[发明专利]SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用在审

专利信息
申请号: 202111635137.0 申请日: 2021-12-29
公开(公告)号: CN114317801A 公开(公告)日: 2022-04-12
发明(设计)人: 张德强;李鹏 申请(专利权)人: 北京林业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 苏士莹
地址: 100083 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: snp 基因型 组合 评价 毛白杨 树干 表型 中的 应用 引物 试剂盒 及其
【权利要求书】:

1.SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用,其特征在于,所述SNP位点包括SNP1和SNP2;

所述SNP1在SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列的第1262位存在T/C多态性;

所述SNP2在SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列的第3477位存在G/A多态性;

所述SNP1的基因型包括CC、TT和TC;

所述SNP2的基因型包括AA、GG和GA;

以毛白杨样品树干面积75cm2计:

当所述基因型组合为CC-AA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2,皮孔数目≤8个;

当所述基因型组合为CC-GG时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2,皮孔数目≤8个;

当所述基因型组合为CC-GA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2,皮孔数目≤8个;

当所述基因型组合为TT-AA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2,皮孔数目≥12个;

当所述基因型组合为TT-GG时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2,皮孔数目≥12个;

当所述基因型组合为TT-GA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2,皮孔数目≥12个;

当所述基因型组合为TC-AA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≥0.5cm2,皮孔数目大于8个且小于12个;

当所述基因型组合为TC-GG时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值≤0.43cm2,皮孔数目大于8个且小于12个;

当所述基因型组合为TC-GA时,则毛白杨样品树干的单个皮孔面积的平均值大于0.43cm2且小于0.5cm2,皮孔数目大于8个且小于12个。

2.一种评价毛白杨树干皮孔表型的引物组,其特征在于,所述引物组包括:鉴定权利要求1所述应用中SNP1基因型的引物组一和鉴定权利要求1所述应用中SNP2基因型的引物组二;

所述引物组一包括引物对一和引物对二;所述引物对一包括Pto-NAC83-1885-TF和Pto-NAC83-1885-R;所述引物对二包括Pto-NAC83-1885-CF和Pto-NAC83-1885-R;

所述引物组二包括引物对三和引物对四;所述引物对三包括Pto-MYB46-610-GF和Pto-MYB46-610-R;所述引物对四包括Pto-MYB46-610-AF和Pto-MYB46-610-R;

所述Pto-NAC83-1885-TF的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;

所述Pto-NAC83-1885-CF的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;

所述Pto-NAC83-1885-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;

所述Pto-MYB46-610-GF的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;

所述Pto-MYB46-610-AF的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;

所述Pto-MYB46-610-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。

3.一种评价毛白杨树干皮孔表型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求2所述的引物组。

4.权利要求2所述引物组或权利要求3所述试剂盒在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用。

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