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[发明专利]一种多重qPCR引物及探针的设计方法及系统-CN202311071037.9在审
发明人：赵良怀 -专利权人：赵良怀
申请日： 2023-08-24 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明涉及引物探针技术领域，提供一种多重qPCR引物及探针的设计方法包括：对每一条DNA链，从第一个碱基开始截取第一预设长度的DNA子链，将符合上游引物判断条件的DNA子链作为上游引物；基于每一个上游引物生成互补链，从互补链的第一个碱基开始截取第四预设长度的DNA子链，将符合下游引物判断条件的DNA子链作为下游引物；S4：从DNA链中上游引物之后的碱基位置开始截取第六预设长度的DNA子链，并将符合探针判断条件的DNA子链作为探针；S5：将每一条DNA链中的每一组引物组合与剩余的DNA链中的引物组合进行碱基互补比对，对每一组引物组合比对过程中的最大碱基互补数进行累加，将引物组合按照组合分数从小到大进行排序，输出排序中前预设数量的引物组合。
一种多重 qpcr 引物探针设计方法系统

[发明专利]一种大批量开发薏苡基因组SNP分子标记的方法以及开发的引物和试剂盒-CN202310579702.9在审
发明人：苗贵东;徐营 -专利权人：兴义民族师范学院
申请日： 2023-05-22 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种大批量开发薏苡基因组SNP分子标记的方法以及开发的引物和试剂盒。包括以下步骤：(1)构建薏苡转录组文库；(2)基于已有的薏苡转录文库选取含有潜在SNP标记的序列，然后再将其与步骤(1)构建得到的薏苡转录组文库进行对比，筛选得到目标序列；(3)基于目标序列中潜在的SNP位点设计引物；(4)采用步骤(3)设计得到的引物对不同的待开发样品进行PCR扩增即可。本发明首次发掘出与薏苡基因关联的SNP分子标记，分子标记将与功能基因紧密连锁，为后续标记辅助育种研究奠定基础。同时，将利用发掘的多态分子标记进行晴隆糯薏苡遗传多样性评价，为薏苡种质资源评价提供遗传学依据。
一种大批量开发薏苡基因组 snp 分子标记方法以及引物试剂盒

[发明专利]一种miRNA引物探针设计方法、试剂盒及一步定量检测方法-CN202310757778.6在审
发明人：王凯;王小梅;宋丽双;赵国栋;熊尚岷 -专利权人：苏州唯善生物科技有限公司
申请日： 2023-06-26 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种miRNA引物探针设计方法、试剂盒及一步定量检测方法，利用本发明提供的引物探针设计方法设计的引物探针，搭配优化的试剂盒，完成对miRNA的一步定量检测，具体步骤包括：s1使用逆转录引物对待检测的miRNA进行逆转录，得到逆转录产物cDNA；s2利用颈环序列与cDNA进行拼接，得到拼接产物；s3使用正向引物、逆转录引物和探针对拼接产物进行荧光定量PCR扩增。本发明将逆转录和PCR检测在同一反应体系中通过一个PCR程序完成，实现对miRNA的一步定量检测，不仅简化操作步骤，也有效避免中途开盖造成污染，具有更高的检测的灵敏度和特异性。
一种 mirna 引物探针设计方法试剂盒一步定量检测

[发明专利]一种用于相邻SNP检测的引物和探针及其设计方法-CN202310741854.4在审
发明人：朱海涛;裘惠良;陈思伊;方美红 -专利权人：杭州美联医学股份有限公司;杭州千基生物科技有限公司
申请日： 2023-06-21 - 公布日： 2023-09-15 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明提供一种用于相邻SNP检测的引物和探针及其设计方法，该方法中引物的设计方法为将两个位点设计在一个扩增子内，其中上游引物Fb和下游引物Rb的5’末端均采用生物素进行修饰，同时将第一个位点的野生型和突变型的捕获探针设计为正向，将第二个位点的野生型和突变型的捕获探针设计为反向；扩增产物变性后，两个位点的探针分别与相反方向带生物素的单链DNA杂交，避免了两个位点探针设计在同一条链上的竞争性杂交。本发明方法简单，把两个位点的竞争杂交改为独立杂交，能够有效提高相邻SNP检测的灵敏度。
一种用于相邻 snp 检测引物探针及其设计方法

[发明专利]一种用于筛选SNP位点的方法及其应用-CN202011312696.3有效
发明人：王瑞如;王寅;白健;屈紫薇;吴琳 -专利权人：福建和瑞基因科技有限公司;北京和瑞精准医疗器械科技有限公司
申请日： 2020-11-20 - 公布日： 2023-09-12 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于筛选SNP位点的方法及其应用，涉及基因工程技术领域，该方法包括根据获取的N例样本基因组中的SNP候选位点的突变频率信息，将满足筛选标准的位点作为多用途SNP位点，对满足筛选标准的多用途SNP位点进行判断，使单一染色体上相邻多用途SNP位点之间的距离＞250kb～350kb。该方法能快速筛选出一批均匀分布于基因组中并且性能稳定的杂合性位点的合集，该合集具有多种广泛的用途，如应用于样本污染水平的检测、基因杂合性缺失的检测以及肿瘤基因组倍性检测中，具有检测成本更低，检测时间快且检测有效性更高等优点。
一种用于筛选 snp 方法及其应用

