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[发明专利]一种基因测序数据压缩和传输方法-CN201710140073.4在审
发明人：左褀洋;唐元华;徐健 -专利权人：首度生物科技（苏州）有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司
申请日： 2017-03-10 - 公布日： 2017-07-21 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：一种基因测序数据压缩和传输方法，包括以下步骤A.建立标准DNA序列数据库将标准DNA序列数据库部署到数据处理设备；C.DNA测序数据的预处理将DNA测序数据逐一与标准DNA数据库比对，生成对应关系，将标准DNA数据库编号替换DNA测序数据原文,将DNA测序数据与标准DNA数据库差异的部分单独存储；D.压缩；E.存储或传输。由于标准DNA序列数据库保存在数据处理设备中，因此，DNA测序数据中包含的大量信息可以通过标准DNA序列数据库的编号表示，因此，经过DNA测序数据的预处理步骤后的数据容量大大降低，再经过进一步压缩，容量更小，是的DNA测序数据的存储空间更小，数据传输效率更高，与第二代测序技术甚至是第三代测序技术的产出数据相匹配。
一种基因序数压缩传输方法

[发明专利]一种基因纳米锚定和微流体免疫凝集技术的宠物防诊方法-CN201710181783.1在审
发明人：不公告发明人 -专利权人：师永生
申请日： 2017-03-24 - 公布日： 2017-07-11 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明提供一种基因纳米锚定和微流体免疫凝集技术的宠物防诊方法，包括微流控芯片、光电检测器，无线传输模块,插入微电脑PCI插槽内的接口设备卡，位于微电脑内部的软件测控模块；还包括DNA样品制备模块、表面修饰配基的磁珠、DNA文库芯片，序列信号采集分析模块，数据显示模块。本发明的有益效果是，通过PCT 和 CRP 的联合应用，将比二者单独使用时应用范围更广，更便捷，诊断结果也更为准确，对细菌性感染进行全方位的诊断，利用基因测序技术对宠物的遗传性疾病和传染性疾病进行预防和诊断，可以提前对宠物进行治疗，把握好治疗时机，更好的保证宠物的健康。
一种基因纳米锚定流体免疫凝集技术宠物方法

[发明专利]基于公共子序列的基因芯片表达数据的OPSM挖掘方法-CN201410323563.4有效
发明人：廖政玲;赵洪雅;赵晓荣;周旋;李美航;朱晓晴;罗洁;罗桂银;吴笛;薛云;蔡倩华;胡晓晖;李铁臣 -专利权人：华南师范大学;深圳职业技术学院
申请日： 2014-07-08 - 公布日： 2017-07-07 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明公开了基于公共子序列的基因芯片表达数据的OPSM挖掘方法，其包括(1)输入基因芯片数据，对数据进行预处理；(2)获得基因芯片数据中任意两行之间的公共子序列；(3)生成长度为2的候选集树；(4)在长度为2的候选集树上进行剪枝操作得到2‑频繁树；(5)将2‑频繁树拼接成3‑候选集树，并经过剪枝操作得到3‑频繁树；(6)将k‑频繁树上进行拼接成k+1‑候选集树，并经过剪枝操作得到k+1‑频繁树，直到不能产生频繁树为止，最终得到所有列模式长度且满足行阈值的OPSM。该方法在前缀树存储和遍历的操作上减少了时间和空间复杂度；可以在不需要大幅增加运算时间的情况下，精确找到基因芯片数据上所有满足支持度阈值的OPSM。
基于公共序列基因芯片表达数据 opsm 挖掘方法

[发明专利]提供核苷酸序列数据的方法和测序装置-CN201280027901.9有效
发明人： P·J·范德扎格;R·安伯格;W·F·J·费尔哈格;P·拜尔莱因;R·伯特歇尔 -专利权人：皇家飞利浦有限公司
申请日： 2012-04-17 - 公布日： 2017-07-04 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：一种测序装置，产生基础核苷酸序列数据30，其包含所述测序装置10中的捕获探针的探针数据34以及由所述探针捕获的核酸片段的标识符的确定序列32。所述测序装置输出富集的核苷酸序列数据36，其用包含对所述核酸片段预期的序列38的参考的数据富集。
提供核苷酸序列数据

[发明专利]测序结果中序列数据错误的检测和校正方法-CN201510944878.5在审
发明人：黄岩谊;陈子天;周文雄 -专利权人：北京大学;赛纳生物科技(北京)有限公司
申请日： 2015-12-12 - 公布日： 2017-06-20 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明提供了一种测序结果中序列数据错误的检测和校正的方法。测序反应液中包含至少两种不同碱基的核苷酸底物分子；获得简并的基因编码信息。两个或者两个以上简并的编码信息相互对比，本领域技术人员可以判断该位置的编码是否出现相互矛盾的情况。应用本发明所述的方法进行校正，任何对于测序方法的可以降低原始测序数据错误率的微小改进，都可以明显的降低校正以后的编码数据的错误率。
结果序列数据错误检测校正方法

