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[发明专利]由蛋白G细胞膜外结构域突变体的串联型多聚体组成的新型改性蛋白-CN201280038040.4无效
发明人：本田真也;松丸裕之;渡边秀树;吉田昼也 -专利权人：独立行政法人产业技术综合研究所;株式会社大赛璐
申请日： 2012-08-03 - 公布日： 2014-04-23 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：本发明的目的是提供不损害在中性区域的高的抗体结合活性的、相比含野生型的蛋白G的细胞膜外结构域的蛋白质，在弱酸性区域的免疫球蛋白的Fc区域和的结合性和/或同Fab区域的结合性更降低的优良的蛋白质，同时使用此蛋白质本发明涉及不损害在中性区域的高的抗体结合活性，相比由具有对具有免疫球蛋白G的Fc区域的蛋白质的结合活性的野生型的细胞膜外结构域组成的多聚体，在弱酸性区域的免疫球蛋白的Fc区域和的结合性和/或同Fab区域的结合性降低的，由具有对具有免疫球蛋白G的Fc区域的蛋白质的结合活性的该细胞膜外结构域的突变体的串联型多聚体组成的蛋白质等。
蛋白细胞膜结构突变体串联型多聚体组成新型改性

[发明专利]一种蛋白质－核酸嵌合体及其制造方法和应用-CN200610124294.4无效
发明人：张宏;周岩 -专利权人：张宏;周岩
申请日： 2006-12-19 - 公布日： 2007-11-21 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：本发明是一种蛋白质－核酸嵌合体及其制造方法和应用。本发明蛋白质－核酸嵌合体，由蛋白部分(P)和核酸部分(N)及联结俩者之间的蛋白质结合底物(S_E)组成一个P－N－Block。本发明蛋白质－核酸嵌合体的制造方法，包括有如下步骤：1)把兴趣蛋白(Pi)与结合蛋白质(P_E)及多肽标记(Pt)通过分子生物学的方法嵌合形成蛋白部分；2)通过化学合成的方法把可分解或不可分解的连锁物(N_L)与带或不带标记的Oligonucleotide(寡核苷酸)联接形成核酸部分；3)通过生物化学的方法把蛋白质结合底物(S_E)与核酸部分相联；4)通过生物化学方法把蛋白部分与核酸部分相联本发明的蛋白质－核酸嵌合体用途广泛，其制造方法简单方便。本发明蛋白质－核酸嵌合体制造方法可应用于制造各种密度蛋白质芯片，或运用于制造可定向位置，基于DNA芯片或纳米芯片的蛋白质，抗体芯片，还可用于制造有特异性细胞导向的antisense或siRNA药物。
一种蛋白质核酸嵌合体及其制造方法应用

[发明专利]基于解旋酶检测DNA与蛋白质相互作用的方法-CN201810437177.6在审
发明人：滕翠娟;徐春华;李明 -专利权人：中国科学院物理研究所
申请日： 2018-05-09 - 公布日： 2019-11-19 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明提供一种用于检测DNA与蛋白质相互作用的方法，所述方法基于解旋酶，通过DNA分子长度的变化，确定蛋白质在发卡DNA上的结合位点。与现有技术相比，本发明的方法为单分子操作，直观反映蛋白质分子和DNA分子的相互作用；本方法的精确率很高，达到一个碱基对；本发明的方法还可以检测DNA与蛋白质的各个结合位点的结合强度的强弱；所述方法所需要的DNA和蛋白质的用量很少。
蛋白质结合位点蛋白质相互作用蛋白质分子发卡DNA 单分子解旋酶检测碱基直观强弱