[发明专利]一种用于量子点芯片平台SNP检测的探针及其设计方法-CN202310741868.6在审
发明人：朱海涛;裘惠良;方美红;陈思伊 -专利权人：杭州美联医学股份有限公司;杭州千基生物科技有限公司
申请日： 2023-06-21 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明提供一种用于量子点芯片平台SNP检测的探针及其设计方法，该方法具体为：对捕获探针中的突变型探针进行设计，所述突变型探针为寡核苷酸单链DNA，在靠近3’末端倒数3‑5个碱基的位置上引入1个错配，并在3’端或5’端标记氨基；在所述寡核苷酸单链DNA与氨基间连接有间臂，间臂为脂肪酸C链和oligo dT中的一种或两种的组合，所述脂肪酸C链的C的数量为1～12的整数，所述oligo dT的dT的数量为1～30的整数。本发明方法可有效提高量子点芯片平台检测SNP的特异性。
一种用于量子芯片平台 snp 检测探针及其设计方法

[发明专利]用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒-CN202310232760.4在审
发明人：申耘;吴晓卫;田洁 -专利权人：深圳市朗瑞生物科技有限公司
申请日： 2023-02-28 - 公布日： 2023-08-04 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒，方法包括:获取具有多态性区域的靶基因序列；将所述靶基因序列中的高度保守区作为引物结合区，将具有多态性位点的区域作为扩增区，设计与所述靶基因序列对应的若干个检测对，其中，每一个所述检测对包括上游引物、下游引物和探针序列，所述探针序列对应的结合区域覆盖至少一个所述多态性位点，且所述探针序列与所述靶基因序列存在非匹配位点；基于预设的筛选规则，对所述探针序列进行筛选，得到与所述多态性区域对应的目标探针。本发明能够提高对于基因多态性检测的精确度，减少漏检的发生，同时有效提高检测效率、减少探针使用数量、提高单管检测通量。
用于基因多态性检测探针设计方法试剂盒

[发明专利]TCF3-PBX1融合基因检测探针、试剂盒和方法-CN202310019705.7在审
发明人：张道允;巩子英;孙永华;苏晴;虞洪杰;任燕勤;殷运菊 -专利权人：嘉兴允英医学检验有限公司
申请日： 2023-01-06 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明涉及一种TCF3‑PBX1融合基因检测探针的制备方法，通过优化探针以及独特的检测方法，可在4h～5h内完成杂交实验，节约了杂交实验所耗费的时间，降低了杂交背景和制备成本。采用本发明制备的TCF3‑PBX1融合基因检测探针用于TCF3‑PBX1融合基因检测时，具有很高的特异性和样本检出率。
tcf3 pbx1 融合基因检测探针试剂盒方法

[发明专利]一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒-CN202310152959.6在审
发明人：何崇单;申耘;田洁 -专利权人：深圳市朗瑞生物科技有限公司
申请日： 2023-02-09 - 公布日： 2023-07-07 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒，方法包括:获取具有多态性区域的靶基因序列，所述靶基因序列包括插入/缺失多态性位点；将所述靶基因序列中的高度保守区作为引物设计区，将具有多态性位点的区域作为扩增区，以所述多态性位点作为探针结合区，设计与所述靶基因序列对应的若干个检测对，其中，每一个所述检测对包括上游引物、下游引物和探针序列，所述探针序列包括分别与所述插入序列的上游区域、插入片段的重复区域和所述插入序列的下游区域结合的片段；基于预设的筛选规则，对所述探针序列进行筛选，得到目标探针。本发明通过单条探针实现对基因多态性的精确检测，提高检测效率。
一种用于基因多态性检测探针设计方法试剂盒

[发明专利]rRNA探针及其制备方法和应用-CN202310158080.2在审
发明人：张怡然;王冰;郝艳同;周冰;廖蕊;周启明 -专利权人：南京求臻基因科技有限公司;求臻医学科技（浙江）有限公司
申请日： 2023-02-23 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本申请公开了一种rRNA探针及其制备方法和应用，所述rRNA探针的制备方法包括以下步骤：从人源细胞中提取总RNA，基于总RNA合成cDNA；分别使用预先设计的引物组，以cDNA为模板进行PCR扩增，得到扩增产物；分别将各扩增产物变性成单链DNA；分别对各单链DNA进行环化处理，得到环化DNA；分别向各环化DNA中加入DNA聚合酶和滚环扩增引物组，进行滚环扩增，得到rRNA长探针；对各rRNA长探针进行超声打断，得到rRNA探针片段；将各rRNA探针片段混合，得到rRNA探针。本申请解决了现有技术去除总RNA中的rRNA成本较高且操作繁杂的技术问题。
rrna 探针及其制备方法应用

