本发明公开了一种利用分子标记选育洋葱雄性不育系和保持系的方法：利用特异性引物(如SEQ ID NO.1～6所示)，通过PCR实验检测单个洋葱球核质基因型，筛选获得不育株和保持株洋葱球，实现两系配套。该检测系统能够通过一次PCR实验区分洋葱6种核质育性类型，然后利用此检测系统，从开放授粉群体内直接选育不育系和保持系，实现两系的一次性配套。该多重PCR检测系统的开发为洋葱核质互作雄性不育核质基因型的准确、快速鉴定具有重要意义。
本公开涉及用于鉴别包台型核质互作雄性不育系水稻的引物、试剂盒及其应用。该引物包括如SEQ ID NO.1所示的BT79‑F及如SEQ ID NO.2所示的BT79‑R；BT79‑F和BT79‑R用于扩增包台型核质互作雄性不育系水稻的线粒体嵌合基因Atp6‑orf79的特异性序列利用该引物可快速鉴别包台型核质互作雄性不育系，有利于提高其种子纯度鉴定效率，以保障该品系繁种的安全性。
