本发明属于分子生物学领域,公开了一种RCA‑纳米磁珠复合物及其制备与应用,该复合物是由磁珠与RCA探针结合而成,其中,磁珠包被链霉亲和素,RCA探针是以新型冠状病毒基因为模板设计的;新型冠状病毒基因其核苷酸序列的长度至少为50nt,是取自如序列SEQ ID NO.1所示的新型冠状病毒基因组中的连续片段。本发明通过以新型冠状病毒基因为模板设计RCA探针,并将磁珠与RCA探针结合得到RCA‑纳米磁珠复合物,可以明显提高较低浓度含有新型冠状病毒的样本的检测限(检测效率提高100倍),且具备准确性高、灵敏度高、操作简便和特异性强等特点。