5’-RACE接头序列添加方法及接头序列和5’端未知基因完整编码序列的扩增方法,它涉及一种接头序列添加方法及接头序列和基因完整编码序列的扩增方法。它解决现有接头序列添加方法存在的对mRNA 5’末端信息的完整性没有选择性及模板复杂度高等缺陷。5’-RACE接头序列添加:一、根据目的基因与目的物种设计特异性逆转录引物和接头序列;二、逆转录添加接头序列。接头序列如SEQ ID NO:10所示。5’端未知基因完整编码序列扩增:一、设计引物;二、逆转录并添加接头;三、巢式PCR扩增;四、测序,分析。本发明5’-RACE接头序列添加方法具有对mRNA 5’末端信息的完整性有选择性及基因克隆效率高等优点。
本发明属于基于序列设计的变换域通信系统(TDCS,Transform Domain Communication System)的改进方案,引入良好相关特性序列和扩频结构,特别适用于需要满足海量用户的多址接入系统中本发明提出一种基于序列设计的、能够提高多址接入能力的TDCS系统改进方法,在保持上述优势的条件下,采用直接针对周期相关特性进行优化的良好相关序列,命名为最小化周期集成旁瓣序列(Minimizer for Periodic Integrated Sidelobe Level,MIPSL),作为初始相位序列,然后通过与扩频序列逐元素相乘扩展成序列集合,再分配给不同的用户。
本发明属于生物技术领域,涉及包含核酸的检测方法,具体涉及一种寡核苷酸探针设计方法。本发明所述的寡核苷酸探针设计方法包括以下步骤:(1)针对靶基因,设计出长度为50mer的靶基因寡核苷酸探针;(2)设计出与靶基因同源性不大于40%的长度为10mer的通用序列;(3)将通用序列分别连接在靶基因寡核苷酸探针的两端构建出寡核苷酸探针采用本发明所述的设计方法构建的人免疫缺陷病毒寡核苷酸探针,其序列为SEQ ID NO:1。对本发明获得的通用序列的互补序列进行荧光标记得到荧光标记的互补序列。荧光标记的互补序列可以用来检测寡核苷酸芯片质量,具有灵敏度高的优点,尤其适合临床病原体基因的检测芯片设计。
本发明涉及用于提供用于检测感兴趣有机体(organism of interest)的靶核酸分子的寡核苷酸设计用核酸序列数据集的计算机实施方法。本发明根据分类学名称(Taxonomic name)和/或分类学标识符(Taxonomic ID)对从靶核酸分子的同义词(synonym)检索的多个核酸序列数据进行比对并从具有相同分类学名称和/或分类学标识符的多个核酸序列数据中选定分类学代表序列,基于同源性对所选定的上述分类学代表序列进行分组(grouping)并从各个组中选定组代表序列之后,提供与上述组代表序列具有规定值以上同源性的寡核苷酸设计用核酸序列数据集。其结果是,不仅可以无遗漏地检索上述靶核酸分子的多个靶核酸序列,而且可以准确形成比对结果,以将检索的多个靶核酸序列用于寡核苷酸的设计。