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[发明专利]一种利用RNA干扰机制的基因调控或编辑系统-CN201810562128.5有效
发明人：汪阳明;王茜雯;胡鲁峰;廖乐祺;邱雅姿;石铭 -专利权人：北京大学
申请日： 2018-06-04 - 公布日： 2021-10-12 - 主分类号： C12N15/90 文献下载
摘要：本发明提供了一种利用RNA干扰机制的基因调控或编辑系统，所述基因调控或编辑系统包括以下几个部分：1.CRISPR‑Cas9基因调控或编辑组件；2.前体合成引导RNA(pre‑sgRNA)，所述前体合成引导所述基因调控或编辑系统可用于对含有目标miRNA或siRNA的细胞内的目标基因进行调控和编辑。
一种利用 rna 干扰机制基因调控编辑系统

[发明专利]白菜HSK激酶及其编码基因BraDMR1和应用-CN202210976658.0在审
发明人：于拴仓;李宁;苏同兵;张凤兰;余阳俊;张德双;赵岫云;汪潍红;李佩荣;辛晓云 -专利权人：北京市农林科学院
申请日： 2022-08-15 - 公布日： 2023-03-17 - 主分类号： C12N15/84 文献下载
摘要：本发明公开了白菜HSK激酶及其编码基因BraDMR1和应用，属于基因工程育种技术领域。本发明提供了HSK激酶或调控所述HSK激酶编码基因表达的物质或调控所述HSK激酶活性或含量的物质在调控植物霜霉病抗性中的应用，所述HSK激酶为氨基酸序列是SEQ ID No.2的蛋白质。本发明还提供了调控植物霜霉病抗性的方法，所述方法包括通过调控所述HSK激酶编码基因的表达或调控所述HSK激酶的活性或含量，来调控植物抗病性。BraDMR1基因有望用于基因工程育种，将育种中间材料中的BraDMR1基因敲除后可获得霜霉病抗性增强的材料。
白菜 hsk 激酶及其编码基因 bradmr1 应用

[发明专利]一种转录因子活性计算方法、存储器及电子设备-CN202310618765.0有效
发明人：季序我;赵义;彭鑫鑫;李哲 -专利权人：普瑞基准生物医药（苏州）有限公司;普瑞基准科技（北京）有限公司;北京普康瑞仁医学检验所有限公司
申请日： 2023-05-29 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：方法包括：在各个细胞类群中计算转录因子基因表达值和非转录因子基因表达值的互信息；根据互信息的大小和互信息的统计显著性筛选转录因子的靶标基因；根据转录因子基因表达值和靶标基因表达值的相关性筛选正向调控靶标基因和负向调控靶标基因；计算正向调控靶标基因表达值、负向调控靶标基因表达值与转录因子基因表达值的平均互信息，并将该平均互信息作为转录因子的活性。本发明基于细胞类群的基因表达信息计算转录因子活性，还基于统计学方法对转录因子潜在的靶标基因进行筛选，同时考虑正向调控和负向调控的靶标基因，提高了转录因子活性计算的准确度。
一种转录因子活性计算方法存储器电子设备

[发明专利]利用人工调控元件及其文库调控微生物染色体上基因表达强度的方法-CN201110155176.0有效
发明人：张学礼;朱欣娜;李清艳;卢焦;赵婧 -专利权人：天津工业生物技术研究所
申请日： 2011-06-10 - 公布日： 2011-12-21 - 主分类号： C12N15/67 文献下载
摘要：本发明公开了利用人工调控元件及其文库调控微生物染色体上基因表达强度的方法。本发明所提供的利用人工调控元件及其文库调控微生物染色体上基因表达强度的方法包括以下步骤：通过PCR的方法扩增出一段DNA片段，其包括与微生物染色体上待调控基因原始调控区域上游序列同源的一段含40-3000个碱基的片段、抗性标记基因、人工调控元件文库或是一个具有特定表达强度的人工调控元件、与微生物染色体上待调控基因起始密码子下游序列同源的一段含40-3000个碱基的片段；将该DNA片段电转化入微生物体内，将微生物染色体上待调控基因的原始调控区域替换为人工调控元件文库或是一个具有特定表达强度的人工调控元件。
利用人工调控元件及其文库微生物染色体基因表达强度方法