[发明专利]一种基于VPCR-Cas13a的CRP2C19基因多态性检测方法-CN202211617923.2在审
发明人：刘猛;吴云萍;常洋洋;刘毅 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2022-12-15 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于VPCR‑Cas13a的CYP2C19基因多态性检测方法，属于分析检测技术领域。本发明首次提出通过结合“V型”聚合酶链式扩增反应(VPCR)、T7RNA聚合酶转录以及CRISPR‑Cas13a系统，大大缩短传统PCR扩增所需要的时间，构建了针对氯吡格雷相关代谢基因CYP2C19基因多态性的快速、高特异性检测方法。本发明通过对CRISPR‑Cas13a体系中crRNA的设计，在与等位基因结合位点的两侧引入错配，大幅提高了Cas13a对目标基因识别的特异性，可区分单碱基错配；对CYP2C19*2、*3、*17野生型等位基因响应信噪比可分别高达～44、～6、～39倍，对其突变型等位基因响应信噪比可分别高达～7、～5、～39倍。同时，本发明的检测方法可以在60分钟内完成全部操作，具有快速响应的特点，有望用于临床样本快速检测的潜力。
一种基于 vpcr cas13a crp2c19 基因多态性检测方法

[发明专利]一种辅助突变引物的设计方法及其应用-CN202010058933.1有效
发明人：闫亚平;张鑫 -专利权人：陕西师范大学
申请日： 2020-01-19 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种辅助突变引物的设计方法及其应用，该设计方法包括以下过程：利用LAMP技术，将待测碱基位于引物的3’端，然后人为突变待测碱基相邻位置的碱基，获得辅助突变引物；从而使DNA聚合酶在扩增过程中能够准确识别位于引物3’端的待测碱基，显著提高了Bst DNAP olymerase对引物3’端的识别能力，避免了探针的设计和使用，降低了检测费用，提高了检测试剂保存的稳定性；使用该方法设计CYP2C19*2和CYP2C19*3基因检测的引物组，并将该引物组用于制备基因突变检测试剂盒。该技术在实现精准检测的同时，也实现了即时检测，并降低了检测费用和推广难度。
一种辅助突变引物设计方法及其应用

[发明专利]一种检测探针、其制备方法及应用-CN202010867470.3有效
发明人：程欢欢;陈莹;谢红娴;兰凯;黄龙 -专利权人：广州鼓润医疗科技有限公司
申请日： 2020-08-25 - 公布日： 2023-06-02 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测探针、其制备方法及应用，属于生物领域；本发明方法通过使用minicircle质粒结合滚环扩增的方法扩增得到全长的探针片段，进一步通过超声打断制备得到不同长度需求的探针；本发明方法可用于生产DNA探针或者RNA探针，制备方法简单、产量大、成本低，可将制备周期缩短至1天。另外，本发明方法制备的探针长度不受限，可根据需要提供不同目标及不同长度的探针，均一性好、纯度高，大大地提高了探针的捕获性能，使得目标区域的测序均一性、深度更佳，更进一步降低实验成本。
一种检测探针制备方法应用

[发明专利]用于配对端测序文库制备的方法-CN202180059258.7在审
发明人：锡南·阿尔斯兰;赵军花;莫利·何;威廉·莱特;马修·克林格;迈克尔·普雷维特 -专利权人：元素生物科学公司
申请日： 2021-05-19 - 公布日： 2023-05-23 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本文提供了用于生成环状核酸分子和环状核酸文库的方法。该方法可用于生成靶核酸分子的克隆群体以用于下游应用，诸如测序。还提供了用于对环状核酸分子进行测序的核酸测序方法、系统和试剂盒。
用于配对序文制备方法

[发明专利]一种RNAseq融合基因引物生成方法、血液肿瘤MRD动态监测的方法及计算机可读存储介质-CN202310108069.5在审
发明人：颜呈呈;李冬梅;周剑峰;韩晓雪;刘娅琛;熊炜;陈建春;贾晓冬;李行 -专利权人：天津金域医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-02-13 - 公布日： 2023-05-16 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明提供一种RNAseq融合基因引物生成方法，包括将融合基因信息依照第一比对规则与参考基因组的基因注释信息进行比对，获得断裂点所在外显子信息；外显子信息与参考基因组的基因组信息进行比对，依照正负链判断策略选取得到每个左侧和右侧断点转录本的外显子的序列；将断裂点所在外显子信息以及外显子的序列输入脚本以获得设计引物的目标序列，根据断裂点所在外显子信息计算断裂点与外显子边界的距离并依照第二比对规则判断并输出断裂点位置；将设计引物的目标序列与上一目标序列比对，判断断裂点附近的序列是否相似，是则输出上一次输出文件；否则输出本次输出文件。本发明能够根据融合基因信息生成设计引物的目标序列。
一种 rnaseq 融合基因引物生成方法血液肿瘤 mrd 动态监测计算机可读

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