[发明专利]结合IL-23的基于纤连蛋白的支架结构域蛋白质-CN201180068085.1有效
发明人： A.布什;R.达斯古普塔;L.恩格尔;V.拉马墨菲;K.A.鲁索;S.谢里夫;A.魏 -专利权人：百时美施贵宝公司
申请日： 2011-12-20 - 公布日： 2013-10-30 - 主分类号： C07K14/78 文献下载
摘要：本发明涉及结合白介素23(IL-23)的基于纤连蛋白的支架结构域蛋白质。本发明亦涉及创新蛋白质在治疗应用中用于治疗自身免疫疾病的用途。本发明还涉及包含所述蛋白质的细胞、编码所述蛋白质或其片段的多核苷酸，且涉及包含编码所述创新蛋白质的多核苷酸的载体。
结合 il 23 基于蛋白支架结构蛋白质

[发明专利]蛋白质和疾病关联关系的确定方法、装置、设备及介质-CN202310781566.1在审
发明人：刘小双 -专利权人：平安科技（深圳）有限公司
申请日： 2023-06-28 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本申请涉及医疗健康技术领域，揭示了一种蛋白质和疾病关联关系的确定方法、装置、设备及介质，其中方法包括：获取已知蛋白质与疾病关联关系矩阵、疾病相似性矩阵和蛋白质相互作用关系矩阵；根据所述已知蛋白质与疾病关联关系矩阵、所述疾病相似性矩阵和所述蛋白质相互作用关系矩阵进行蛋白质与疾病之间的关联关系的预测，得到目标蛋白质与疾病关联关系矩阵。从而实现在较少的数据下稳定有效地预测了潜在的与疾病有关的蛋白质；整个预测过程结合了蛋白质与蛋白质之间的相互作用关系、疾病与疾病之间的相似性、已知的蛋白质与疾病之间的关联关系，从而提高了预测得到的目标蛋白质与疾病关联关系矩阵的准确性
蛋白质疾病关联关系确定方法装置设备介质

[发明专利]基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法-CN202310925090.4在审
发明人：陈华钧;秦铭;张强;丁科炎;吴槟;王泽元 -专利权人：浙江大学
申请日： 2023-07-26 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法，包括：基于蛋白质预训练大模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测，得到候选突变氨基酸的概率分布；根据概率分布采用最优传输距离采样候选突变氨基酸以得到目标突变蛋白质；利用高通量实验设备合成目标突变蛋白质并进行生化测试，得到湿实验标注结果；将带有湿实验标注结果的目标突变蛋白质对模型进行有监督训练，利用训练后的模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测并降序排序；依据降序排序筛选多个突变蛋白质，并结合天然蛋白质对大模型做无监督微调；利用微调后的蛋白质预训练大模型，重复上述过程直至达到蛋白质改造预期目标。该方法蛋白质改造效率和准确度高。
基于优化训练模型采样定向蛋白质改造方法

[发明专利]对生物学样品中的物质进行检测的方法-CN201080019581.3无效
发明人：高仓由光;冈直美;近藤一博 -专利权人：日本烟草产业株式会社
申请日： 2010-03-02 - 公布日： 2012-05-02 - 主分类号： G01N33/543 文献下载
摘要：本发明的方法，在其一个实施方式中，包括：1)准备融合蛋白以及结合有生物素的担载体，所述融合蛋白是与待检测物质特异性结合的蛋白质和生物素结合性蛋白质的融合蛋白；2)通过使工序1)准备的担载体与融合蛋白结合，从而制作结合有融合蛋白的担载体；3)向工序2)制作的结合有融合蛋白的担载体混合添加：将(a)生物学样品、以及(b-i)细胞破碎提取液和生物素结合性蛋白质，该细胞破碎提取液是由与用于表达工序1)的融合蛋白的宿主细胞相同种的细胞制备的细胞破碎提取液，或者(b-ii)由下述细胞制备的细胞破碎提取液，所述细胞是在与用于表达工序1)的融合蛋白的宿主细胞相同种的细胞中通过基因工程技术表达了生物素结合性蛋白质的细胞；混合后添加至工序2)制作的结合有融合蛋白的担载体中；然后，4)对与蛋白质结合的被检测物质进行检测，所述蛋白质是与融合蛋白中的待检测物质特异性结合的蛋白质。
生物学样品中的物质进行检测方法

