[发明专利]一种甲基化DNA的测序方法及其应用在审
申请号: | 201410578592.5 | 申请日: | 2014-10-24 |
公开(公告)号: | CN104372079A | 公开(公告)日: | 2015-02-25 |
发明(设计)人: | 蔡万世;伍鸿鹄;王康利;孙中生 | 申请(专利权)人: | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 裴娜 |
地址: | 北京市朝*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种甲基化DNA的测序方法及其应用。基于目前成熟的高通量测序(Next Generation Sequencing)技术,首次引入羟甲基化修饰的寡核苷酸接头,将DNA甲基化免疫共沉淀测序技术与亚硫酸氢盐处理测序技术相结合,从而将不含有甲基化修饰的DNA片段去除,即只对含有甲基化修饰的DNA片段进行亚硫酸盐处理,最终精确测定这些DNA片段上的甲基化修饰位点;该方法能够使测定全基因组水平的DNA甲基化修饰位点所需的数据量降至常规方法的1/10,从而降低测序成本和信息处理量,更高效地对全基因组DNA甲基化进行高通量测序。 | ||
搜索关键词: | 一种 甲基化 dna 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
一种甲基化DNA的测序方法,其特征在于,包括如下步骤: 1)DNA样品的片段化; 2)将1)中得到的DNA片段与羟甲基化修饰的寡核苷酸接头连接; 3)富集步骤2)中的甲基化DNA片段; 4)将步骤3)中得到的产物中未甲基化的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基; 5)将4)中的单链DNA通过引物进行扩增以获得双链DNA; 6)去除接头回收纯化DNA; 7)对步骤6)中获得的双链DNA进行测序。
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