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[发明专利]一种可断裂交联肽段鉴定方法、鉴定结果评估筛选方法-CN202111437089.4在审
发明人：陈镇霖;毛鹏志;谭永卿;迟浩;贺思敏 -专利权人：中国科学院计算技术研究所
申请日： 2021-11-30 - 公布日： 2022-02-15 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明提供一种可断裂交联肽段鉴定方法，针对可断裂交联肽段的每一张二级谱图，所述方法包括如下步骤：S1、提取谱图中质量差为交联剂对应固定质量差的特征双峰，以特征双峰对应的质量为α肽段质量，基于可断裂交联肽段对应的母离子质量获取与α肽段质量互补的β肽段质量得到α肽段质量和β肽段质量组成的候选质量对；其中，所述母离子质量通过可断裂交联肽段的一级谱图校准获得；S2、根据步骤S1得到的候选质量对，分别以候选质量对中的α肽段质量和β肽段质量为依据，从蛋白质数据库中筛选出多条分别与α肽段质量和β肽段质量相等的候选肽段，并将α肽段质量的所有候选肽段与β肽段质量的所有候选肽段分别组成成对的候选交联肽段形成候选交联肽段集合，根据预设的碎片离子对候选交联肽段集合中的交联肽段进行匹配打分，选取其中打分最高的交联肽段。
一种断裂交联鉴定方法结果评估筛选

[发明专利]肽段可检测性预测方法及系统-CN202111402298.5有效
发明人：付岩;杨婧涵 -专利权人：中国科学院数学与系统科学研究院
申请日： 2021-11-19 - 公布日： 2022-06-03 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种肽段可检测性预测方法及系统，该方法包括：对所有蛋白序列进行理论酶切，得到各理论酶切肽段；利用预先训练得到的基于肽序列的肽段可检测性预测模型确定各理论酶切肽段的第一可检测性概率，所述肽段可检测性预测模型为循环神经网络利用本发明方案，可以提高肽段可检测性预测的准确性。
肽段可检测预测方法系统

[发明专利]一种酶切概率辅助的肽段可检测性预测方法-CN201810901107.1有效
发明人：常乘;付岩;高志强;朱云平 -专利权人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院;北京蛋白质组研究中心;中国科学院数学与系统科学研究院
申请日： 2018-08-09 - 公布日： 2020-04-17 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种酶切概率辅助的肽段可检测性预测方法，其步骤包括：1)在所有鉴定蛋白中筛选高可信蛋白；2)构建酶切位点酶切概率预测模型训练集；3)训练酶切位点酶切概率预测模型；4)对所有高可信蛋白进行理论酶切，得到理论酶切肽段；5)预测所有理论酶切肽段的酶切概率；6)构建肽段可检测性训练集；7)训练肽段可检测性模型；8)预测其他蛋白的所有理论酶切肽段的肽段可检测性。本发明根据鸟枪法蛋白质组学流程的特点，在肽段可检测性预测过程中考虑的蛋白的酶解过程，显著提高了肽段可检测性预测的准确率。
一种概率辅助肽段可检测预测方法

[发明专利]一种硫巯化翻译后修饰肽段的定性与定量方法-CN201611020027.2有效
发明人：张丽华;吴琼;袁辉明;杨开广;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2016-11-21 - 公布日： 2020-01-07 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种硫巯化翻译后修饰肽段的定性与定量方法。所述的方法分为两条路线：路线A和路线B。其中，路线A是把蛋白酶解产生的肽段与碘乙酰胺的小球孵育，对巯基肽段和硫巯基肽段进行富集后；通过还原剂将硫巯基肽段的二硫键还原释放，进而用可断裂的同位素亲和标签标记释放下来的硫巯基肽段，最后使用裂解液将可断裂的同位素亲和标签的连接臂断裂路线B是用可断裂的同位素亲和标签标记含巯基和硫巯基的蛋白、蛋白酶解、亲和富集巯基肽段和硫巯基肽段；最后用裂解液将连接在巯基肽段和硫巯基肽段上的可断裂的同位素亲和标签的连接臂断裂。该方法具有选择性好、假阳性低等优点，可实现复杂蛋白质组样品中规模化硫巯化肽段的定性与定量。
巯基肽亲和标签同位素可断裂肽段巯化翻译后修饰定性蛋白酶解连接臂裂解液巯基断裂复杂蛋白质碘乙酰胺亲和富集释放二硫键规模化还原剂假阳性孵育富集小球还原蛋白

[发明专利]一种用于研究蛋白质结构或蛋白质相互作用的分析方法-CN201610453993.7有效
发明人：张丽华;方菲;赵群;杨开广;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2016-06-22 - 公布日： 2020-08-11 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：使用两侧具有反应活性基团且具有可断裂基团的交联剂将细胞内蛋白质复合体进行交联并酶解，取一部分酶解产物进行衍生化反应后进入质谱分析；另一部分酶解产物使用化学法断裂交联剂后，使用富集材料将肽段进行富集，将富集出的肽段洗脱后进入质谱分析，根据搜库结果可确定发生交联的肽段，从而建立肽段库。通过交联肽段质谱谱图中确定的发生交联肽段的N端氨基酸信息可在肽段库中找到候选肽段，结合交联肽段质谱谱图m/z和肽段特征离子可确定交联肽段序列，从而获取蛋白质结构及蛋白质相互作用信息。
一种用于研究蛋白质结构相互作用分析方法

