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[发明专利]一种基于进化算法和模糊聚类的蛋白质功能模块识别方法-CN202111552679.1在审
发明人：田野;胡佳星;司朗春;张兴义 -专利权人：安徽大学
申请日： 2021-12-17 - 公布日： 2022-03-25 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于进化算法和模糊聚类的蛋白质功能模块识别方法，其步骤包括：步骤一、基于蛋白质网络的属性初始化种群，使用进化算法优化两目标问题，寻找非重叠的蛋白质模块的最优核心蛋白质节点，从而完成非重叠的蛋白质功能模块识别；步骤二、基于步骤一得到的核心蛋白质节点，初始化子种群，并用进化算法优化新的两目标问题，确定非核心蛋白质节点的最优模糊阈值，从而完成重叠的蛋白质功能模块识别。本发明能在不预定任何参数的情况下，自适应处理不同类型的蛋白质网络结构，从而提高蛋白质功能模块识别过程的稳定性，并且在蛋白质网络中找到较多有效的蛋白质功能模块的最优划分结果。
一种基于进化算法模糊蛋白质功能模块识别方法

[发明专利]蛋白质构象预测方法、装置、电子设备及存储介质-CN202011438019.6在审
发明人：裴建国;许振雷;刘雨一;叶菲;刘伟;王晟;郑良振;黎浩添;黄俊洲;沈涛 -专利权人：腾讯科技（深圳）有限公司
申请日： 2020-12-07 - 公布日： 2022-06-10 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本申请实施例公开了一种蛋白质构象预测方法、装置、电子设备及存储介质，涉及人工智能技术在生物医学领域的应用。该方法包括：获取目标蛋白质序列对应的M个候选蛋白质构象；基于N种蛋白质排序规则，对所述M个候选蛋白质构象进行预排序，获得所述M个候选蛋白质构象对应的N种预排序结果；基于融合排序规则，对所述N种预排序结果进行处理，得到所述M个候选蛋白质构象对应的目标排序结果；根据所述目标排序结果，确定所述目标蛋白质序列对应的预测蛋白质构象。该方法可以综合多种蛋白质排序规则的不同排序方法，避免传统工具排序稳定性差问题，使得在各种蛋白质结构上，都能够有较好的预测准确性，进而提高了预测的蛋白质构象整体准确性。
蛋白质构象预测方法装置电子设备存储介质

[发明专利]营养丰富的肉结构化蛋白质产品-CN201580031848.3在审
发明人： D·安德森;J·富勒;T·盖斯特林格 -专利权人：萨维奇河公司贸易用名素食肉
申请日： 2015-04-16 - 公布日： 2017-05-17 - 主分类号： A23J3/14 文献下载
摘要：本发明提供了提供蛋白质和必需营养素的完全来源的营养丰富的肉结构化蛋白质产品。还提供了用于生产这种营养丰富的肉结构化蛋白质产品的方法和工艺。还提供了可与肉结构化蛋白质产品或营养丰富的肉结构化蛋白质产品一起包装的营养丰富调味品。
营养丰富结构蛋白质产品

[发明专利]一种蛋白质定点PEG修饰的方法及所得PEG修饰的蛋白质-CN201410367156.3在审
发明人：王大成;焦虎平;李文亮;李云辉;杨秀云;邓旭明;房恒通;李占军;吕岩;张英 -专利权人：吉林大学
申请日： 2014-07-29 - 公布日： 2014-11-05 - 主分类号： C07K1/107 文献下载
摘要：本发明属于生物工程技术领域，公开了一种蛋白质定点PEG修饰的方法及所得PEG修饰的蛋白质。本发明提供的一种蛋白质定点PEG修饰的方法包括：获得蛋白质，在该蛋白质的C末端融合分选酶识别的分选基序，得重组蛋白质；取PEG修饰剂、该重组蛋白质，与分选酶混合，经肽键的切割、连接反应，获得PEG修饰的蛋白质，其中的PEG修饰剂具有式(I)所示结构。本发明利用分选酶，实现了在蛋白质的C末端定点修饰PEG，整个操作简单，成本低，避免了蛋白质PEG修饰时容易产生多位点修饰的发生，更有利于PEG修饰在蛋白质修饰中的应用；其中，m为聚合度，1≤m≤5；n为聚合度
一种蛋白质定点 peg 修饰方法所得

[发明专利]磷酸化蛋白质、基于磷酸化蛋白质的胞内递送体系及制备方法与应用-CN202010596468.7有效
发明人：殷黎晨;刘勇;吴宇辰 -专利权人：苏州大学
申请日： 2020-06-27 - 公布日： 2022-07-19 - 主分类号： A61K49/14 文献下载
摘要：本发明公开了磷酸化蛋白质、基于磷酸化蛋白质的胞内递送体系及制备方法与应用；提供了一种蛋白质磷酸化修饰方法，所述磷酸化蛋白质具有蛋白质结构、通过氨基接于所述蛋白质表面的苯硼酸基团和通过硼酸与邻二醇反应接于所述蛋白质表面的三磷酸腺苷；将阳离子多肽溶液和磷酸化蛋白质在碱液中混合，震荡后静置，得到基于磷酸化蛋白质的胞内递送体系。在肿瘤细胞内低pH值和高浓度的活性氧环境下，苯硼酸和三磷酸腺苷从蛋白质表面脱落，蛋白质与阳离子聚多肽的作用力减弱，从复合物中释放出来，同时恢复活性，杀死肿瘤细胞。
磷酸化蛋白质基于递送体系制备方法应用

