[发明专利]一种利用DNA甲基化的方法检测苯丙酮尿症的试剂盒无效
申请号: | 201110268599.3 | 申请日: | 2011-09-13 |
公开(公告)号: | CN102304583A | 公开(公告)日: | 2012-01-04 |
发明(设计)人: | 林明;周柔丽;杨华;李莉;邵根泽;肖军军 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/113 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 史双元 |
地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 dna 甲基化 方法 检测 丙酮 试剂盒 | ||
1.一种利用DNA甲基化的方法检测苯丙酮尿症的试剂盒,包括dNTP、10xPCR buffer、MgCl2、ddH2O、Taq DNA聚合酶,其特征在于,还包括标准血液DNA、引物MSP-R、引物MSP-L、引物UMSP-R、引物UMSP-L、引物BSP-R1、引物BSP-L1、引物BSP-R2、引物BSP-L2;所述引物MSP-R的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示,引物MSP-L的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2所示,引物UMSP-R的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.3所示,引物UMSP-L的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.4所示,引物BSP-R1的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.5所示,引物BSP-L1的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.6所示,引物BSP-L2的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.7所示,引物BSP-R2的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.8所示;上述引物用于做甲基化特异性PCR,PCR时,引物的配对方案为:
引物MSP-R、MSP-L配对,引物UMSP-R、UMSP-L配对,引物BSP-R1、BSP-L1配对,引物BSP-R2、BSP-L2配对,用于检测ASS基因(GeneBankNG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)启动子区甲基化情况。
2.根据权利要求1所述一种利用DNA甲基化的方法检测苯丙酮尿症的试剂盒,其特征在于,所述标准血液DNA为取自无苯丙酮尿症健康人血液提取的基因组DNA并经过重亚硫酸盐处理。
3.一种利用DNA甲基化的方法检测苯丙酮尿症的标志物,其特征在于,所述标志物为ASS基因(GeneBank NG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)甲基化的启动子区域,该区域包括一个或多个甲基化的CpG岛;所述ASS(GeneBankNG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)基因甲基化的启动子区域核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.9、SEQ ID No.10和SEQ ID No.11所示。
4.权利要求1所述利用DNA甲基化的方法检测苯丙酮尿症的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)从血液样品中提取基因组DNA;
(2)将基因组DNA经重亚硫酸盐处理,使未甲基化的胞嘧啶全部转变为尿嘧啶;
(3)利用权利要求1所述试剂盒及引物配对方案,以ddH2O、标准血液DNA、经重亚硫酸盐处理的血液样品基因组DNA为模板,进行甲基化特异性PCR反应;
(4)用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测PCR结果,如果以ddH2O、标准血液DNA为模板的PCR无扩增条带,而以经重亚硫酸盐处理的血液样品基因组DNA为模板的PCR扩增有扩增条带,且扩增条带与预测的条带大小一致,则认为所检测的血液样品来自苯丙酮尿症患者。
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