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[发明专利]基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组及其应用-CN202010624134.6有效
发明人：王鹏良;杨利平;陶玉华;吴双成;李艺;邓洁梅 -专利权人：北部湾大学
申请日： 2020-06-30 - 公布日： 2022-06-10 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组及其应用，本发明的引物是针对白骨壤转录组hAT转座子设计的，hAT转座子碱基对虽然较短，但在数量丰富，能够覆盖整个基因组，能对白骨壤品种进行区分，本申请印证了利用白骨壤开发hAT转座子标记的可行性，并对不同地域品种的白骨壤进行遗传多样性分析，不仅能为白骨壤提供新颖优质的分子标记，也为白骨壤的分子改良奠定良好基础可为今后开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新引物。
基于白骨转录 hat 座子分子标记引物及其应用

[发明专利]一种在全基因组水平鉴定植物基因组DNA鸟嘌呤四联体位点的方法-CN202011568938.5在审
发明人：张文利;冯逸龙;陶申童;张鹏越;高静静;罗振宇 -专利权人：南京农业大学
申请日： 2020-12-25 - 公布日： 2021-06-11 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开一种在全基因组水平鉴定植物基因组DNA鸟嘌呤四联体位点的方法，该方法包括如下步骤：(1)交联固定植物材料；(2)提取并纯化细胞核；(3)对细胞核内染色质进行片段化处理回收DNA片段；(4)将回收的(7)从Beads上洗脱IPed DNA，回收DNA片段；(8)用qPCR方法检测DNA G4富集程度；(9)将经过富集程度检测的IP DNA进行建库和Illumina测序，经过生物信息学分析实现在全基因组水平鉴定整个方法流程简单，耗时较短，DNA片段化可视化效果强，理论上适合应用于多数植物物种。
一种基因组水平鉴定植物 dna 嘌呤联体方法

[发明专利]一种病原微生物分析鉴定系统及其应用-CN202211377592.X在审
发明人：刘志达;杨振宇;刘久成;朱继发;王琮智 -专利权人：深圳吉因加医学检验实验室;苏州吉因加生物医学工程有限公司;北京吉因加医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-11-04 - 公布日： 2023-03-28 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：报告管理模块和系统管理模块；信息分析模块包括样本分析子模块，其用于实现数据质控步骤、去宿主步骤、序列分类步骤、计算分类可信度指标步骤和过滤非致病菌步骤；可信度采用种水平、属水平reads数，种水平唯一Kmer数、对应物种基因组大小、reads覆盖大小、含有reads的窗口数、微生物基因组参考基因组按reads数进行筛选。
一种病原微生物分析鉴定系统及其应用

[发明专利]一种检测肉类制品成分的实时定量PCR方法-CN201810658991.0有效
发明人：刘文斌;张晓东;杜润蕾;李睿;闫达中;聂蓉;刘亚军;李琦;胡翔 -专利权人：武汉轻工大学
申请日： 2018-06-22 - 公布日： 2021-06-08 - 主分类号： C12Q1/6851 文献下载
摘要：本发明公开一种检测肉类制品成分的实时定量PCR方法，包括以下步骤：提取肉类制品试样和标准样品的基因组DNA；根据线粒体NADH氧化还原酶1的多态性差异设计肉类制品试样和标准样品的基因组DNA所需的PCR并对应配制PCR反应体系进行PCR扩增，读取扩增过程中的Ct值；根据PCR扩增产物中的NADH氧化还原酶1的Ct值与18S rRNA的Ct值的比较，判断PCR扩增的可靠性；根据肉类制品试样与标准样品的基因组本发明可同时检测肉类制品中具有不同物种来源的成分中的一种或多种，检测结果准确、可靠。
一种检测肉类制品成分实时定量 pcr 方法

[发明专利]基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性的方法-CN201410154134.9有效
发明人：夏志强;邹枚伶;王文泉 -专利权人：中国热带农业科学院热带生物技术研究所
申请日： 2014-04-17 - 公布日： 2014-06-25 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性的方法，是选取目标物种提取DNA后选择酶切位点进行酶切；设计连接接头、标签，合成带有选择标签的EcoR I酶切位点接头；分别用EcoR I与Msp I、EcoR I与HpaⅡ对样本进行酶切，再将带有选择标签的EcoR I酶切位点接头用T4连接酶与分别对应酶切好的基因组进行连接，同时分别连接上酶切位点接头；进行PCR扩增，选择高通量的Hiseq2000本发明利用现代高通量测序技术，通过对基因组进行降维，提高组装准确性，降低成本，提高分子育种效率，为现在分子育种提供一个高效、便利的SNP发现与甲基化多态性为一体的方法。
基因组随机扩增序列 snp 多态性甲基化方法

