本发明公开了一种与葡萄抗白腐病关联的分子标记VMC2B1‑1及其应用。所述分子标记VMC2B1‑1是以葡萄品种‘黑比诺’的基因组DNA为底物进行PCR扩增所得的长度为301bp的DNA片段。所述分子标记VMC2B1‑1的正向引物序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。分子标记VMC2B1‑1对抗性表型的贡献率达到了58.7%,存在着显著连锁不平衡,且得到统计概率的支持(显著系数p<0.01),因此VMC2B1‑1为与葡萄白腐病抗性高度关联分子标记。本发明分子标记VMC2B1‑1可用于葡萄抗病育种进行早期选择,对于提高育种效率具有重要的理论和实践指导意义。