[发明专利]基于人类进化基因表达式编程的麦蚜数量预测方法及系统-CN201510014836.1有效
发明人：王超学;张婧菁;吴书玲 -专利权人：西安建筑科技大学
申请日： 2015-01-12 - 公布日： 2017-06-09 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明公开了基于人类进化基因表达式编程的麦蚜数量预测方法及系统，采用“去劣”操作对自然进化中产生的劣质个体或不可行个体中进行修复将其转化为可行个体，采用“增优”操作是使优质基因库中的优质基因片段在种群中得以扩散，从而有效提高了种群中个体的质量，加快了算法的收敛速度；采用种群干预，针对自然进化过程中由于种群多样性缺失导致的早熟收敛现象，通过在种群中用新的随机产生的可行个体和镜像映射产生的差异度很大的镜像个体替换掉同等数量的较差个体，以增加种群的多样性，从而有效提高算法的全局寻优能力。
基于人类进化基因表达式编程麦蚜数量预测方法系统

[发明专利]用以分析细菌菌种的测序数据的系统及其方法-CN201610083766.X在审
发明人：郑佳扬;徐仁徽;刘韦驿;蔡孟勳;卢子彬;赖亮全;庄曜宇 -专利权人：财团法人资讯工业策进会
申请日： 2016-02-06 - 公布日： 2017-05-31 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种用以分析细菌菌种的测序数据的系统及其方法。用以分析细菌菌种的测序数据的方法包含搜索第一基因样本序列中的特定变异区域以及搜索第二基因样本序列中的另一特定变异区域；判断特定变异区域与另一特定变异区域是否存在相同的一跨检体子序列；当特定变异区域与另一特定变异区域存在相同的跨检体子序列时，储存跨检体子序列至记录表中；当存在跨检体子序列时，将跨检体子序列与一数据库模块中的多个已知菌种基因序列进行比对，以分析该第一基因样本序列与第二基因样本序列中对应跨检体子序列的菌种。由此减少测序数据的系统的运算量，以达到提升分析检体数据速度的功效。
用以分析细菌菌种序数系统及其方法

[发明专利]转基因玉米检测方法及装置-CN201710062751.X在审
发明人：彭城;徐俊锋;徐晓丽;陈笑芸;汪小福;魏巍 -专利权人：浙江省农业科学院
申请日： 2017-01-24 - 公布日： 2017-05-31 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明提供了一种转基因玉米检测方法及装置，涉及转基因植物检测的技术领域，该方法包括采集待检测样本的第一红外光谱数据，所述待检测样本包括玉米植株的任一部分；对所述第一红外光谱数据进行去噪处理；根据去噪处理后的所述第一红外光谱数据和预先建立的判别模型，确定所述待检测样本是否为转基因玉米。本发明提供的转基因玉米检测方法及装置，可以解决现有的转基因玉米检测方法会损坏待检测玉米的原有表观性状，使得待检测玉米难以进一步用于育种研究的技术问题。
转基因玉米检测方法装置

[发明专利]一种用于检测血液病相关体细胞突变的装置-CN201710067161.6在审
发明人：陈玥茏;侯光远;李停;方真;刘伟;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 -专利权人：安诺优达基因科技（北京）有限公司
申请日： 2017-02-07 - 公布日： 2017-05-31 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种用于检测血液病相关体细胞突变的装置，其包括数据获取模块、突变频率统计模块、对比模块、判定模块以及检测结果输出模块。本发明的用于检测体细胞突变的装置能够更准确地将系统错误与真实的体细胞突变进行区分，不仅提高了灵敏度，而且降低了假阳性与假阴性。
一种用于检测血液病相关体细胞突变装置

[发明专利]一种限制型心肌病基因数据处理装置-CN201710064524.0在审
发明人：不公告发明人 -专利权人：上海喆之信息科技有限公司
申请日： 2017-02-04 - 公布日： 2017-05-24 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明具体公开了一种限制型心肌病基因数据处理装置，包括基础数据获取模块、分析模块、算法建立模块、初筛选模块、重筛选模块和分析鉴定模块。本发明可以根据筛选得到的共表达基因对数据，进行生物功能及生物网络分析，以便于获取心肌病生物标志物，用于识别非心肌病患者、缺血性心肌病患者以及特发性心肌病患者，并研究缺血性心肌病患者和特发性心肌病患者的发病机理。本发明在共表达基因对数据中，获取包括关于生物代谢过程的基因数据的共表达基因对数据，确定共表达基因对数据为心肌病生物标志物，可以提高心肌病患者的识别精准度。
一种限制心肌基因数据处理装置

