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[发明专利]一种检测基因编辑靶点切割效率的方法-CN202010408380.8在审
发明人：桂有静 -专利权人：重庆英茂盛业生物科技有限公司
申请日： 2020-05-14 - 公布日： 2020-07-31 - 主分类号： C12Q1/66 文献下载
摘要：本发明公开一种检测基因编辑靶点切割效率的方法。本方法采用构建含有移码突变报告基因的靶点检测载体；然后将基因编辑靶点序列插入移码突变报告基因的靶点检测载体的N端得到检测载体；然后将检测载体转入动物细胞，当核酸内切酶对靶点成功切割，细胞将修复突变报告基因，通过对报告基因活性的检测得知靶点切割效率。本方法检测灵敏、直观、能够量化；靶点切割在细胞内发生，与实际基因编辑反应条件极为相似，能够反映实际基因编辑中的靶点切割效果。
一种检测基因编辑切割效率方法

[发明专利]突变体的检测方法及其应用-CN201810340639.2在审
发明人：彭城;徐俊锋;汪小福;陈笑芸;徐晓丽;魏巍 -专利权人：浙江省农业科学院
申请日： 2018-04-16 - 公布日： 2018-08-03 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明提供了一种突变体的检测方法及其应用，涉及生物技术领域，该突变体的检测方法包括扩增待测样本的突变靶点基因和内参基因，当突变靶点基因的扩增产物的含量与内参基因的扩增产物的含量不相同时，待测样本为阳性突变体该方法只需扩增内参基因和靶点基因，当靶点基因发生突变导致靶点基因不能成功扩增，从而不能得到靶点基因的扩增产物，因此突变靶点基因相对于内参基因的扩增产物的含量就会发生变化，该方法快速灵敏，成本低并且通量大，本发明提供的上述检测方法在筛选基因编辑阳性植株中的应用，可广泛应用于多种植物的转基因阳性T0代基因编辑植株的筛选。
靶点基因扩增产物内参基因突变体突变扩增检测待测样本应用生物技术领域筛选基因阳性植株植株转基因通量灵敏筛选基因成功

[发明专利]Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质-CN202310477930.5在审
发明人：王金鹏;黄金明;鞠志花;王秀革;高亚平;刘文浩;杨春红;肖遥;张亚冉;魏晓超;姜强;张桂香;刘丑生;邱小田;李姣;李广栋 -专利权人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所;全国畜牧总站
申请日： 2023-04-25 - 公布日： 2023-10-24 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明属于基因测序领域，提供了一种Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质。其中，Sanger基因测序结果快速判读方法包括获取Sanger基因测序文件，基于所述测序文件提取每个测序位点的四个碱基的信号值，判断每个测序位点的纯合或杂合状态，生成主要序列和次要序列；获取配置文件信息，根据靶位点的锚定序列在主序列中定位靶位点的位置，进而确定出靶位点的纯合或杂合状态并提取出主要序列和次要序列中的靶位点碱基，得到靶位点的基因型；根据靶位点的基因型及靶位点的位置，输出基因型或氨基酸报告。
sanger 基因结果快速判读方法系统介质

[发明专利]一种快速筛选CRISPR-Cas9基因组编辑gRNA靶位点的方法-CN202110461387.0在审
发明人：毕方铖;张森;吴少平;胡春华;窦同心;易干军 -专利权人：广东省农业科学院果树研究所
申请日： 2021-04-27 - 公布日： 2021-07-09 - 主分类号： C12Q1/66 文献下载
摘要：本发明公开了一种快速筛选CRISPR‑Cas9基因组编辑gRNA靶位点的方法，涉及基因编辑技术领域，包括以下步骤：(1)在靶标基因的不同位置设计N个靶点，分别构建基因组编辑载体和LUC融合靶点的表达载体；(2)测试LUC融合靶点后载体中双荧光素酶能正常表达；(3)将N个靶点的基因组编辑载体与LUC融合靶点载体共表达原生质体，利用双荧光素酶报告系统测定原生质体LUC和REN的活性，比较N个靶点LUC/REN的比值，确定最小比值者为最佳靶点。本发明方法具有靶位点的选择不受限制性内切酶位点的限制，可选择性广，且成本低，能够快速筛选出基因编辑活性高的靶位点进行下一步CRISPR‑Cas9基因组编辑工作。
一种快速筛选 crispr cas9 基因组编辑 grna 靶位点方法

[发明专利]一种溃疡性结肠炎治疗靶点的识别方法、系统、装置-CN202311015039.6在审
发明人：欧海亚;范维;程宏辉 -专利权人：深圳市宝安区中医院
申请日： 2023-08-11 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G16B35/20 文献下载
摘要：本发明公开溃疡性结肠炎治疗靶点的识别方法、系统、装置，包括：获取差异表达基因；对差异表达基因进行富集分析；获取免疫调节相关基因，量化基因数据集中免疫细胞的相对浸润水平；构建基因共表达网络，筛选活动期与非活动期的关键模块基因；构建中药‑小分子‑靶点网络，筛选出中药治疗靶点；获取中药调节免疫的候选基因，PPI分析以及功能富集分析，阐述候选基因潜在的作用机制；通过机器学习筛选得到核心靶点；基于所述核心靶点，结合临床症状及药理层面筛选出作用于该核心靶点的中药；通过分子对接验证、分子动力学模拟验证中药所包含的小分子作用于该核心靶点后形成复合物的稳定性。本发明快速识别对溃疡性结肠炎有效的治疗靶点。
一种溃疡性结肠炎治疗识别方法系统装置

