[发明专利]一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法

摘要

本发明公开了一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法，样品制备收集二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加患者的外周血；使用低渗盐析法提取基因组DNA样本；MODLI‑TOF飞行质谱检测法进行5‑羟色胺2C受体(5‑HT2CR)基因、组胺l受体基因、催产素基因、NPY/R基因、Leptin基因和脂联素基因、FGF21和FGF23基因基因分型；数据分析提取并对齐仪器原始数据,获得无噪音干扰、可用于统计分析的数据,通过广义多因子降维法开展数量性状的基因‑基因交互作用，再进一步应用交叉验证，使用基因交互作用预测体重增加。本发明采用广义多因子降维法处理连续型结局变量，并且纳入协变量，具有使其应用范围和预测准确率得到大幅度提高的优点。

主权项

1.一种基于多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加分析方法，其特征在于：以下步骤：S1：样品制备收集二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加患者的外周血；S2：使用低渗盐析法提取基因组DNA样本；S3：MODLI‑TOF飞行质谱检测法进行5‑羟色胺2C受体(5‑HT2CR)基因、组胺1受体(H1R)基因、催产素(Oxytocin，OT)基因、NPY/R基因、Leptin基因和脂联素(Adiponectin)基因、FGF21和FGF23基因等基因分型；S4：数据分析提取并对齐仪器原始数据，获得无噪音干扰、可用于统计分析的数据，通过广义多因子降维法(GMDR)开展数量性状的基因‑基因交互作用，再进一步应用交叉验证，使用基因交互作用预测体重增加；步骤1：采用病例匹配对照研究，收集二代抗精神病药物治疗精神分裂症患者的相关临床资料，服用二代抗精神病药物治疗1年内体重增加＞7％的精神分裂症患者为研究组，其余患者为疾病对照组，测量全部患者治疗前后的体重、腰围、臀围、身高，计算BMI(Body Mass Index)、WHR(Waist/hip‑ratio)等临床表型，因吸烟在一定程度上影响食欲与体重，故完成Russell吸烟原因问卷和尼古丁依赖严重程度量表(FNTD)；步骤2：抽取上述样本外周血3ml，用于提取基因组DNA，通过genbank和hapmap使用MODLI‑TOF飞行质谱检测法对5‑HT2C、H1R与NPY/R及Oxytocin、Leptin和Adiponectin等候选基因的SNP、结构突变和插入缺失等遗传变异进行基因分型，找出统计学上二代抗精神病药物致体重增加的特异性基因遗传多态性；步骤3：使用频率分布和单倍型分析、关联分析和数量性状分析，比较并选择研究组及对照组之间特异性基因遗传多态性差异，筛选出研究组特异的基因遗传多态性，然后使用广义多因子降维法(GMDR)与交叉验证构建基因间交互模型，结合研究组的临床表型数据，再次进行GMDR与交叉验证分析，完成多基因组合交互作用预测二代抗精神病药物治疗精神分裂症致体重增加的分析方法。