[发明专利]一种动态蛋白质复合物识别方法-CN202010324055.3有效
发明人：梁冰;吕嘉庆;张益嘉 -专利权人：大连理工大学
申请日： 2020-04-22 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： G16B40/30 文献下载
摘要：本发明提供一种动态蛋白质复合物识别方法。本发明方法，结合基因表达数据和静态PPI网络构建动态蛋白质相互作用网络；基于马尔可夫聚类对每一时刻的动态蛋白质相互作用网络进行聚类；通过核心附着结构对聚类结果进行优化，合并具有核心蛋白质的聚类和包含附着蛋白质的聚类；滤除高度重叠的蛋白质复合物，输出最终蛋白质复合物集合。本发明方法不但可以抑制小类的产生，而且能够识别重叠的蛋白质。本发明提出了从动态蛋白质相互作用网络中识别蛋白质复合物的计算方法，更符合实际生物过程的PPI网络，提供更准确的蛋白质复合物识别结果。
一种动态蛋白质复合物识别方法

[发明专利]蛋白质相互作用的预测方法-CN202010809822.X有效
发明人：陆慧娟;武红立 -专利权人：中国计量大学
申请日： 2020-08-13 - 公布日： 2023-01-31 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白质相互作用的预测方法，包括如下步骤：获取蛋白质相互作用的数据集，针对蛋白质数据的特点，对蛋白质氨基酸序列、结构、功能及相互作用进行多特征融合与特征抽取；利用Bagging算法通过Bagof Little Bootstraps技术和分治策略来生成多个基分类器的蛋白质相互作用预测模型；利用群智能优化算法或群智能混合算法来优化分类模型的参数，以优化训练集，将所形成的训练集输入蛋白质相互作用预测模型进行训练，以完成蛋白质相互作用预测模型的训练；将待预测未知蛋白质输入已完成训练的蛋白质相互作用预测模型，所述蛋白质相互作用预测模型输出蛋白质相互作用的数据。
蛋白质相互作用预测方法

[发明专利]蛋白质-配体复合物三维结构的确定方法、装置及终端-CN202310274035.3在审
发明人：亚乌斯·乌格鲁;大卫·麦当劳;石玮琳;石远平;雷皇书;张芳育 -专利权人：重庆康洲智通医药科技有限公司;重庆康洲大数据（集团）有限公司
申请日： 2023-03-20 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白质‑配体复合物三维结构的确定方法、装置及终端，所述方法包括：同时处理蛋白质数据和配体数据，生成蛋白质口袋数据和配体姿态数据；匹配蛋白质口袋数据和配体姿态数据，得到第一三维结构；体素化第一三维结构，得到若干栅格，栅格中包括对应位置的蛋白质‑配体结合信息；将栅格输入训练后的神经网络，为栅格排序；以及根据排序第一的栅格得到最优结合位点和最优配体姿态，结合得到蛋白质‑配体复合物三维结构。通过同时提取并处理蛋白质数据和配体数据，然后以体素化的形式形成包含蛋白质‑配体结合信息的栅格，再通过神经网络为栅格排序，本发明可以更快速准确的确定蛋白质‑配体复合物的三维结构。
蛋白质复合物三维结构确定方法装置终端

[发明专利]一种新的基于元胞自动机的蛋白质进化仿真模型-CN201811571554.1有效
发明人：肖绚;薛广福 -专利权人：景德镇陶瓷大学
申请日： 2018-12-21 - 公布日： 2020-07-28 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本发明提供一种新的基于元胞自动机的蛋白质进化仿真模型，包括以下步骤：使用关键词￠在NCBI数据库中找到属于蛋白质家族￠的所有蛋白质，通过这些蛋白质的ID号到Uniport数据库中找到蛋白质家族￠的结构域信息，构成进化仿真模型的训练数据集；通过训练数据集中的数据得到蛋白质家族￠的公共结构域，通过由前向后进化先验概率表Ф和由后向前进化先验概率表Э，得出蛋白质家族￠的其它结构域在公共结构域前面和后面出现的概率；仿真出一条新的蛋白质序列，蛋白质序列以结构域连接的形式给出。
一种基于自动机蛋白质进化仿真模型

[发明专利]蛋白质训练模型的训练方法及装置、电子设备和存储介质-CN202210583278.0在审
发明人：唐杰;肖易佳 -专利权人：清华大学
申请日： 2022-05-26 - 公布日： 2022-08-12 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本公开公开了蛋白质训练模型的训练方法及装置、电子设备和存储介质，涉及数据处理技术领域，主要技术方案包括：将蛋白质数据输入预训练模型，其中，所述蛋白质数据为未标记的蛋白质数据，基于所述预训练模型按照预设拼接方式进行拼接，得到预训练用蛋白质序列，基于所述预训练模型对所述预训练用蛋白质序列进行训练，以获取所述预训练模型输出至少一种蛋白质预测任务。与相关技术相比，基于预训练模型按照预设拼接方式进行拼接，得到预训练用蛋白质序列，并基于预训练用蛋白质序列进行训练，实现对蛋白质的结构和/或性质的高效预测。
蛋白质训练模型方法装置电子设备存储介质