[发明专利]一种利用定向肽库检测蛋白质与其他分子相互作用的方法-CN201310290034.4有效
发明人：松阳洲 -专利权人：广州美格生物科技有限公司
申请日： 2013-07-10 - 公布日： 2014-01-15 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种利用定向肽库检测蛋白质与其他分子相互作用的方法，包括定向肽库的设计、定向肽库的合成构建、目标蛋白的体外表达纯化、定向肽库与目标蛋白的反应、定向肽库的肽段洗脱分离、定向肽库的肽段线性化、线性化肽段的鉴定测序步骤，所述定向肽库由线性肽或环状肽组成。运用该方法可筛选鉴定出各种激酶、抗体、蛋白酶以及任何可能与蛋白质结合的分子的结合肽段的一致序列。
一种利用定向检测蛋白质其他分子相互作用方法

[发明专利]融合蛋白组合物及其应用-CN202210291690.5有效
发明人：王雪;任红媛;吴建;朱戬;桂勋 -专利权人：上海普铭生物科技有限公司
申请日： 2022-03-24 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：本发明公开了融合蛋白组合物及其应用，其中，融合蛋白组合物包含第一融合蛋白和第二融合蛋白，其中，第一融合蛋白包括：第一肽段，第一肽段的氨基酸序列包括FRB；第二肽段，第二肽段的氨基酸序列包括IL18R1胞内区和IL18R1跨膜区，且IL18R1跨膜区的末端与第一肽段相连；第二融合蛋白包括：第三肽段，第三肽段的氨基酸序列包括FKBP；第四肽段，第四肽段的氨基酸序列包括IL18RAP胞内区和IL18RAP跨膜区，且IL18RAP跨膜区的末端与所述第三肽段相连。该融合蛋白组合物可诱导的IL18通路激活，在雷帕霉素存在时，可激活IL18受体下游NFkB/AP1通路，促进免疫细胞活化。
融合蛋白组合及其应用

[发明专利]新型结核病亚单位疫苗AL的制备方法和应用-CN202211596789.2在审
发明人：李浩;曾令媛 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2022-12-12 - 公布日： 2023-03-28 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：融合蛋白包括：第一肽段，所述第一肽段包含Ag85A片段；第二肽段，所述第二肽段包括LpqH片段，所述第一肽段与所述第二肽段相连；亚单位疫苗包括上述的融合蛋白。本发明的融合蛋白可同时激发机体的细胞免疫与体液免疫，提高机体杀伤结核分枝杆菌的能力，该亚单位疫苗可有效预防结核病。
新型结核病单位疫苗 al 制备方法应用

[发明专利]一种抗皮肤衰老的五肽衍生肽段RS及其应用-CN202211281661.7在审
发明人：李国栋;蒋港;吴宏宇;黄晋江;赵晓蔚;蒋司嘉;陆婉英;黄青山 -专利权人：上海高科生物工程有限公司
申请日： 2022-10-19 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： C07K7/08 文献下载
摘要：本发明提供了一种抗皮肤衰老的五肽衍生肽段RS，涉及生物化学领域，所述五肽衍生肽段RS由N端到C端依次包括两亲性螺旋肽段、连接肽段和KTTKS，其中，(b)x(a)y表示连接肽段；a为不带电荷氨基酸；b为碱性氨基酸本发明意外发现，通过(b)x(a)y结构的连接肽将两亲性螺旋肽段和KTTKS连接后能够获得的五肽衍生肽段RS，亲水性好、皮肤透过率高，直接局部适用可显著提高Ⅰ型胶原蛋白表达量、增加皮肤厚度、减少皮肤褶皱
一种皮肤衰老衍生 rs 及其应用

[发明专利]一种基于质谱技术对食物中多种过敏原同步定量确证的方法及其应用-CN202310164268.8在审
发明人：王敏;符甜;刘斌 -专利权人：南开大学
申请日： 2023-02-24 - 公布日： 2023-06-27 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明公开一种基于质谱技术对食物中多种过敏原同步定量确证的方法及其应用，可同时对12种过敏原定性和绝对定量；利用同位素标记特征肽段(重标肽段)和目标特征肽段(轻标肽段)具有相同理化性质的特点，以同位素标记肽段为内标，建立轻标肽段与重标肽段面积比与过敏原含量的线性关系，内标法定量。检测时试样加入同量的重标肽段，根据是否测得目标肽段确定是否含有过敏原，根据测得轻重标肽段面积比计算得到样本中过敏原的绝对质量。本发明从实际应用场景“加工的食品制品”出发，筛选质谱响应性强的过敏原特征肽段，可以有效过滤掉受基质效应和加工过程影响的肽段，且适合多过敏原同时检测的肽段，检测方法特异性强、灵敏度高、稳定性强。
一种基于技术食物多种过敏原同步定量确证方法及其应用