[发明专利]一种药用植物转录调控图谱预测方法-CN202211140336.9有效
发明人：任艳姣;兰杰;梁艳春;于合龙;李高阳;柴世民;郭宏亮;高一萌;马丽;韩烨 -专利权人：吉林农业大学
申请日： 2022-09-20 - 公布日： 2022-12-06 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：为了解决当前药用植物遗传背景不清晰的问题，本发明搜集人参等药用植物基因组从头测序数据和转录调控网络，采用序列比对法从类比角度将近源物种的denovo全基因组水平转录调控网络迁移到未完全注释的药用植物基因组中
一种药用植物转录调控图谱预测方法

[发明专利]一种获得丝瓜抗黄瓜花叶病毒病候选基因的方法-CN201910286986.6在审
发明人：娄丽娜;苏小俊;刘晓宏;刘哲 -专利权人：江苏省农业科学院
申请日： 2019-04-11 - 公布日： 2019-06-21 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了一种获得丝瓜抗黄瓜花叶病毒病候选基因的方法，属于农业技术领域，包括：从无参考基因组序列物种筛选候选基因；采用SLAF‑seq方法构建丝瓜高密度遗传图谱以及定位丝瓜抗黄瓜花叶病毒基因；以定位标记为锚，从转录组文库中，筛选到候选基因序列，并进行候选基因的功能分析。本发明采用SLAF‑seq方法构建丝瓜高密度遗传图谱以及定位丝瓜抗黄瓜花叶病毒基因，以定位标记为锚，从转录组文库中，筛选到候选基因序列，并进行候选基因的功能分析。
丝瓜候选基因黄瓜花叶病毒病候选基因序列黄瓜花叶病毒定位标记功能分析遗传图谱转录组构建文库参考基因组序列农业技术领域筛选物种筛选基因

[发明专利]一种多倍体生物基因组二倍化程度量化评估的方法-CN202010398936.X有效
发明人：刘海平;牟振波;肖世俊 -专利权人：西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
申请日： 2020-05-12 - 公布日： 2023-06-16 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：发明涉及一种多倍体生物基因组二倍化程度量化评估的方法，包括以下步骤：1)根据基因组的Kmer分析结果，评估基因组的杂合度；2)根据基因组的杂合度特征，构建多倍体基因组特征模型；3)在该多倍体基因组特征模型基础上，模拟不同二倍化程度的多倍体基因组；4)评估多倍体二倍化率估计的准确性，并计算获得该多倍体基因组的二倍化程度。本方法首次利用重测序数据进行多倍体基因组二倍化分析，成本低，适用于动植物的多倍体基因组研究。
一种多倍体生物基因组二倍程度量化评估方法

[发明专利]全长核糖体RNA数据库的构建方法、应用、装置及电子设备-CN202210617403.5在审
发明人：陈琦;钱刚;胡志刚;余雯雯;郭惠民;王巍;陈龙;陈文拴 -专利权人：浙江迪谱诊断技术有限公司
申请日： 2022-06-01 - 公布日： 2022-10-04 - 主分类号： G16B50/30 文献下载
摘要：本发明公开一种全长核糖体RNA数据库的构建方法、应用、装置及电子设备，该方法包括：获取核糖体RNA基因的坐标信息、物种分类信息以及物种名称；对核糖体RNA所在基因组根据物种信息进行筛选；将筛选后的核糖体RNA基因按所述核糖体RNA起始位置的大小进行排列，若相邻两个核糖体RNA基因分别为同一核糖体的小亚基和大亚基，且相邻两个核糖体RNA基因之间的距离小于阈值，则合并相邻两个核糖体RNA基因坐标，得到全长核糖体RNA的坐标信息；根据全长核糖体RNA的坐标信息获取序列信息(fasta格式文件)；将所有核糖体RNA基因的fasta序列格式文件合并，得到全长核糖体RNA数据库。进一步根据全长核糖体RNA数据库对物种进行分类，能够提高物种分类的分辨率。
全长核糖体 rna 数据库构建方法应用装置电子设备

[发明专利]一种优化的kraken2算法及其在二代测序中的应用-CN202110804351.8有效
发明人：张岩;李振中;任用;李诗濛;郭昊;梁相志;陈莉;戴岩;李珊;顾菊 -专利权人：江苏先声医学诊断有限公司;江苏先声医疗器械有限公司;南京先声诊断技术有限公司
申请日： 2021-07-14 - 公布日： 2022-03-25 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于kraken2单条序列kmer评分和整体基于taxonomy结构统计的生信分析方法，所述方法能够降低生信分析假阳性，提高物种检测准确度，适用于二代宏基因组测序分析。
一种优化 kraken2 算法及其二代中的应用