[发明专利]一种质谱技术检测蛋白质构象变化的方法-CN201610164894.7有效
发明人：邹汉法;周烨;王方军 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2016-03-22 - 公布日： 2020-04-21 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明属于利用蛋白质组学分析技术研究蛋白质微观构象的研究领域，涉及一种质谱技术检测蛋白质构象变化的方法，具体为一种结合活性共价化学标记和质谱技术来检测蛋白质构象变化的方法，在整体蛋白质层次上对赖氨酸残基进行活性化学标记，随后进行蛋白质变性、酶解并用质谱进行检测，通过质谱的鉴定结果计算赖氨酸残基的标记效率。该方法快速简单、稳定高效，能够用于考察蛋白质结构的细微构象变化，在标记过程中蛋白质活性保持不变，不受蛋白质大小、溶解度、纯度等限制，能够更加真实的反应蛋白质在生理活性状态下的构象。
种质技术检测蛋白质构象变化方法

[发明专利]聚合物促进蛋白质类药物结晶的方法及应用-CN202111251647.8在审
发明人：苏敏;吕凤;张清洋 -专利权人：河北工业大学
申请日： 2021-10-25 - 公布日： 2022-01-28 - 主分类号： C07K1/30 文献下载
摘要：本发明为一种聚合物促进蛋白质类药物结晶的方法。该方法包括如下步骤：将聚合物加入到蛋白质溶液中，然后调节蛋白质溶液的过饱和度为10～15，搅拌0.5～6小时，得到蛋白质晶体；得到的蛋白质晶体用于蛋白质结构分析或生物制药中作为靶向药物制剂的组成。本发明工艺流程简单，操作时间短，可提高蛋白质类药物的结晶效率，还可以缩短蛋白质分离纯化的过程，具有良好的应用前景。
聚合物促进蛋白质类药物结晶方法应用

[发明专利]一种具有pH响应性的类核酸化蛋白质前药及其制备方法-CN202310072781.4在审
发明人：殷黎晨;李伟;刘寻 -专利权人：苏州大学
申请日： 2023-02-07 - 公布日： 2023-07-04 - 主分类号： A61K38/38 文献下载
摘要：本发明公开了一种具有pH响应性的类核酸化蛋白质前药及其制备方法，本发明的优势在于类核酸化蛋白质前药的负电荷密度和蛋白质表面结合位点增加，从而增强了与纳米载体的结合力与结合效率，与此同时类核酸化蛋白质前药的制备方法快速、简单、高效和绿色，并且不会影响蛋白质的生物活性。在细胞内酸性环境下，结构ABA能够从蛋白质前药上掉落，恢复蛋白质活性，保证蛋白质能够在细胞中发挥作用。
一种具有 ph 响应核酸蛋白质及其制备方法

[发明专利]非润湿全固体蛋白质光电转换器件及其制造方法和电子装置-CN201080037221.6无效
发明人：罗玮;山田齐尔;后藤义夫;户木田裕一 -专利权人：索尼公司
申请日： 2010-08-09 - 公布日： 2012-05-30 - 主分类号： H01L51/42 文献下载
摘要：本发明公开了能够在器件的内部和外部没有诸如水的液体存在下操作的全固体蛋白质光电转换器件及其制造方法和电子装置。非润湿全固体蛋白质光电转换器件具有由电子传递蛋白质构成的固体蛋白质层(13)夹在电极(11)和电极(12)之间的结构。固体蛋白质层(13)固定在电极(11)和(12)上。固体蛋白质层(13)不包含诸如水的液体。固体蛋白质层(13)是由电子传递蛋白质的单分子膜或多分子膜构成。
润湿固体蛋白质光电转换器件及其制造方法电子装置

[发明专利]一种小波变换支持向量机的数据处理方法-CN202010718285.8在审
发明人：杨雯懿;黄建华 -专利权人：中南大学
申请日： 2020-07-23 - 公布日： 2020-11-06 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种小波变换支持向量机的数据处理方法，该方法包括：建立蛋白质序列数据集的训练样本集；利用氨基酸的物理化学性质将蛋白质氨基酸序列转化为数值序列；利用小波变换进行特征提取；支持向量机训练生成的蛋白质特征数据集；需要预报的蛋白质序列的读入、数据转换及蛋白质结构与功能的在线预测。该方法能实现对未知蛋白质的家族及功能的预测，验证结果表明对G蛋白偶联受体、酶蛋白、蛋白质亚细胞结构、蛋白质二级结构均有好的预测准确率。在线预测时，用户只需在预报网页界面提供要预报的蛋白质序列，对其数据进行转换后利用小波变换对其进行特征提取，完成支持向量机的训练和目标的预报，输出预报结果。
一种变换支持向量数据处理方法