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[发明专利]子宫内膜息肉甲基化标志物组合、检测试剂盒及应用-CN202110160995.8有效
发明人：刘斌;夏渝东;陆美茵;郑子鹏;李晓红;沈俊芳 -专利权人：深圳市宝安区妇幼保健院;广州迈森致远基因科技有限公司
申请日： 2021-02-05 - 公布日： 2023-08-22 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明首次提出子宫内膜息肉甲基化标志物组合，包括以下基因标志物IGF1R、CTBP1、TCF7L1、E2F3、CACNA2D4、KCNJ12、TPO、UGT1A8、UGT1A10、CABP5、CST9、ITGA2、DLGAP2、ESPNP、NBPF25P、RASA3、ZIM2、PXDN、HDAC4和VAV2，通过检测来自受试者的待测样品中基因标志物的甲基化水平，能够有效诊断子宫内膜息肉，特异性达87.27％，灵敏度达91.11％。
子宫内膜息肉甲基化标志组合检测试剂盒应用

[发明专利]一种头颈部原发不明转移性鳞癌原发灶溯源的探针序列组合物及检测方法-CN202310026408.5在审
发明人：李崴;王旭东;骆惊涛;夏渝东;张泽;赵凌昆;郑子鹏;沈俊芳 -专利权人：天津市肿瘤医院（天津医科大学肿瘤医院）;苏州迈森致远基因科技有限公司
申请日： 2023-01-09 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明建立了一种基于靶向DNA甲基测序的头颈部原发不明转移性鳞癌原发灶溯源的探针序列组合、试剂盒、体外非诊断检测体系及其用于制备诊断产品的用途，通过对头颈部转移癌组织DNA进行相关序列位点的甲基化修饰状态检测，进而判断其原发病灶的位置。原发溯源可以细分至头颈部亚临床解剖分区：舌、舌根、口咽、下咽、喉、扁桃体、牙龈和口底等，溯源准确率高，克服了现有技术昂贵、费时、病患接受度低的缺陷，具有较高的性价比、诊断速度快、病患接受度高的优点，极具临床推广前景。
一种颈部不明转移性鳞癌原发灶溯源探针序列组合检测方法

[发明专利]低起始量血浆游离DNA甲基化建库试剂盒及方法-CN201910963720.0在审
发明人： 夏渝东;郑子鹏;沈俊芳 -专利权人：广州迈森致远基因科技有限公司
申请日： 2019-10-11 - 公布日： 2020-01-10 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种酶法甲基化建库方法，该方法通过TET酶甲基化处理，一定程度地降低甲基化建库过程中DNA的损伤，从而降低核酸样品中DNA的投入量要求；此外，进一步配合本发明的末端修复和加A反应一步试剂，能够实现一管建库，减少纯化步骤；进一步配合本发明的DNA连接酶增强液，能够提高连接效率，提高建库质量和测序质量；并且本发明方法建库起始量低，DNA投入量可低至1ng，适于包括cfDNA在内的微量建库。
建库甲基化投入量核酸样品连接效率末端修复起始量增强液测序酶法配合损伤

[发明专利]一种ctDNA低频突变测序数据分析方法和装置-CN201711427369.0有效
发明人：糜庆丰;徐发;刘宇彬;吴春求;李建文;夏渝东;黄铨飞;刘丽菲 -专利权人：东莞博奥木华基因科技有限公司
申请日： 2017-12-26 - 公布日： 2018-10-19 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：本发明公开了一种低频突变测序数据分析方法和装置。本发明方法和装置，是基于对分子标签的频数迭代收敛识别聚类中心，从而实现高效准确的聚类，经分析测试证明，该聚类策略的分析结果相比于普通的聚类模型的分析结果更加准确，能排除PCR扩增过程和测序过程中的出现的错误，进而解决测序分析结果中的背景噪音问题，提高检测的灵敏度和特异度。
方法和装置测序数据聚类突变背景噪音测序分析测序过程迭代收敛分析测试分子标签聚类模型聚类中心灵敏度频数分析检测

