[发明专利]一种用于DNA样本跟踪检测的生物标志物、方法和应用

权利要求书

1.一种用于DNA样本跟踪检测的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为分别含有26个SNP位点的26段核酸，所述26个SNP位点具体为rs1344、rs3917981、rs857870、rs4478844、rs4621、rs1058900、rs1130598、rs4703、rs8481、rs4673、rs1132812、rs9930567、rs1045280、rs1135989、rs17626、rs354021、rs2304186、rs6554、rs2230267、rs11554159、rs5030878、rs3822585、rs9483504、rs11998387、rs11136343、rs1071583。

2.根据权利要求1所述的生物标志物，其特征在于，所述26个SNP位点的筛选方法为：筛选人群频率为0.4-0.6的SNP位点，且所筛选的SNP位点位于外显子panel能深度覆盖的区域，并将所筛选的SNP位点在443个已取得外显子panel结果的家系样本中进行遗传距离分析，最后筛选出如上所述26个符合要求的SNP位点。

3.一种用于DNA样本跟踪检测的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括用于检测权利要求1所述的生物标志物中26个SNP位点的PCR扩增引物；所述PCR扩增引物依序为SEQ IDNo.1至SEQ ID No.52所示序列。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括：PCR酶预混液、无核酸酶水、末端修复反应缓冲液、文库接头、连接反应液、高保真PCR酶、标签引物以及纯化磁珠。

5.一种用于DNA样本跟踪检测的方法，其特征在于，包括采用权利要求3或4所述的试剂盒中的PCR扩增引物，对待测样本DNA进行PCR扩增，并对PCR扩增产物进行高通量测序，根据高通量测序结果分析权利要求1或2所述的生物标志物中26个SNP位点的突变情况，由此判断待测样本DNA是否有被污染。

6.根据权利要求5所述方法，其特征在于，所述判断待测样本DNA是否有被污染，具体包括：通过将检测获得的SNP位点的突变情况与实际已知的待测DNA样本应该存在的SNP位点突变情况进行对比，判断该待测DNA样本是否存在污染。

7.根据权利要求5所述方法，其特征在于，所述对待测样本DNA进行PCR扩增，并对PCR扩增产物进行高通量测序，具体包括：采用PCR酶预混液对待测样本DNA进行PCR扩增后，依次进行纯化、末端修复和接头连接、磁珠纯化，再对磁珠纯化后的连接产物进行扩增，获得符合上机浓度要求的文库，进行高通量测序。

8.根据权利要求7所述方法，其特征在于，所述符合上机浓度要求的文库是指经安捷伦2100质控，PCR扩增产物的片段大小集中在270～400bp之间。

9.根据权利要求1或2所述的生物标志物，或者权利要求3或4所述的试剂盒，在外显子组测序或基因组测序中，对怀疑被污染的DNA样本进行跟踪检测的应用。