[发明专利]一种分离表型开关分子和表型相关基因群的方法-CN00815658.1无效
发明人：卞小庄 -专利权人：卞小庄
申请日： 2000-11-17 - 公布日： 2003-01-08 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及通过构建基因的调控元件文库和调控蛋白/调控元件文库,从高等动、植物复杂基因组中分离某种细胞表型开关分子和表型相关基因群的方法。依照本发明构建的调控元件文库包括所有的顺式作用元件,文库复杂度小,便于使用和操作。本发明提供的方法可用于基因定位及归类分析,用于基因发育网络和功能网络的研究。可以根据本发明的表型相关基因调控序列和表型开关分子设计有效药物,达到防治疾病的目的。
一种分离表型开关分子相关基因方法

[发明专利]一种基于分布式的大规模基因调控网络构建方法-CN201910821699.0有效
发明人：王之琼;曲璐渲;霍岳阳;信俊昌;郭上慧;钱唯 -专利权人：东北大学
申请日： 2019-09-02 - 公布日： 2022-11-08 - 主分类号： G06N7/00 文献下载
摘要：本发明提供一种基于分布式的大规模基因调控网络构建方法，涉及医学信息学领域，本发明首先利用基因间的互信息值构建出基因调控的概要网络，根据结点的连结情况将网络分为若干个子网络，在每个子网络利用贝叶斯等方法在分布式环境下计算结点的调控方向，再将子网络进行合并，从而得到最终的基因调控网络。该发明可以提高基因调控网络的构建效率，通过分析基因调控网络让我们更系统地剖析细胞的功能，更深刻地洞见生命的本质。
一种基于分布式大规模基因调控网络构建方法

[发明专利]提高酿酒酵母代谢产物产量的方法-CN201911281005.5有效
发明人：谢文平;蔡燕丰;姚红涛;吴广进;毛兴艳;鲍素敏;万丹 -专利权人：宜昌东阳光生化制药有限公司
申请日： 2019-12-09 - 公布日： 2022-04-26 - 主分类号： C12N1/19 文献下载
摘要：本发明提出了一种GAL基因调控系统。该GAL基因调控系统中，pCTR3或者pCTR1与GAL80基因可操作地连接；pCUP1与GAL4基因可操作地连接。发明人在实验中意外地发现，采用铜离子抑制型的CTR3基因启动子(pCTR3)或CTR1基因的启动子(pCTR1)替换pGAL80启动子(pGAL80)，采用铜离子诱导型的CUP1基因启动子(pCUP1)替换pGAL4启动子(pGAL4)，可使得GAL基因调控系统在铜离子的诱导下实现控制基因的表达，显著提高携带所述GAL基因调控系统的工程菌的代谢产物的产量，且GAL基因调控不受体系中葡萄糖浓度的影响。
提高酿酒酵母代谢产物产量方法

[发明专利]水稻激酶基因OsMKKK70及其同源基因在负向调控水稻孕穗期耐冷性中的应用-CN202210607466.2有效
发明人：唐佳琦;卜庆云;田晓杰;王臻昱;李秀峰 -专利权人：中国科学院东北地理与农业生态研究所
申请日： 2022-05-31 - 公布日： 2023-04-25 - 主分类号： C12N9/12 文献下载
摘要：水稻激酶基因OsMKKK70及其同源基因在负向调控水稻孕穗期耐冷性中的应用，涉及水稻基因工程领域，特别涉及水稻激酶基因OsMKKK70及其同源基因的新用途。本发明发现水稻激酶基因OsMKKK70及其同源基因OsMKKK62、OsMKKK55能够负向调控水稻孕穗期耐冷性。OsMKKK70基因、OsMKKK62基因、OsMKKK55基因共同参与调控水稻孕穗期耐冷。OsMKKK70及其同源基因OsMKKK62、OsMKKK55通过负向调控低温胁迫下GA的生物合成进而影响花药中的GA含量，最终负向调控水稻孕穗期耐冷性。本发明应用于提高水稻低温胁迫下的产量。
水稻激酶基因 osmkkk70 及其同源调控孕穗期耐冷性中的应用