[发明专利]用高密度标记信息进行植物育种的组合物和方法-CN200780037652.0无效
发明人： J·布尔;D·布特勒伊尔;S·伊兴顿;M·爱德华兹;A·古普塔;G·R·约翰逊;R·S·赖特 -专利权人：孟山都技术有限公司
申请日： 2007-08-15 - 公布日： 2009-09-09 - 主分类号： A01H1/04 文献下载
摘要：本发明涉及用于增强植物种质的育种方法。该方法描述了玉米(zeamays)和大豆(Glycine max)的育种群体的种质中优选单元型基因组区的鉴定和积累。本发明也涉及包含优选单元型的玉米和大豆植物。
高密度标记信息进行植物育种组合方法

[发明专利]译员基因的选取方法、装置与电子设备-CN201811096578.6有效
发明人：张芃 -专利权人：语联网（武汉）信息技术有限公司
申请日： 2018-09-19 - 公布日： 2021-11-05 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明实施例提供一种译员基因的选取方法、装置与电子设备，该方法包括：分别选取多个译员基因组；对于每个译员基因组，获取多个匹配成功率样本，并据此计算该译员基因组对应的匹配成功率的均值和标准差；选取所有均值中的最大者对应的稿件基因组作为最大稿件基因组，并将其均值和标准差分别定义为最大均值和最大标准差；对于除最大稿件基因组之外的每个稿件基因组，基于其对应的均值和标准差，以及最大均值和最大标准差，计算其对应的Z值；基于每一个译员基因组对应的Z值，将满足设定条件的译员基因组中的基因和最大译员基因组中的基因合并，获取最终选取的译员基因。本发明实施例能够使得选取出的译员基因能够更好的体现译员间的差异性。
译员基因选取方法装置电子设备

[发明专利]稿件基因的选取方法、装置与电子设备-CN201811096577.1有效
发明人：张芃 -专利权人：语联网（武汉）信息技术有限公司
申请日： 2018-09-19 - 公布日： 2021-10-26 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明实施例提供一种稿件基因的选取方法、装置与电子设备，该方法包括：分别选取多个稿件基因组；对于每个稿件基因组，获取多个匹配成功率样本，并据此计算该稿件基因组对应的匹配成功率的均值和标准差；选取所有均值中的最大者对应的稿件基因组作为最大稿件基因组，并将其均值和标准差分别定义为最大均值和最大标准差；对于除最大稿件基因组之外的每个稿件基因组，基于其对应的均值和标准差，以及最大均值和最大标准差，计算其对应的Z值；基于每个稿件基因组对应的Z值，将满足设定条件的稿件基因组中的基因和最大稿件基因组中的基因合并，获取最终选取的稿件基因。本发明实施例能够使得选取出的稿件基因能够更好的体现稿件间的差异性。
稿件基因选取方法装置电子设备

[发明专利]农杆菌介导植物萌发种子基因转化方法-CN01104185.4无效
发明人：孙毅;王景雪;刘少翔;王卉;李毅 -专利权人：山西省农业生物技术研究中心
申请日： 2001-02-26 - 公布日： 2004-05-19 - 主分类号： A01H1/06 文献下载
摘要：本发明是一种利用农杆菌介导植物萌发种子进行基因转化的方法，具体是以植物萌发种子为受体材料，以携带外源基因片段的农杆菌Ti质粒为基因供体，在植物种子萌发过程中与农杆菌共培养，使其将供体的外源基因片段转移到受体基因组中的方法转化结果经PCR扩增和PCR-Southern杂交检测得以证实，证明外源基因片段确已导入到受体材料中，并且能够遗传。
杆菌植物萌发种子基因转化方法

[发明专利]一种非编码基因的高通量鉴定方法-CN201210170788.1有效
发明人：温俊志;廖建友;杨建华;郑凌伶;周惠;屈良鹄 -专利权人：中山大学
申请日： 2012-05-29 - 公布日： 2012-10-24 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种非编码基因的高通量鉴定方法，包括以下步骤：（1）提取样品总DNA，进行DNA测序，并将测序结果拼接成contig序列；（2）提取样品总RNA，从中分离长度为18~30nt的小RNA，对小该发明主要针对于没有基因组图谱物种的microRNA及其基因的系统鉴定，发现新的非编码RNA基因；对已有完成基因组测序的生物同样适用；且不局限于microRNA，同样适用于具有前体结构的小RNA的检测。
一种编码基因通量鉴定方法