[发明专利]玉米和大豆中复合性状基因座的位点特异性整合位点的产生和使用方法-CN201580048807.5在审
发明人： A.M.吉干;郜会荣;Z-B.刘;J.穆蒂;D.波里奇;C.斯塞龙格 -专利权人：纳幕尔杜邦公司;先锋国际良种公司
申请日： 2015-08-31 - 公布日： 2018-05-22 - 主分类号： A01H5/00 文献下载
摘要：本发明提供了将位点特异性整合(SSI)的转基因靶位点和/或目的多核苷酸导入到植物基因组的基因组窗口中的双链断裂诱导剂的至少一个双链断裂靶位点中的组合物和方法。本发明还提供了在植物的基因组窗口中产生复合性状基因座的方法和组合物，该植物基因组窗口包含整合进至少双链断裂靶位点中的至少一个位点特异性整合的转基因靶位点。双链断裂靶位点可为但不限于锌指内切核酸酶、工程化内切核酸酶、大范围核酸酶、TALEN和/或Cas内切核酸酶的靶位点。所述植物的基因组窗口可包含至少一个目的基因座，诸如性状盒、转基因、突变基因、天然基因、编辑基因或位点特异性整合(SSI)靶位点。
玉米大豆复合性状基因特异性整合产生使用方法

[发明专利]一种功能性肽的筛选方法-CN202210060585.0在审
发明人：刘会平;蒋泽根;乐国伟;施用晖 -专利权人：时代生物科技（深圳）有限公司;江南大学(扬州)食品生物技术研究所
申请日： 2022-01-19 - 公布日： 2022-04-29 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开一种功能性肽的筛选方法，该法低成本、高效环保，具体为：调用与所需筛选的功能性肽的功能类型相关的调控网络；找出与功能类型相关的第一基因靶点集合；对已测序的各个肽段进行功能靶点预测，筛选得到与功能类型相关的第二基因靶点集合；将第二基因靶点集合与第一基因靶点集合进行关联处理得到功能靶点；根据功能靶点，构建蛋白互作网络，进行节点图可视化分析，获得基因互作网络图，识别得到核心模块和关键基因；利用R语言计算蛋白、基因的节点边数，归一化处理后获得功能靶点中各个靶点的第一得分；单个肽段的各个靶点的第一得分分别乘以对应的相似系数后求和，即为该单个肽的功能得分；选取排名前20的且疏水性0～3的肽段作为候选肽。
一种功能筛选方法

[发明专利]小分子RNA的调控位点及其应用-CN201010101254.4无效
发明人：周明;顾连峰;刘春艳;崔霞;宋显伟;曹晓风 -专利权人：中国科学院遗传与发育生物学研究所
申请日： 2010-01-26 - 公布日： 2012-01-04 - 主分类号： C12N15/29 文献下载
摘要：本发明涉及miRNA的10个靶位点，这些靶位点是长度为18-24nt的脱氧核苷酸序列，在生物体内，miRNA通过这些靶位点实现对基因的调控。通过突变这些靶位点可以调控基因的表达，本发明为筛选高效的抗病抗虫基因提供了丰富的基因资源。
分子 rna 调控及其应用

[发明专利]对细胞中的靶位点进行基因编辑的方法-CN202010949701.5在审
发明人：张楫钦;杨佳璇;杜冰;刘明耀;席在喜 -专利权人：华东师范大学;上海邦耀生物科技有限公司
申请日： 2020-09-10 - 公布日： 2022-03-11 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明提供了对细胞中的靶位点进行基因编辑的方法，具体地，本发明公开了一种对细胞基因组的靶位点进行基因编辑的方法，包括：(a)提供一待基因编辑的细胞；(b)将(i)基因编辑酶或其编码核酸或表达所述基因编辑酶的第一表达载体；和(ii)gRNA或表达所述gRNA的第二表达载体导入所述细胞中，对所述细胞基因组的靶位点进行基因编辑，所述gRNA引导基因编辑酶对靶位点进行定点切割；其中，所述gRNA靶向的靶向序列包含SEQ ID本发明的方法可对靶位点进行高效基因编辑。
细胞中的靶位点进行基因编辑方法

[发明专利]一种增大水稻粒形的sgRNA靶点序列、重组载体及其应用-CN202210679187.7在审
发明人：赵春芳;赵庆勇;张亚东;梁文化;路凯;赫磊;王才林 -专利权人：江苏省农业科学院
申请日： 2022-06-15 - 公布日： 2022-09-09 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明提供一种增大水稻粒形的sgRNA靶点序列，包括sgRNA1靶点和sgRNA2靶点，所述sgRNA1靶点序列为CTCCCGCATGACGACGGAGT，所述sgRNA2靶点序列为CAGCGCTGTGATCGAGAAGA本发明还提供了一种包含所述的sgRNA靶点序列的重组载体及其应用。本发明通过CRISPR/Cas9基因编辑技术对水稻qGL3基因特定序列进行定点编辑，基因突变后能够增加水稻的粒长、粒宽和粒重，为水稻粒形改良研究提供了基因资源和技术思路。
一种增大水稻 sgrna 序列重组载体及其应用

