[发明专利]灵长类动物DNA甲基化相对定量试剂盒有效
申请号: | 202110537266.X | 申请日: | 2021-05-18 |
公开(公告)号: | CN113025692B | 公开(公告)日: | 2021-11-30 |
发明(设计)人: | 巴兆粉;于薇;穆文磊;陆艳;陆志恒;王弢 | 申请(专利权)人: | 江苏为真生物医药技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6806 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 董洪荣 |
地址: | 215000 江苏省苏州市工业园区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 灵长类 动物 dna 甲基化 相对 定量 试剂盒 | ||
1.灵长类动物DNA甲基化相对定量试剂盒,其特征在于,包括:
a)幼斑马鱼DNA或不含CpG位点的斑马鱼DNA,以及
b)DNA定量检测试剂,其至少包含用于定量检测a)的试剂;
所述幼斑马鱼为自受精卵形成至发育96小时以内的斑马鱼;
所述幼斑马鱼DNA或不含CpG位点的斑马鱼DNA为分离自斑马鱼的天然DNA;
所述幼斑马鱼DNA选自核苷酸序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:30所示DNA片段中的至少一种,所述不含CpG位点的斑马鱼DNA选自核苷酸序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:15所示DNA片段中的至少一种。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA定量检测试剂还包含用于定量检测灵长类动物靶核酸的试剂。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述靶核酸选自:
septin9、SDC2、SHOX2、NDRG4、RPRM、RASSF1、MGMT、PITX2、SOX17、vimentin、BMP3、GSTP1、RNF180、RUNX3、MIN25、Twist1、SCNN1B、Vimentin、ZNF545、RASSF2、TAPK、TFPI2、APC、TCF21、p16、hMLH1、BRCA1、DAPK、MDR1、Rb、THBS1、BCL-2、IGF-2、K-ras、MAGE-1、VHL、APAF1、CASP8、FAS、ABCG2、OCT4和WTH3中的至少一种。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA定量检测试剂还包含用于定量检测灵长类动物看家基因的试剂。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述看家基因为Actin、Tubulin或GAPDH。
6.根据权利要求1~5任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA定量检测试剂为引物。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA定量检测试剂还包括探针,所述探针标记有信号物质。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述探针为自身淬灭探针。
9.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,还包含亚硫酸盐定序试剂。
10.根据权利要求1~5、7~9任一项所述的试剂盒,其特征在于,还含有如下成分的中的至少一种:
DNA聚合酶、扩增缓冲液、dNTP、Mg2+、阳性对照、阴性对照以及水。
11.根据权利要求1~5、7~9任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述灵长类动物为人。
12.用于甲基化测定的灵长类动物DNA预处理方法,其特征在于,包括:
a)将幼斑马鱼DNA或不含CpG位点的斑马鱼DNA与待检测的灵长类动物靶核酸混合;所述幼斑马鱼为自受精卵形成至发育96小时以内的斑马鱼;
b)将幼斑马鱼DNA或不含CpG位点的斑马鱼DNA、灵长类动物靶核酸进行亚硫酸盐定序;
其中,a)、b)无先后顺序,所述幼斑马鱼DNA、所述不含CpG位点的斑马鱼DNA为权利要求1~11任一项中的幼斑马鱼DNA、不含CpG位点的斑马鱼DNA所定义;
所述灵长类动物靶核酸为权利要求2或3中的靶核酸所定义。
13.根据权利要求12所述的预处理方法,其特征在于,所述灵长类动物靶核酸来自如下样本:血液、血清、血浆、尿液、粪便、唾液、痰液、胸腹水、灌洗液、脑脊液、鼻咽拭子、宫颈刮片、精液、细胞培养液。
14.根据权利要求12所述的预处理方法,其特征在于,所述灵长类动物靶核酸来自组织或组织裂解液。
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