[发明专利]SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用在审
| 申请号: | 202111635137.0 | 申请日: | 2021-12-29 |
| 公开(公告)号: | CN114317801A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
| 发明(设计)人: | 张德强;李鹏 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 苏士莹 |
| 地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | snp 基因型 组合 评价 毛白杨 树干 表型 中的 应用 引物 试剂盒 及其 | ||
1.SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用,其特征在于,所述SNP位点包括SNP1和SNP2;
所述SNP1在SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列的第1262位存在T/C多态性;
所述SNP2在SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列的第3477位存在G/A多态性;
所述SNP1的基因型包括CC、TT和TC;
所述SNP2的基因型包括AA、GG和GA;
以毛白杨样品树干面积75cm2计:
当所述基因型组合为CC-AA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2,皮孔数目≤8个;
当所述基因型组合为CC-GG时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2,皮孔数目≤8个;
当所述基因型组合为CC-GA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2,皮孔数目≤8个;
当所述基因型组合为TT-AA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2,皮孔数目≥12个;
当所述基因型组合为TT-GG时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2,皮孔数目≥12个;
当所述基因型组合为TT-GA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2,皮孔数目≥12个;
当所述基因型组合为TC-AA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2,皮孔数目大于8个且小于12个;
当所述基因型组合为TC-GG时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2,皮孔数目大于8个且小于12个;
当所述基因型组合为TC-GA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2,皮孔数目大于8个且小于12个。
2.一种评价毛白杨树干皮孔表型的引物组,其特征在于,所述引物组包括:鉴定权利要求1所述应用中SNP1基因型的引物组一和鉴定权利要求1所述应用中SNP2基因型的引物组二;
所述引物组一包括引物对一和引物对二;所述引物对一包括Pto-NAC83-1885-TF和Pto-NAC83-1885-R;所述引物对二包括Pto-NAC83-1885-CF和Pto-NAC83-1885-R;
所述引物组二包括引物对三和引物对四;所述引物对三包括Pto-MYB46-610-GF和Pto-MYB46-610-R;所述引物对四包括Pto-MYB46-610-AF和Pto-MYB46-610-R;
所述Pto-NAC83-1885-TF的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述Pto-NAC83-1885-CF的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
所述Pto-NAC83-1885-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述Pto-MYB46-610-GF的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
所述Pto-MYB46-610-AF的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
所述Pto-MYB46-610-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
3.一种评价毛白杨树干皮孔表型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求2所述的引物组。
4.权利要求2所述引物组或权利要求3所述试剂盒在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用。
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