[发明专利]一种物种特异性内源性条形码的搜索方法及其在多样本混合测序中的应用-CN201510070781.6有效
发明人：孙啸;李成;涂景;束传军 -专利权人：东南大学
申请日： 2015-02-10 - 公布日： 2017-05-24 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种物种特异性内源性条形码的搜索方法及其在多样本混合测序中的应用。该搜索方法包括确定、搜集、比对候选基因组序列、计算当前滑动窗口内序列的变异度和窗口两侧序列的保守度、以及根据滑动窗口扫描计算结果，从而确定内源性条形码的步骤。确定内源性条形码后，利用重叠延伸PCR技术扩增并连接内源性条形码和待测目标序列，上机测序，然后通过内源性条形码特征判断测序片段的样本来源。与现有的体外合成的外源性条形码标记样本相比，内源性条形码不用人工合成DNA，并且可实现多个样本一步反应内同时扩增并连接各自条形码和待测目标序列，简化了先提取待测目标序列、再逐个连接体外合成条形码的实验过程，从而降低测序成本。
一种物种特异性内源条形码搜索方法及其多样混合中的应用

[发明专利]一种基因表达缺失数据的填补方法-CN201410519632.9有效
发明人：李天瑞;余增;景运革 -专利权人：西南交通大学
申请日： 2014-09-30 - 公布日： 2017-05-17 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基因表达缺失数据的填补方法，包括如下步骤首先对于给定的目标基因，选取与目标基因最相似的k个近邻基因；其次利用选出的k个近邻基因构建相应的目标函数，并采用最小二乘准则和拉格朗日方法迭代地求解回归系数矩阵和对角权重矩阵；再根据不同的回归情况，分别采用不同的填补公式对缺失数据进行填补；最后利用一个不确定性度量对本发明提出的方法进行循环迭代，直到缺失值不再变化。本发明有效地解决了基因表达缺失数据的填补问题，使得对基因表达数据分析的结果更为可靠，为后续的基因表达数据分析提供更为有利的数据支持。
一种基因表达缺失数据填补方法

[发明专利]一种微生物的检测识别方法和系统-CN201611213197.2在审
发明人：刘恩浩 -专利权人：基努里（天津）生物科技有限公司
申请日： 2016-12-23 - 公布日： 2017-05-10 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明适用于生物工程领域，提供了一种微生物的检测识别方法和系统，所述方法包括下述步骤采用高通量的测序技术对从环境样本中提的DNA进行测序，得到DNA标签序列；去除所述DNA标签序列中存在的载体污染；将所述DNA标签序列与已知数据库中的已知序列进行比对，并根据比对结果确定所述DNA标签序列的所属分类。本发明实施例可以检测到环境样本中可能存在哪些微生物物种或哪一类微生物物种。
一种微生物检测识别方法系统

[发明专利]一种全局最优化DNA计算序列编码方法-CN201310034671.5有效
发明人：张凯;许进;胡威;石晓龙;潘林强;张晓龙;符海东;强小利;石心竹;贾峤 -专利权人：武汉科技大学
申请日： 2013-01-22 - 公布日： 2017-04-26 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明提供一种全局最优化DNA计算序列编码方法，包括步骤1，利用剪枝策略搜索4n个DNA分子解空间；步骤2，将一个或者多个DNA计算的生物约束转换为对应的数学约束；步骤3，将该数学约束应用到该DNA分子解空间，产生适用于DNA计算的单链DNA序列集合。
一种全局优化 dna 计算序列编码方法

[发明专利]一种DNA序列模式的构建方法-CN201310358216.0有效
发明人：倪莉;黄志清;郑蓉;林江宏 -专利权人：福州大学
申请日： 2013-08-17 - 公布日： 2017-04-12 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：本发明涉及生物群体中特定DNA序列的表示方法，特别是一种DNA序列模式的构建方法，该方法对于特定的DNA序列，将研究涉及的生物种属或类群所有该DNA序列按照碱基兼并表示规则合并成一条DNA序列模式，这种合并可以在种、属或其它分类单位水平上进行的，也可以是针对特定的生物类群来进行的。该方法构建的DNA序列模式可以直观地展现出研究体系中生物种属或类群的序列特征，从而有利于生物群体特性的分析和研究。
一种 dna 序列模式构建方法