[发明专利]一种血管紧张素Ⅱ受体1型免疫原性肽段及其用途-CN200610019290.X有效
发明人：廖玉华;李留东;朱峰;周子华;魏宇淼;王敏;魏芬;陈明;程翔 -专利权人：华中科技大学同济医学院附属协和医院
申请日： 2006-06-08 - 公布日： 2007-01-17 - 主分类号： C07K7/06 文献下载
摘要：本发明提供了一种血管紧张素II受体1型免疫原性肽段及其用途，所述肽段选自下述氨基酸序列：SEQ ID NO：181－187，肽段的氨基酸序列为：Ala－Phe－His－Tyr－Glu－Ser－Arg，及其类似物含有该肽段的疫苗或药物组合物，含该肽段和生理学上可接受的载体组合物、非特异性免疫反应增强剂或上述肽段的变体，所述肽段“变体”是与所述肽段区别仅在于保守性替代和/或修饰、而仍保留了肽段的治疗性、抗原性和/或免疫原性特性的肽段，肽段变体与已鉴定的肽段优选有大于70％同一性。用含有该肽段作为疫苗或药物组合物用于原发性高血压降压治疗，可通过注射的方式给予，0～8周期间内给药1～4剂，此后可定期1～3个月给予增强剂1剂，一剂中的肽段量是1pg～1μg/kg宿主。
一种血管紧张受体免疫原性及其用途

[发明专利]抗氧化肽及其制备方法及包含该抗氧化肽的化妆品-CN201810108051.4在审
发明人：葛啸虎;陈海佳;王一飞;王小燕 -专利权人：广州赛莱拉干细胞科技股份有限公司
申请日： 2018-02-02 - 公布日： 2018-05-22 - 主分类号： C07K14/435 文献下载
摘要：本发明涉及一种抗氧化肽及其制备方法及包含该抗氧化肽的化妆品。其中，抗氧化肽包括如下若干肽段：肽段M1的氨基酸序列组成为：Tyr‑Leu‑Ser‑Trp‑Lys‑Leu；肽段M2的氨基酸序列组成为：Leu‑Leu‑Thr‑Asp‑Val‑Tyr‑Gln；肽段M3的氨基酸序列组成为上述抗氧化肽的抗氧化活性高，无毒副作用、可替代人工合成抗氧化剂的天然抗氧化肽。
氧化及其制备方法包含化妆品

[发明专利]含不同截短PstS1融合蛋白AP的新型结核病亚单位疫苗的制备和应用-CN202211192711.4在审
发明人：李浩;曾令媛 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2022-09-28 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种含PstS1片段和Ag85A片段的融合蛋白和结核病亚单位疫苗。融合蛋白包括：第一肽段，所述第一肽段包含Ag85A片段；第二肽段，所述第二肽段包括PstS1片段，所述第一肽段与所述第二肽段相连；亚单位疫苗包括上述的融合蛋白。本发明的融合蛋白可同时激发机体的细胞免疫与体液免疫，提高机体杀伤结核分枝杆菌的能力，该亚单位疫苗可有效的预防结核病。
不同 psts1 融合蛋白 ap 新型结核病单位疫苗制备应用

[发明专利]基于去SUMO化酶和SAX的SUMO化肽段富集方法-CN201911212642.7有效
发明人：张丽华;李洋;单亦初;杨开广;梁振;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2019-12-02 - 公布日： 2022-08-09 - 主分类号： C12P21/06 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于去SUMO化酶和阴离子交换色谱的SUMO化修饰肽段的富集方法，首先将蛋白质样品的碱性位点酶解成多肽，在肽段水平封闭肽段的N末端和侧链的自由氨基，然后采用阴离子交换色谱预富集多肽中保留较强的SUMO化肽段，再对收集到的SUMO化肽段用去SUMO化酶进行去SUMO化，发生去SUMO化后的肽段在阴离子交换色谱中的保留将变弱，将样品再一次经过阴离子交换色谱，收集不保留的流份，通过将去SUMO化修饰的底物肽段与其他干扰肽段分离，实现对SUMO化修饰肽段的二次富集。本发明的优点是选择性高、富集效率高、可同时富集多类型的SUMO化修饰肽段、提高了SUMO化修饰位点的鉴定覆盖度。
基于 sumo sax 化肽段富集方法

[发明专利]融合有外源肽段的诺如病毒VP1蛋白、制备方法及应用-CN202010240142.0有效
发明人：霍玉奇;郑礼钧;刘金瑾 -专利权人：郑州市第六人民医院
申请日： 2020-03-31 - 公布日： 2023-02-28 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种诺如病毒的融合有外源肽段的VP1蛋白、表达载体、制备方法、VLPs及应用，该诺如病毒的融合有外源肽段的VP1蛋白，所述外源肽段为5‑24个氨基酸长度的多肽，外源肽段融合在VP1蛋白的N端。该诺如病毒的融合有外源肽段的VP1蛋白可自组装成大小均一的诺如病毒的VLPs。
融合有外源肽段病毒 vp1 蛋白制备方法应用

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