[发明专利]一种鉴定木薯块根肉质颜色的分子标记方法

摘要

本发明公开了一种鉴定木薯块根肉质颜色的分子标记方法，该方法采用CTAB法从木薯叶片中提取木薯基因组DNA，设计一对特异引物扩增包含PSY2基因SNP2位点的260bp核苷酸序列，然后对木薯基因组DNA进行PCR扩增，利用限制性内切酶AluI酶切PCR扩增产物，使用浓度为3.0%琼脂糖凝胶对酶切产物进行电泳分离，然后根据电泳结果进行木薯材料的块根颜色判定。本发明可用于木薯块根肉质颜色的分子标记辅助育种，可实现在苗期时通过抽提叶片DNA进行分子标记分析检测，进而准确鉴别木薯块根肉质颜色，能快速选择符合育种目标的块根肉质颜色材料进行大田移栽，从而提高育种效率，加快育种进程。

主权项

1.一种鉴定木薯块根肉质颜色的分子标记方法，其特征在于，由以下步骤组成：(1)采用CTAB法从木薯叶片中提取木薯基因组DNA，根据PSY2基因的DNA序列，设计一对特异引物可以扩增包含SNP2位点的260bp核苷酸序列，然后用该特异引物对木薯基因组DNA进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(2)利用限制性内切酶AluI酶切步骤(1)得到的PCR扩增产物，获得酶切产物；(3)使用浓度为3.0％琼脂糖凝胶对步骤(2)的酶切产物进行电泳分离，然后根据电泳结果进行木薯材料的块根肉质颜色判定，块根肉质颜色判定标准为：若电泳后可见2条带——194bp和66bp，或电泳后见1条带——194bp，则该木薯材料的块根肉质颜色为黄色；若电泳后可见2条带——172bp和66bp，或电泳后见1条带——172bp，则该木薯材料的块根肉质颜色为白色；若是电泳后可见3条带——194bp、172bp和66bp，或电泳后见2条带——194bp和172bp，则该木薯材料的块根肉质颜色为浅黄色；在步骤(1)，所述特异引物核苷酸序列为：上游引物：5’GCTTCACACATAACGCCAACA‑3’；下游引物：5’TGGCTGAAACAGATGTTCAAAGG‑3’。