[发明专利]一种粪便保存液及其应用-CN201711370058.5有效
发明人：糜庆丰;黄铨飞;肖婷婷;吴春求;夏渝东;郭煜;王毅;王静;刘丽菲 -专利权人：东莞博奥木华基因科技有限公司
申请日： 2017-12-19 - 公布日： 2018-10-09 - 主分类号： C12N1/04 文献下载
摘要：本发明公开了一种粪便保存液及其应用。本发明的粪便保存液利用乙醇作为固定剂、柠檬酸钠作为固定辅助剂、EDTA‑二钠为抗凝剂、Tris‑HCl为缓冲液、NaCl为离子强度维持剂，并配方有十二烷基硫酸钠，经过合理组方，能够稳定粪便样品中微生物的数量、组成和丰度，可以保证人肠道菌群测序分析的准确性，实现粪便样本的常温保存，相对于现有的保存液，不仅保存效果好，而且不含有硫氰酸胍等有毒成分，操作更安全。
保存液粪便离子强度维持剂十二烷基硫酸钠测序分析常温保存肠道菌群粪便样本粪便样品合理组方硫氰酸胍柠檬酸钠辅助剂固定剂缓冲液抗凝剂乙醇丰度微生物应用配方保存安全

[发明专利]基于宫颈癌宿主细胞的甲基化检测方法-CN201711361831.1在审
发明人：糜庆丰;夏渝东;张小安;崔世红;刘海量;吴春求;程国梅;任琛琛;黑娜;刘丽菲 -专利权人：东莞博奥木华基因科技有限公司;郑州大学第三附属医院(河南省妇幼保健院)
申请日： 2017-12-18 - 公布日： 2018-06-01 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了基于宫颈癌宿主细胞的甲基化检测方法。在宫颈癌早筛中，宫颈脱落细胞采样量低时，提取的DNA量会出现低于100ng，甚至低于10ng的情况，达不到甲基化建库测序要求，使得难以快速再次获得的宫颈脱落细胞遭到浪费，且大大降低早筛效率。本发明方法能满足宫颈脱落细胞采样量低的要求，对DNA起始量为10ng的样本也可实现甲基化测序，并且检测准确率高，避免了低样本量的宫颈癌宿主细胞浪费。本发明方法在接头连接反应液、PCR扩增酶的优选、CT Conversion Reagent溶液处理时间上进行了创造性改进，实现了10ng灵敏度的微量甲基化建库测序。
宫颈癌宫颈脱落细胞宿主细胞甲基化检测采样量甲基化测序建库甲基化测序接头连接溶液处理灵敏度起始量样本量准确率优选样本检测改进

[发明专利]一种肠道微生物信息分析方法及系统-CN201710588863.9在审
发明人：糜庆丰;黄铨飞;夏渝东;王群 -专利权人：东莞博奥木华基因科技有限公司
申请日： 2017-07-19 - 公布日： 2017-12-12 - 主分类号： G06F19/24 文献下载
摘要：本发明公开了一种肠道微生物信息分析方法及系统，方法包括：对测序完成后的样本下机数据进行拆分和过滤，得到过滤后的样本序列；对过滤后的样本序列进行聚类比对和物种注释分类；对物种注释分类的结果进行谱分析；根据菌群功能及疾病关联数据库对谱分析的结果进行自动解读，并将自动解读的结果和谱分析的结果自动提交给可视化平台进行可视化展示和审核。系统包括拆分和过滤模块、聚类比对和分类模块、谱分析模块、自动解读与可视化展示模块。本发明具有能方便地进行流程化和批量化操作，人工解读工作量小，直观和方便的优点，可广泛应用于生物信息分析领域。
一种肠道微生物信息分析方法系统

[发明专利]羟甲基化暨甲基化长序列标签测序技术-CN201410841922.5在审
发明人：高飞;王君文;夏渝东;吉冠玉 -专利权人：深圳市易基因科技有限公司
申请日： 2014-12-30 - 公布日： 2015-04-01 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：羟甲基化暨甲基化长序列标签测序技术。本发明提供了一种检测核酸甲基化修饰和羟甲基化修饰的方法，包括如下步骤：对基因组 DNA中的5-hmC进行糖基化修饰以及对照组反应；限制性内切酶MspI酶切消化；接头A的连接；Bst DNA polymerase fragment 处理；EcoP15I或MmeI酶切；片段选择；P7接头连接；PCR扩增；PCR产物的回收；文库质控。本发明检测核酸甲基化修饰和羟甲基化修饰的方法具有如下优势：可以同时检测全基因组内几乎全部CCGG位点的不同修饰即甲基化和羟甲基化的丰度；具有高通量、高准确性并可降低实验和测序误差；不依赖于重亚硫酸盐的转换，弥补了传统甲基化检测技术中无法分辨甲基化和羟甲基化修饰的缺点。
甲基化序列标签技术

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