公开一种预测胎龄的方法，包括以下步骤：建立胎儿的各种物理参数与胎龄的对应关系的胎龄估测表，其中对该表按照区域和/或胎儿母亲的孕前体重进行细分；获取胎儿的物理参数；根据物理参数和胎龄估测表估测得到胎龄。

综上所述，开发一种更精确的方法来测量妊娠各个时间点的胎儿的胎龄，对于妊娠管理具有重要意义。

发明内容

针对现有技术的不足和实际需求，为解决胎龄确定过程中末次月经记录不准确以及超声测量过程中在孕中晚期需要较高技术人员对胎儿小脑进行可视化的问题，本发明提供一种与胎龄相关的靶标基因组合及其应用，利用所述靶标基因组合结合特殊设计的分析策略构建预测模型，能够有效预测胎龄，提供一种相对无创、经济方便且具备高准确性的预测胎龄的方法。

为达上述目的，本发明采用以下技术方案：

第一方面，本发明提供一种与胎龄相关的靶标基因组合，所述靶标基因组合包括TSPOAP1、CRYAA、CXCL11、FNDC10、HMGA2、FDCSP、OLFM2、KRT36、C13orf46、SCD5、OR12D2、OMP、CEBPE、MOBP、CCNF、FUT2、LIPH、ERICH4、GPR171、CCDC196、SCGB3A2、ZNF512、PRR25、ZNF880、PILRA、CTRL、OR1B1、HLA-DQA2、PMCH、CTSF、NFRKB、GNAT3、KLRK1、MDM1、MTOR、TMPRSS11F、TAAR9、ZNF506、CGA、KCNB1和RAD1。