本发明公开了一个陆地棉油分蛋白品质关联的葡萄糖‑甲醇‑胆碱氧化还原酶基因的应用。本发明提供了该基因在四倍体陆地棉中的cDNA序列SEQ ID NO.1和基因组序列SEQ ID NO.2。本发明提供的基因由陆地棉品种重测序和全基因组关联分析所得,与棉花棉仁的油分和蛋白含量显著关联。利用该基因SNP基因型来区分高品质和低品质单倍型。根据这两种单倍型对品种群体进行归类,并结合品质性状进行统计分析,同样证明GhGMC与棉花棉仁的油分和蛋白含量之间存在显著的相关性。以上结果说明该基因在高效鉴定高油分和高蛋白棉花品种、提高棉花油分蛋白含量和培育棉花高油分和高蛋白新品种中具有重要的研究价值和应用前景。