本公开涉及用于鉴别包台型核质互作雄性不育系水稻的引物、试剂盒及其应用。该引物包括如SEQ ID NO.1所示的BT79‑F及如SEQ ID NO.2所示的BT79‑R；BT79‑F和BT79‑R用于扩增包台型核质互作雄性不育系水稻的线粒体嵌合基因Atp6‑orf79的特异性序列利用该引物可快速鉴别包台型核质互作雄性不育系，有利于提高其种子纯度鉴定效率，以保障该品系繁种的安全性。
本发明提供了一个海岛棉纤维品质关联的类钙调磷酸酶B互作蛋白激酶基因。所述类钙调磷酸酶B互作蛋白激酶基因GbCIPK的基因组具有SEQ ID NO.1所示序列，或所述类钙调磷酸酶B互作蛋白激酶基因GbCIPK的cDNA具有SEQ ID NO.2所示序列。利用该基因SNP基因型来区分高品质和低品质单倍型，根据这两种单倍型对品种群体进行归类，并结合品质性状进行统计分析，证明GbCIPK与棉花品质性状之间存在显著的相关性。