[发明专利]烟草NtPED基因在调控烟草叶柄夹角中的应用-CN201811056678.6有效
发明人：张增林;郭永峰;高晓明;李伟;徐萌萌 -专利权人：中国农业科学院烟草研究所
申请日： 2018-09-11 - 公布日： 2020-07-24 - 主分类号： C12N15/82 文献下载
摘要：本发明提出一种烟草NtPED基因在调控烟草叶柄夹角中的应用，属于基因工程技术领域，能够有效调控烟草叶柄与茎间的角度，可有效改善其农艺性状，从而有助于提高烟草的产量和品质。该技术方案包括利用烟草NtPED基因克隆得到烟草叶柄调控基因，通过过量表达所述烟草叶柄调控基因降低烟草叶柄与茎间的角度；利用基因编辑技术获得烟草NtPED基因的功能缺失的基因编辑载体而增大烟草叶柄与茎间的角度本发明能够应用于烟草叶柄与茎间角度的调控中。
烟草 ntped 基因调控叶柄夹角中的应用

[发明专利]一种表达调控元件及其应用-CN202011172725.0在审
发明人：解光宁;牛小牧;梁亚峰 -专利权人：山东舜丰生物科技有限公司
申请日： 2020-10-28 - 公布日： 2021-10-29 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明提供了一种表达调控元件及其应用，具体地，涉及表达调控元件及其在调控一个或多个基因在细胞中的表达中的用途，本发明还公开了表达调控元件在植物育种中的应用。本发明进一步公开了利用本发明表达调控元件提高目标基因表达的方法，所述方法包括将本发明的表达调控元件与目标基因可操作地连接来提高该目标基因的表达。
一种表达调控元件及其应用

[发明专利]一种组织特异性基因及调控因子数据存储方法-CN201010160978.6无效
发明人：赵菲菲;宫秀军;刘新觅 -专利权人：天津大学
申请日： 2010-04-30 - 公布日： 2010-09-29 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种组织特异性基因及调控因子数据存储方法，通过建立包括组织库、基因库、基因别名库、组织特异性基因库及组织特异性基的组织库的组织特异性基因及调控因子数据库来实现数据存储，该方法包括以下步骤：利用文献挖掘的形式在Pubmed文献数据库抽取出组织特异性基因；将查到的组织信息添加到组织库中；利用基因的名字在EMBL、Genebank、NCBI中检索基因的信息，并把此信息添加到基因库对应的条目中；利用从Transfac、EPD及compel数据库中查找基因的调控信息生成基因调控因子XML文件；与现有技术相比，本发明能够使利用现代计算技术挖掘基因表达及调控网络织组特异性内在机制的研究者，方便获取组织特异性基因序列及相应调控因子的数据，充分利用组织特异性基因分析工具，提高研究的质量和效率。
一种组织特异性基因调控因子数据存储方法