[发明专利]双功能分子-CN202180072768.8在审
发明人：钱雪明;李红俊;滕菲;郭欢欢;顾怡 -专利权人：苏州创胜医药集团有限公司
申请日： 2021-11-18 - 公布日： 2023-07-04 - 主分类号： C07K16/28 文献下载
摘要：本公开提供了包括PD‑L1结合部分的蛋白质，所述PD‑L1结合部分与TGFβ结合部分、IL‑1结合部分、免疫刺激性多肽(例如，可溶性LAG3或可溶性CD4)或CD47结合部分连接；编码所述蛋白质的分离的多核苷酸；包含所述蛋白质的药物组合物和所述蛋白质、所述多核苷酸、所述药物组合物的用途。
功能分子

[发明专利]一种蛋白质结合口袋的预测装置和方法-CN202211259369.5在审
发明人：廖俊;周瑞峰;范竞;陈红阳 -专利权人：之江实验室
申请日： 2022-10-14 - 公布日： 2023-01-17 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种蛋白质结合口袋的预测装置和方法，本发明通过对蛋白质以及结合口袋数据进行特征提取以及体素网格的转化，将深度学习运用到预测蛋白质结合口袋的研究中。本发明同时基于位置信息特征和原子信息特征进行预测，大大提高了预测蛋白质结合口袋的准确度和精度，为药物设计提供可靠的分子靶标结合信息。
一种蛋白质结合口袋预测装置方法

[发明专利]一种检测纤维中蛋白质含量的方法-CN201410442801.3在审
发明人：吴焕岭;顾东雅 -专利权人：盐城工业职业技术学院
申请日： 2014-08-27 - 公布日： 2014-12-03 - 主分类号： G01N21/31 文献下载
摘要：本发明涉及一种检测纤维中蛋白质含量的方法。将考马斯亮蓝法应用到纤维中蛋白质含量的定量检测中。考马斯亮蓝G-250在游离状态下呈红色，在稀酸溶液中与蛋白质的碱性氨基酸和芳香族氨基酸残基结合后变成蓝色，其最大吸收波长从465nm变成595nm，蛋白质在1～1000μg范围内，蛋白质-色素结合物在595nm波长下的吸光度与蛋白质含量成正比，符合朗伯比尔定律，可用于纤维中蛋白质含量的定量测定。检测过程包括制备蛋白质标准溶液、制备考马斯亮蓝溶液、绘制标准曲线、得到线性回归方程和线性相关系数r、制备供试品溶液、对样品中蛋白质含量进行测定、结果计算与分析。
一种检测纤维蛋白质含量方法

[发明专利]基于局部模板相似性的蛋白质-小分子复合物对接方法-CN202310888481.3在审
发明人：张文艺;谢腾宇;谭巧珠;钱润彤 -专利权人：西湖实验室（生命科学和生物医学浙江省实验室）
申请日： 2023-07-19 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： G16C10/00 文献下载
摘要：本发明提供一种基于局部模板相似性的蛋白质‑小分子复合物对接方法，将目标蛋白质目标小分子输入SE(3)等变网络预测得到目标蛋白质的和目标小分子的结合三维坐标，对目标蛋白质和目标小分子进行柔性采样得到采样构象，在联合能量函数的指导下优化初始构象得到蛋白质‑小分子的结合构象，并自蛋白质‑小分子构象采样空间中提取复合物局部三维构象得到构象集；对构象集中的复合物局部三维构象进行聚类得到多个聚类中心，取聚类中心对应的复合物三维构象作为蛋白质‑小分子复合物对接结果，多角度挖掘蛋白质‑小分子复合物的结构信息，并以联合能量函数的形式运用已知复合物局部结构信息实现蛋白质和小分子的对接。
基于局部模板相似性蛋白质分子复合物对接方法