[发明专利]一种基于多探针富集168基因靶区域的方法-CN201510333113.8在审
发明人：汉雨生;揣少坤;段飞蝶 -专利权人：广州燃石医学检验所有限公司
申请日： 2015-06-16 - 公布日： 2015-12-02 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于多探针富集168基因靶区域的方法，通过将选择来自TCGA数据库以及目前肺癌获批靶向药物靶点、其他肿瘤靶向药物靶点、临床试验中的靶向药物靶点的168个基因组合在一起，并通过探针捕获技术一次性富集168个基因多靶点序列，从而实验多基因多靶点并行深度高通量测序，且同时检查基因的多种变异类型，如突变，缺失，插入，融合，拷贝数扩增，在检测的深度和广度上均优于现有的技术。
一种基于探针富集 168 基因区域方法

[发明专利]xCas9基因编辑系统在基因组编辑中的应用-CN202011398790.5有效
发明人：杨进孝;张成伟;刘新香;刘亚 -专利权人：北京市农林科学院
申请日： 2020-12-02 - 公布日： 2022-09-16 - 主分类号： C12N15/84 文献下载
摘要：本发明公开了xCas9基因编辑系统在基因组编辑中的应用。所述xCas9基因编辑系统包括xCas9和sgRNA。所述基因组编辑的方法包括如下步骤：将xCas9和sgRNA导入生物体或生物细胞内，实现基因组靶点序列的编辑；所述编辑为使所述靶点序列或其邻近序列发生碱基插入和/或缺失；所述sgRNA靶向靶点序列；所述靶点序列的通过实验证明：本发明的xCas9基因编辑系统可对位于生物基因组上的PAM序列为GAD或NGN的靶点序列或其邻近序列进行编辑，大大拓展了可编辑靶点的范围。
xcas9 基因编辑系统基因组中的应用

[发明专利]复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法-CN202210586319.1在审
发明人：魏龙;杨欢 -专利权人：江苏大学
申请日： 2022-05-26 - 公布日： 2022-09-20 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：本发明公开了复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的筛选方法，包括以下步骤，步骤1、获取CRC中相关靶点的数据，基于差异基因筛选技术分别筛选出关键基因；步骤2、获取复方斑蝥胶囊中十一味中药靶点的数据，对复方斑蝥胶囊进行作用靶点预测，判断其是否可以发挥治疗癌症的作用；步骤3、对复方斑蝥胶囊中君臣佐使药物进行化合物挖掘，并进行ADME活性筛选和药物靶点预测；将预测所得药物靶点与CRC的关键基因进行映射，从而找到治疗靶点；步骤4、判断治疗靶点是否可以发挥治疗CRC的作用；本发明从小分子活性化合物的层面探索复方斑蝥胶囊治疗CRC的作用机理，可以筛选结直肠癌的关键基因，提供了复方斑蝥胶囊作用于CRC的核心基因的具体筛选方法。
复方斑蝥胶囊用于 crc 核心基因筛选方法

[发明专利]一种防治幽门螺杆菌的含分子内佐剂的重组基因、蛋白及生物制品-CN201410411940.X在审
发明人：潘兴;祝洁;周永君;高礼珍 -专利权人：四川万可泰生物技术有限责任公司
申请日： 2014-08-21 - 公布日： 2014-11-19 - 主分类号： C07K19/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种防治幽门螺杆菌的含分子内佐剂的重组基因、蛋白及生物制品。所述多靶点重组基因包括具有SEQIDNO:2所示氨基酸序列的多靶点融合多肽、具有SEQIDNO:1所示的核苷酸序列的编码多靶点融合多肽的多靶点重组基因、以及上述多靶点重组基因或上述多靶点融合多肽或上述多靶点融合多肽的特异性抗体作为生物制品在预防和治疗幽门螺杆菌感染中的应用本发明通过在重组幽门螺杆菌多靶点融合多肽（rIB）的N段添加了一段去除信号肽的分子内佐剂CTB，进一步提高了对幽门螺杆菌感染的防治效果。
一种防治幽门螺杆分子佐剂重组基因蛋白生物制品

[发明专利]一种药物基因靶点预测方法-CN201510553487.0有效
发明人：袁骁;张鑫磊;朱文杰 -专利权人：苏州协云基因科技有限公司
申请日： 2015-09-02 - 公布日： 2018-12-25 - 主分类号： G06F19/16 文献下载
摘要：本发明涉及一种新的药物基因组学分析方法，公开了一种药物基因靶点预测方法。是一种基于数据整合的药物基因靶点预测方法，本发明的方法可以利用改进后的MCODE聚类算法预测新的药物基因靶点。
一种药物基因预测方法

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