[发明专利]单样本ncRNA调控网络推理方法、装置、设备及存储介质-CN202211265215.7在审
发明人：张俊鹏;孙少平;赵春文;魏雪梅;李司婧;杨燕婷 -专利权人：大理大学;玉溪市人民医院
申请日： 2022-10-17 - 公布日： 2022-12-27 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明提供一种单样本ncRNA调控网络推理方法、装置、设备及存储介质，涉及基因识别技术领域。具体实现方案包括：获取匹配样本的ncRNA和靶基因转录组数据；对匹配样本中的每个目标样本，按照预设统计算法计算去除目标样本之前和之后，ncRNA和靶基因的第一调控关系强度矩阵和第二调控关系强度矩阵；根据第一调控关系强度矩阵和第二调控关系强度矩阵，获取目标样本对应的ncRNA和靶基因的融合调控关系强度矩阵；根据目标样本对应的ncRNA和靶基因的融合调控关系强度矩阵，推理得到目标样本的单样本ncRNA调控网络。本发明可以通过构造统计相关值来反映单样本水平下ncRNA和靶基因的调控关系强度，进而推理得到单样本ncRNA调控网络。
样本 ncrna 调控网络推理方法装置设备存储介质

[发明专利]国兰开花调控基因SEP1编码序列及其应用-CN202211116010.2在审
发明人：杨凤玺;朱根发;陆楚桥;高洁;魏永路;金建鹏;谢琦 -专利权人：广东省农业科学院环境园艺研究所
申请日： 2022-09-14 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： C12N15/29 文献下载
摘要：本发明公开了一种国兰开花调控基因SEP1编码序列及其应用。本发明从中国兰花的墨兰品种‘白墨’的花器官cDNA中分离得到兰花花器官发育调控基因，提高其表达量后可造成拟南芥开花期显著提前，但不影响花器官形态结构；通过下游基因表达分析，发现该基因可正调控开花控制基因FT,SOC1,LFY1的表达，进一步表明该基因对植物开花的促进作用。本发明国兰开花调控基因可用于兰科植物开花调控分子机制的研究，以及植物开花性状的改良。
开花调控基因 sep1 编码序列及其应用

[发明专利]一种逐步回归基因调控网络的推断方法-CN200910199850.8无效
发明人：张武;张律文;肖梅;谢江;宋安平;何冰 -专利权人：上海大学
申请日： 2009-12-03 - 公布日： 2010-06-02 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种逐步回归基因调控网络的推断方法，该方法步骤如下：A.读取基因表达数据矩阵和基因扰动数据矩阵；B.确定基因表达矩阵和基因扰动矩阵是否均为标准化数据；C.对基因表达数据矩阵和基因扰动数据据矩阵分别进行数据归一化均构成标准化数据；D.分析标准化数据，计算所有基因间相关系数矩阵；E.将基因间相关系数矩阵可视化成网络，得到基因调控网络图。该方法能进行最优回归子集的选择，因此解决了高维小样本实验数据的问题；2.为目标基因逐步选择最具显著影响的调控子，符合了基因调控网络的真实情况；3.随着基因调控网络规模的增大和网络稀疏度的增加，在计算精度
一种逐步回归基因调控网络推断方法

[发明专利]调控CDIP1基因表达的核酸分子及调控方法与用途-CN202010047253.X在审
发明人：蔡冬青;廖肇福;段春翠;陈夷林;吕罗成;齐绪峰;陈洪毅;朱岿魁;郭伟敏;郑念钰;郑馨 -专利权人：暨南大学
申请日： 2020-01-16 - 公布日： 2020-08-25 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明属于生物医药领域，公开了一种调控CDIP1基因表达的核酸分子以及相关的调控方法与用途。本发明所述的调控CDIP1基因表达的核酸分子是基于miR‑21‑5p设计的。本发明所述的调控CDIP1基因表达的方法，包括：提供基于miR‑21‑5p设计的核酸分子，直接靶向CDIP1基因，以调控CDIP1基因的表达。本发明所述的调控CDIP1基因表达的核酸分子在制备治疗心肌梗死的药物中的用途，所述核酸分子是基于miR‑21‑5p设计的。本发明首次揭示了miR‑21‑5p能直接结合Cdip1的3'UTR，干扰Cdip1的基因和蛋白水平的表达，进而抑制缺血缺氧导致的细胞凋亡，因此可以基于miR‑21‑5p设计用于调控CDIP1基因表达的核酸分子
调控 cdip1 基因表达核酸分子方法用途