本发明属于生物技术领域,特别涉及番茄黄化卷叶病毒抗性基因Ty‑2的共显性SCAR分子标记的特异性引物及其应用。该抗性基因Ty‑2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明筛选出Ty‑2基因的SCAR标记,可以有效的用于Ty‑2基因的标记辅助选择,所述分子标记为番茄黄化卷叶病毒抗性基因Ty‑2的分子标记。该标记提高选择的准确性,缩短育种年限,同时也为Ty‑2基因的功能研究打下基础。
本发明提供了一种鉴别番茄叶脉性状的SNP位点、KASP分子标记及应用,SNP位点位于SEQ ID No:2 第404处,多态性为A/G,该碱基为A时,该番茄叶脉性状为暗脉;该碱基为G时,该番茄叶脉性状为明脉;利用该SNP位点,能将番茄明脉和暗脉很好地区别开。本发明涉及的番茄叶脉性状的SNP位点的KASP分子标记,采用KASP分子标记引物对番茄育种群体进行辅助选择,得到了叶脉为暗脉的番茄株系,这表明该分子标记用于番茄叶脉明暗性状的分子标记辅助选择是切实有效的,利用本发明进行分子标记辅助选择可提高选择效率,加快育种进程。
本发明涉及分子标记,具体公开了一种与番茄抗灰叶斑病基因Sm连锁的Indel标记,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明利用PCR技术对该标记进行扩增,可通过电泳检测扩增产物的片段数量和大小,判断被检番茄样品是否为抗灰叶斑病材料,进而实现对抗灰叶斑病番茄的辅助选育及快速鉴定。本发明不仅为番茄抗灰叶斑基因Sm的精细定位和分子克隆奠定了基础,同时也为利用分子标记辅助选育具有抗灰叶斑病的番茄新品种提供了高效途径。本发明基于开发的Indel标记引物提供用于辅助筛选具有灰叶斑抗性的番茄新品种的方法,可以在番茄候选材料的任何阶段对其进行灰叶斑抗性鉴定和筛选,具有高效、限制少、准确的优点。
本发明提供了一种与番茄黄化卷叶病毒Ty-2抗性基因紧密连锁的分子标记,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明筛选出与Ty-2基因连锁的SCAR标记,可以有效的用于Ty-2基因的标记辅助选择,所述分子标记与番茄黄化卷叶病毒抗性基因Ty-2的紧密连锁距离为2.2cM。以该标记为路标,可以进行Ty-2基因的精细定位或通过染色体步移法接近Ty-2基因,从而为Ty-2基因的克隆打下基础。