[发明专利]蛋白质强度强化用组合物-CN201780082452.0有效
发明人：孙成吉;崔源景;金东玩;柳智熙;李桢来;李相旻 -专利权人：株式会社LG生活健康
申请日： 2017-12-12 - 公布日： 2023-02-21 - 主分类号： A61K8/58 文献下载
摘要：本发明的蛋白质强度强化用组合物含有能够与毛发、头皮、皮肤、手脚指/趾甲、皮革或纤维的蛋白质共价键结合的氨基硅烷化合物，使得上述蛋白质和氨基硅烷化合物形成共价键，因此可以提高蛋白质的强度强化效果并且可以使半永久的蛋白质强度强化效果最大化
蛋白质强度化用组合

[发明专利]基于元学习和子图匹配的靶蛋白药物结合预测方法-CN202310474761.X在审
发明人：王宇轩;夏莹;沈红斌;潘小勇 -专利权人：上海交通大学
申请日： 2023-04-27 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：一种基于元学习和子图匹配的靶蛋白药物结合预测方法，通过构建蛋白质结构、药物小分子结构及其结合能数值按蛋白质分组建立元学习训练任务，即作为元模型的主体模型；对元模型进行微调后得到针对该蛋白质预测任务的子模型与其损失函数；然后建立任务自适应的自注意力模型平衡各蛋白质预测任务的子模型对元模型的优化贡献，对各蛋白质预测任务的子模型损失函数使用加权平均得到元模型损失函数；再使用元模型损失函数计算梯度，得到元模型梯度后，基于预设学习率对元模型参数进行更新优化，训练完成后使用训练后的元模型对测试集新蛋白质样本进行微调，得到新蛋白质预测子模型，使用该子模型对该蛋白质测试集进行预测，得到评价结果。本发明通过元学习与子图匹配相结合的训练方法，可以有效避免捷径学习，增强泛化效果，也解决以往预测模型对新发现蛋白质难以预测的问题。
基于学习匹配蛋白药物结合预测方法

[发明专利]鉴定小分子靶标的高通量筛选方法-CN202180034451.5在审
发明人： D.扬格;R.洛佩兹;A.森;R.埃默森 -专利权人： A-阿尔法生物股份有限公司
申请日： 2021-04-13 - 公布日： 2022-12-30 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本文提供了用于鉴定蛋白质结合配偶体对的方法，该蛋白质结合配偶体对的突变可以为药学上有用的小分子的发现提供信息。本文公开的方法可以容许调整天然蛋白质降解系统以在蛋白质水平上调控特定疾病的靶标，具体地，针对那些长期被认为无药可及的靶标。
鉴定分子靶标通量筛选方法

[发明专利]一种海参蛋白质组的分析方法-CN201910731910.X在审
发明人：陈溪;林天野;吴慈;褚莹倩;贺舒文;黄大亮 -专利权人：陈溪
申请日： 2019-08-09 - 公布日： 2019-10-08 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明涉及食品中蛋白质组的分析方法研究领域，具体地说是一种海参蛋白质组的分析方法。本发明所公开的海参蛋白质组的分析方法，通过研究高效的组织裂解液作为蛋白质提取和溶解体系，发展提取能力强、样品损失低的全蛋白质样品预处理新技术对海参样品中蛋白质进行提取，并进一步酶解；进而，通过液相色谱分级和高分辨质谱鉴定技术相结合，对海参样品中蛋白质进行定量；提高低丰度蛋白质定量分析的灵敏度，从而提高蛋白质组定量的覆盖度。本发明方法为高效且针对海参样品的蛋白质组提取、酶解、分级、鉴定分析方法，提高低丰度蛋白质定量分析的灵敏度及覆盖度，从蛋白质组学方面对海参样品中蛋白质进行差异分析。
海参海参蛋白质蛋白质组蛋白质低丰度蛋白质定量分析灵敏度覆盖度分级酶解分析方法研究蛋白质提取蛋白质组学高分辨质谱样品预处理组织裂解液差异分析鉴定分析鉴定技术全蛋白质样品损失液相色谱分析能力强溶解研究

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