[发明专利]一种利用InDel分子标记鉴别茶树大小叶品种的方法

说明书

本发明涉及分子生物学技术领域，涉及一种基于分子标记的经济作物品种鉴别方法，具体涉及一种利用InDel分子标记鉴别茶树大小叶品种的方法。所述InDel分子标记的上游核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述InDel分子标记的下游核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。检测方法包括以下依次进行的步骤：S1：提取待测茶树样本中的总DNA，获得待扩增DNA；S2：使用F1和R1对待扩增DNA进行PCR扩增，获得扩增产物；S3：对所述扩增产物进行电泳检测。本技术方案在分子生物学领域对大叶种茶树和小叶种茶树进行鉴别，解决了传统的大小叶种茶的鉴别方法繁琐且不准确的技术问题，具有广阔的应用前景。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，涉及一种基于分子标记的经济作物品种鉴别方法，具体涉及一种利用InDel分子标记鉴别茶树大小叶品种的方法。

背景技术

茶是世界三大无酒精饮料之一，因其丰富的口感、悦人的香气和较高的保健价值而深受人们的喜爱。我国是茶树主产国之一，截至2020年底，18个主要产茶省(自治区、直辖市)茶园总面积约4747.69万亩，产量在297万吨以上。茶产业已经成为广大丘陵山区脱贫攻坚的支柱产业。叶片是植物最重要的营养器官，其通过光合作用和呼吸作用提供植物生长发育所需要的能量，同时储存有机物和矿质营养。对于茶树(Camellia sinensis(L.)O.Kuntze)而言，叶片还是主要的经济收获物。在我国西南和华南茶区，阿萨姆变种(Camellia sinensis var.Assamica，CSA，又称为大叶种)和中国变种(Camellia sinensisvar.Sinensis，CSS，又称为小叶种)茶树均有广泛栽培。而在江南和江北等茶区，由于冬季漫长且气温较低，导致阿萨姆变种茶树无法适应低温而死亡，因而以栽培中国变种茶树为主。两者无论在品质、形态和抗逆性均具有显著差异，其中最明显的是，阿萨姆变种茶树(乔木、小乔木为主)比中国变种茶树(灌木为主)具有更大的叶面积。然而，造成茶树叶片差异发育的关键突变位点或者调控因子尚未被成功鉴定。目前，对于茶树叶片发育机制的研究仍然较少。An等人通过全基因组重测序和图谱整合技术，以“金萱”和“云茶1号”杂交产生的96份F1代材料为基础构建了一张高密度遗传图谱，并在茶树2号染色体上鉴定到25个可能与叶面积相关的潜在QTL位点。但这些潜在的位点距离进一步的应用还有较大差距。目前，还没有高效快速的分子标记能够快速对阿萨姆变种和中国变种茶树进行准确的鉴定。现有技术通常采用目测以及用工具测量叶片大小的方法。但是人为划分大小叶的范围，该方法及其不准确，这对于茶树品种的鉴定和消费者权益的保护，都是十分不利的。因此，开发能快速对阿萨姆变种和小叶变种鉴定的标记对促进茶树功能基因、分子标记辅助育、茶树亲子关系鉴定和品种权保护都具有重要意义。

发明内容

本发明意在提供一种利用InDel分子标记鉴别茶树大小叶品种的方法，以解决传统的大小叶种茶的鉴别方法繁琐且不准确的技术问题。

为达到上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种利用InDel分子标记鉴别茶树大小叶品种的方法，所述InDel分子标记的上游核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述InDel分子标记的下游核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

本方案还提供了一种茶树的InDel分子标记，所述InDel分子标记位于舒茶早基因组2号染色体的基因CSS0006562的终止密码子下游135bp处，长度为184bp。

本方案还提供了一种InDel分子标记在鉴别茶树大小叶品种中的应用。